新发布 | “Field Kit” 无冷链运输和储存的测序制备试剂盒
强大的便携式测序仪MinION，已经被科学家们带到了世界的各个角落，在尼日利亚用来监测意外激增的拉沙热疫情，随南方科技大学的夏雨教授课题组来到海拔4000米的祁连山进行高海拔冻土微生物群系野外调研, 在挪威和北极之间的冰川中实现宏基因组测序，甚至跟随美国宇航员登上太空宇宙空间站进行直接RNA测序。
我们的目标是使任何人、在任何环境下能够对任何生物进行分析。
作为实现这个目标的过程中的一部分，无论是在实验室内还是在现场，我们希望能够更轻松地向任何地点运送试剂耗材并进行实验。
我们正在寻求打破长久以来生命科学对冷链的依赖。对冷链的需求往往使得试剂耗材难以运输到偏远地区，或者使得在专业实验室环境之外使用测序技术更加困难。我们现在发布了新的“Field Kit” (野外测序试剂盒)，只需十分钟即可从基因组DNA中制备文库。该套装不需要冷包装运输，也不需要在一个月内使用。它含有冻干的测序化学试剂，并且需要用来制备文库的实验室设备极少，已经有用户喝着一杯热咖啡用移液管成功制备了样品。
在未开封的情况下，该试剂盒可在最高30°C下储存长达一个月，或在未开封的情况下在2-8°C下储存三个月，并与新发布和改进的MinION测序芯片包装相匹配。
从格陵兰岛和冰岛长期覆盖陆地的大冰原到丛林，野外工具包已经在极端环境中得到了测试。当我们开发能够成功应用与这些具有挑战性的地方的工具包时，我们相信我们可以开辟超越传统实验室以外的测序机遇。
冰岛的环境测试
来自乔治城大学的Sarah Johnson和她的团队，在冰岛偏远且迷人的凯尔灵加山（Kerlingarfjöll）使用了Field Kit。在那里，他们使用纳米孔技术来识别冰川土壤和水样中存在的细菌。在样品处理后仅30分钟内，她的团队就能够获得来自MinION测序仪提供的实时测序信息：
我们终于能够在现场见证，从原始样本到分析数据的整个过程在我们面前的展现，一次性完成。看到我们所有的努力最终汇集在一起，并向我们提供有关我们样本的信息，以及在这个领域可能进行的实验，非常令人兴奋和满足。
”完整信息来自Sarah Johnson实验室博客。链接详见文章底部。
格陵兰冰原上的微生物多样性
图片来源于博客PSYCHROPATHS: Subzero Sequencing。链接详见文章底部。
在格陵兰冰原上一个偏远的冰营中，Arwyn Edwards和他同事体验了在零下30°C测试Field Kit(野外试剂盒)来鉴定微生物群落。
格陵兰冰原的罗素冰川出口。罗素集水区内大约20万平方公里的冰汇入这里，它是海平面上升最大也是最重要的贡献因素。在冬季，在这一出口点30公里的内陆工作，意味着在每天都在崇高和暴力之间徘徊的环境中对DNA进行测序。
Arwyn的团队使用了能够在-29°C下仍保持良好运行的先进的笔记本电脑，并将纳米孔测序芯片放置在胸袋中保持适宜的温度，成功地对宏基因组文库进行DNA提取和MinION测序。
来源于博客PSYCHROPATHS: Subzero Sequencing。
生物多样性热点地区的物种分析
维罗纳大学的Massimo Delledonne和他在Taxon Expeditions（@Taxonexped）的合作者使用了Field Kit（野外试剂盒）进行科学考察，寻求发现新物种并了解各种环境中野生动物的进化和多样性。在将一种新的水甲虫以莱昂纳多·迪卡普里奥命名后，Taxon访问了生物多样性热点地区，如婆罗洲、黑山和刚果，并于2018年9月最后一次前往婆罗洲时使用了Field Kit（野外试剂盒）。早在2015年，他们便与Muse博物馆一起首次使用MinION进行了现场测序。2016年，Taxon作为第一批使用纳米孔技术的团体鉴定出了一种新的野生青蛙，他们还在2017年测试了Oxford Nanopore的自动文库制备装置VolTRAX。
我们将继续开发一系列的解决方案，以便让每位研究者能够更广泛地使用Oxford Nanopore的测序技术。这些包括使用VolTRAX进行自动化的样品制备，使用最小型测序设备Flongle进行快速低成本的测试，使用便携式分析仪MinIT实现快速的结果分析，以及即将推出的集成了屏幕、计算和MinION / Flongle的Minion Mk1C。
Minion Mk1C即将在今年第三季度推出，现已开通提前预定，敬请关注！
了解更多纳米孔测序当前全套系列产品，请观看下面视频：
资料来源:
冰岛环境测序
http://www.johnsonbiosignatureslab.com/category/iceland18/
格陵兰冰原上的微生物多样性
https://psychropaths.wordpress.com/2018/10/13/subzero-sequencing/
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