RNA测序的变革：Oxford Nanopore推出新型cDNA测序试剂盒

新一代直接cDNA测序试剂盒与PCR-cDNA 109测序试剂盒提供高产量全长cDNA转录本

Oxford Nanopore为实时、可扩展的测序技术推出了新的“109” cDNA 测序试剂盒。新的测序试剂盒可提供高通量，同时生成全长cDNA链的完整序列，可选择仅需1ng PolyA+ RNA的低起始量。

新的cDNA测序方法让用户可以在单个MinION芯片上（1000 – 1500万条读长 x 全长转录本）进行高覆盖度的完整全转录组测序，或是在Flongle上进行更小型的快速筛查。这将在多种应用中促进新的生物学见解。

可用于科研、健康医疗和产业界的全长、良好表征的cDNA转录本

Oxford Nanopore的新型长读长cDNA测序解决方案让研究人员可在单条读长的级别对数百万全转录本进行从头至尾的测序。这使得用户能够同时准确进行异构体水平的转录组表征和差异基因表达谱分析，而无需在其他短读长或长读长测序平台上实现此目的所需的成本、定量、计算或工作流程复杂性方面的任何妥协。

深入了解转录组的动态对于帮助众多领域的研究人员了解如何在特定时刻解读生物体的稳定DNA“代码”至关重要。在医疗保健中，鉴别差异性剪接的异构体和融合转录物可以为疾病诊断和治疗提供信息。 RNA测序为病毒识别提供了一种快速有效的方法，并可应用在环境和农业科学中。

“

"我们正在研究癌症中选择性基因异构体和融合基因的识别，而可以生成覆盖整条RNA的读长能够引起很大的不同。有了Nanopore长读长cDNA测序试剂盒，我们更为详细地了解到都有哪些转录本被生成。"

Jonathan Gӧke  新加坡基因组研究院

”

对于使用PCR-cDNA试剂盒来研究发育中的橄榄蝇胚胎转录组:

“

“Nanopore cDNA测序试剂盒为我们提供了快速的工作流程，可定量的全长转录本，由于不需要对短读长数据中难以确定的全长分辨率的基因进行复杂的统计考虑，还简化了我们的数据分析。”

Anthony Bayega  

麦吉尔大学（McGill University）

”

选择直接cDNA测序和PCR-cDNA测序

现有的两种新试剂盒是直接cDNA（SQK-DCS109）和PCR-cDNA（SQK-PCS109）测序试剂盒。结合对Oxford Nanopore测序平台和软件的升级，纳米孔cDNA测序提供了有效的全长转录本富集（PCR-cDNA）。

在使用直接cDNA试剂盒时，无需进行PCR，从而可以去除偏差，而PCR-cDNA试剂盒能够从低起始量RNA（仅1 ng PolyA + RNA）中获得高通量，并提供选择使用总RNA作为起始材料。这些试剂盒所需的样品制备时间总共不到5小时，其中一小部分为实际上手操作时间。

新的cDNA测序试剂盒可在Oxford Nanopore的所有设备上使用，从口袋大小的MinION、到台式GridION以及高通量PromethION都适用。这让各种规模的用户都能生成非常高产量的转录组数据，可用于高解析新异构体发现、低拷贝数转录本识别，以及高覆盖度的全转录组从头测序。像Flongle这样的小型、快速测序设备用来针对特定转录本进行靶向cDNA测序也很理想。

这允许任何规模的用户都能生成非常高产量的转录组数据，用于新型异构体的高分辨率发掘，鉴定低拷贝数转录物，以及高覆盖度对完整转录组进行从头测序。像Flongle这样的小型快速设备也是对特定转录物进行靶向cDNA测序的理想选择。

除了cDNA测序，Oxford Nanopore提供唯一的直接RNA分析试剂盒，让用户能够在不需要转换成cDNA的情况下直接测序RNA。

试剂盒现在可以通过Oxford Nanopore的中国商店购买（点击“阅读原文”）。

延伸阅读

Oxford Nanopore的产品现已接受网上订购，请打开“阅读原文”或者浏览以下网址：

https://store.nanoporetech.com/cn

如欲了解更多产品信息，请长按二维码关注我们。

媒体查询，请通过以下电邮及微信联络我们的团队:  

[e-mail]或加微信ID: NanoporeMedia或tbray91ONT (Thomas)