【即将截止】7月29日&30日| Nanopore上海初级实验和数据分析培训班
Oxford Nanopore Technologies 于7月29&30日在上海举办两场的培训班,通过纳米孔测序演示和快速测序标准实验,使每位参训人员获得上手体验MinION/GridION的机会。有兴趣参加还未注册的小伙伴们赶紧报名参与这次MinION/GridION的上手体验吧!
报名方式
扫描下方二维码登记或前往https://nanopore.yilimart.com/Group/Service/注册
报名截止日期:2019年7月22日
培训地点:上海市碧波路250号一号楼三楼(国家人类基因组南方研究中心)
本次培训班旨在帮助参与的科研工作者们更好的使用纳米孔测序,增强基础培训,以获得更好的实验结果。根据课程选择,培训班将会介绍并演示纳米孔测序,进行测序运行体验,讨论相关的案例研究,以及全面的初级数据分析培训。
初级实验培训班
包含以下内容:
纳米孔长读长高通量测序的理论知识
实例应用案例分析解读
分组文库制备
文库上样练习
运行MinION/GridION
碱基识别软件与EPI2ME分析工作流程入门
初级数据分析培训
包含以下内容:
指令行的要点
使用Guppy软件进行碱基识别
探索经碱基识别后的读长长度和质量得分分布,并根据这些指标进行读长筛选
将筛选的读长比对到参考基因组
使用Tablet可视化比对
使用WUB生成比对统计信息
使用Pomoxis(Miniasm和Racon)进行从头组装
使用QUAST评估组装质量
使用Nanopolish进行组装错误校正
使用mummber(dnadiff)比较纠错后的组装质量
使用Nanopolish检测甲基化碱基
日程
安排
【初级实验培训班】
时间 | 活动 | |
上午 | 09:30 - 10:30 | 纳米孔测序介绍 |
10:30 - 10:45 | 茶歇 | |
10:45 - 12:00 | 实验计划指导 (试剂盒选用 & 实际案例) | |
12:00 - 13:30 | 午餐及答疑 (包含) | |
下午 | 13:30 - 14:30 | 测序芯片上样练习 & 现场演示 |
14:30 - 14:45 | 茶歇 | |
14:45 - 16:00 | 在实验室进行快速测序实验 | |
16:00 - 17:00 | 设备控制软件MinKNOW & 数据分析软件EPI2ME介绍 |
【初级数据分析培训】
时间 | 活动 | |
上午 | 09:30 - 10:30 | 纳米孔测序介绍 |
10:30 - 10:45 | 茶歇 | |
10:45 - 12:00 | 全面的基础数据分析和软件培训 | |
12:00 - 13:30 | 午餐(包含) | |
下午 | 13:30 - 17:00 | 全面的基础数据分析和软件培训 |
我们的目标:
使任何人,在任何地点,
能对任何生物进行分析。
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