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【即将截止】7月29日&30日| Nanopore上海初级实验和数据分析培训班

中国市场部 OxfordNanopore 2019-12-12



Oxford Nanopore Technologies 于7月29&30日在上海举办两场的培训班,通过纳米孔测序演示和快速测序标准实验,使每位参训人员获得上手体验MinION/GridION的机会。有兴趣参加还未注册的小伙伴们赶紧报名参与这次MinION/GridION的上手体验吧!


  • 报名方式


扫描下方二维码登记或前往https://nanopore.yilimart.com/Group/Service/注册



  • 报名截止日期:2019年7月22日


  • 培训地点:上海市碧波路250号一号楼三楼(国家人类基因组南方研究中心)


本次培训班旨在帮助参与的科研工作者们更好的使用纳米孔测序,增强基础培训,以获得更好的实验结果。根据课程选择,培训班将会介绍并演示纳米孔测序,进行测序运行体验,讨论相关的案例研究,以及全面的初级数据分析培训。



初级实验培训班

      包含以下内容:

  • 纳米孔长读长高通量测序的理论知识

  • 实例应用案例分析解读

  • 分组文库制备

  • 文库上样练习

  • 运行MinION/GridION

  • 碱基识别软件与EPI2ME分析工作流程入门


     初级数据分析培训

包含以下内容:            

  • 指令行的要点

  • 使用Guppy软件进行碱基识别

  • 探索经碱基识别后的读长长度和质量得分分布,并根据这些指标进行读长筛选

  • 将筛选的读长比对到参考基因组

  • 使用Tablet可视化比对

  • 使用WUB生成比对统计信息

  • 使用Pomoxis(Miniasm和Racon)进行从头组装

  • 使用QUAST评估组装质量

  • 使用Nanopolish进行组装错误校正

  • 使用mummber(dnadiff)比较纠错后的组装质量

  • 使用Nanopolish检测甲基化碱基


日程

安排


【初级实验培训班】

时间

活动

上午

09:30 - 10:30

纳米孔测序介绍

10:30 - 10:45

茶歇

10:45 - 12:00

实验计划指导

 (试剂盒选用 & 实际案例)

12:00 - 13:30

午餐及答疑 (包含)

下午

13:30 - 14:30

测序芯片上样练习 & 现场演示

14:30 - 14:45

茶歇

14:45 - 16:00

在实验室进行快速测序实验

16:00 - 17:00

设备控制软件MinKNOW & 数据分析软件EPI2ME介绍


【初级数据分析培训】

时间

活动

上午

09:30 - 10:30

纳米孔测序介绍

10:30 - 10:45

茶歇

10:45 - 12:00

全面的基础数据分析和软件培训

12:00 - 13:30

午餐(包含)

下午

13:30 - 17:00

全面的基础数据分析和软件培训


我们的目标:

使任何人,在任何地点,

能对任何生物进行分析。


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