你问我答 | 杨俊副研究员聊多倍体植物纳米孔测序

在观看完杨俊老师介绍的多倍体植物纳米孔测序的案例讲座后，为大家带来杨老师幽默风趣的问答采访内容。

采访人：杨俊博士

自我介绍：年近不惑科研男一枚

研究方向：植物基因组进化

Q1 是什么激发了您对植物研究的兴趣？

我父亲特别讨厌山芋，我妹妹特别喜欢山芋。为什么？

Q2 已知的地球植物种类有40万种，然而目前却仅仅只有大约225种植物基因组被测序。在植物测序中都存在着哪些挑战？

感觉不止225种了，还有很多基因组停留在个别实验室里没有释放出来吧。长读长技术克服了重复序列的障碍后，就只剩下大基因组的难题了，郁金香基因组会是一个里程碑，日本重楼后基因组草图将不再有挑战，目前的挑战需要更多算法上的创新或者单纯算力上的大幅提升。

Q3 长读长测序技术都给您的领域带来了怎样的变化和影响？

测序不再是耗费数月或数年的巨大工程了，可以让我们的研究更加专注于生物学问题本身。相信未来的研究，基因组只是起点，不是目标。

Q4 您选择纳米孔长读长测序的原因是什么？目前在使用哪一款Nanopore测序仪？

直接原因：让解析基因组更加容易。其他原因：获得更直接的单倍型以及碱基修饰信息，技术本身还有很大的提升空间。目前在用MinION或GridION X5，主要是后者。

Q5 您认为新兴的纳米孔测序技术为您个人的研究带来了哪些优势？在发表前沿的科学研究论文都有哪些机遇？

优势是节约了时间，赢得时间就是赢得机遇。

Q6 您使用纳米孔测序都取得哪些研究成果和进展?

在多倍体基因组分型方面，纳米孔技术帮助我们更快构建算法和完成目标。

Q7 您对想要开始、或者刚刚开始使用纳米孔测序的科学家们有些什么好的建议？

加入社区！关注更新！大胆尝试！

Q8 更深入的理解植物的基因组将会为我们带来哪些积极的影响？

首先可以帮助我们解决更多人吃饭的问题，尤其是那些还未到来之人。其次是提供人们喜爱的食物，和我父亲一样不爱吃山芋的人可以不用非吃山芋不可。还可以提供更多的可感知多样性，愉悦人们的心情。

Q9 您的下一步研究计划是什么？

和全球科学家一起完成旋花科植物的基因组计划。

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