Nanopore Tech Tour 2019 都有哪些大咖荟聚

Dan Turner, Oxford Nanopore Technologies

Dan是应用部门的副总裁，同时也是一位经验丰富的科学家，在过去的11年里一直从事新一代测序领域的工作。他所领导的小组旨在将样品制备技术，基因组学应用和生物信息学整合在一起，以扩展纳米孔技术设备的实用性，向更广泛的世界展示这些技术的优势。在加入Oxford Nanopore Technologies之前，Dan曾担任Wellcome Trust Sanger Institute的测序技术开发主管。

Yutaka Suzuki教授, 日本东京大学

Yutaka Suzuki教授研究兴趣主要集中于癌症研究和感染性疾病。Yutaka是最早开始使用纳米孔测序的学者之一，参与发表了多篇纳米孔测序研究论文，具有丰富的MinION和PromethION测序仪使用经验。今年发表的文章有：

Long read sequencing reveals a novel class of structural aberrations in cancers: identification and characterization of cancerous local amplifications

2019.04. BioRxiv. doi: https://doi.org/10.1101/620047

Evaluation and application of RNA-Seq by MinION

2019.02. DNA Research. doi: 10.1093/dnares/dsy038

Field diagnosis and genotyping of chikungunya virus using a dried reverse transcription loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay and MinION sequencing

2019.06. PLOS Neglected Tropical Disease

On-Site MinION Sequencing

2019.04. Adv Exp Med Biol. doi: 10.1007/978-981-13-6037-4_10

Nanopore sequencing of drug-resistance-associated genes in malaria parasites, Plasmodium falciparum

2018.05. Scientific reports. doi: 10.1038/s41598-018-26334-3

NanoPipe - a web server for nanopore MinION sequencing data analysis

2019.02. Gigascience. doi: 10.1093/gigascience/giy169

Expansions of intronic TTTCA and TTTTA repeats in benign adult familial myoclonic epilepsy

2018.04. Nature Genetics. doi: 10.1038/s41588-018-0067-2

Jonathan Goeke, 新加坡基因研究所

Jonathan是新加坡基因组研究所和新加坡国家癌症中心的首席研究员。研究方向包括第三代测序的转录组学、选择性剪接、lncRNA和癌症基因组学。他对Oxford Nanopore的多个直接测序RNA和cDNA试剂盒进行过评估工作。Johnathan曾就读于德国柏林马克斯普朗克分子遗传学研究所和美国斯坦福大学。

夏雨教授, 南方科技大学

夏雨教授毕业于香港大学张彤教授课题组，现任南方科技大学的助理教授，同时在使用MinION和GridION测序仪。她的研究兴趣集中在环境微生物组学，利用新一代纳米孔测序来了解微生物群系变化的生态学效应。夏雨教授在多个国际期刊上发表24篇论文，近期文献发表包括利用纳米孔测序技术对污水厂进水中大肠肝菌群抗性基因组的全谱表征及ARGs传播机理鉴定 (Frontiers in Microbiology)。

夏雨教授早在2014年早期试用阶段便开始使用纳米孔测序技术，她利用MinION自制便携式移动测序箱，带领课题组登上海拔4000米的青海祁连山进行高海拔冻土微生物群调研。还曾举办自己的纳米孔测序微生物专题研讨会，指导参会者进行测序芯片上样和生物信息学分析。

参与发表的纳米孔测序研究论文:

Mobile antibiotic resistome in wastewater treatment plants revealed by Nanopore metagenomic sequencing

2019.03 Microbiome doi: 10.1186/s40168-019-0663-0

MinION Nanopore Sequencing Enables Correlation between Resistome Phenotype and Genotype of Coliform Bacteria in Municipal Sewage

2017.10. Frontiers in Microbiology doi: 10.3389/fmicb.2017.02105

区骏恒博士Chun Hang Au研究主任, 香港养和医院

区骏恒博士是香港疗养院和医院（HKSH）的研究员，在高通量测序实验和生物信息学方面拥有超过14年的丰富经验。他一直将NGS和最近的纳米孔测序用于HKSH分子病理学实验室的临床分子诊断用途。他在血液癌症中检测可成药FLT3 indels的工作被引用作为AMP / CAP NGS生物信息学管道指南的一个例子。

他拥有香港中文大学微生物基因组学博士学位，在科学转化医学、血癌学期刊和ISME期刊等期刊上发表了25篇同行评审论文，并且是ITDseek、INDELseek和BAMClipper等临床级生物信息学工具的开发者。

Martin Frith 教授, 日本产业技术综合研究所 (AIST) & 东京大学

Martin是AIST人工智能研究中心担任研究员，并在东京大学计算生物学和医学科学系担任教授。主要研究兴趣集中于分析遗传序列的编码信息以及它们在疾病中的作用。Martin在波士顿大学完成生物信息学博士学位，曾在北京教授英文，在期间习得普通话。他与Yutaka教授合作发表了多篇纳米孔测序的文章。

Tandem-genotypes: robust detection of tandem repeat expansions from long DNA reads

2019.03. Genome Biology doi: 10.1186/s13059-019-1667-6

稍后将会带来更多的演讲嘉宾信息，敬请关注！

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