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酵母双杂交、单杂交、三杂交实验用培养基汇总说明,不再傻傻分不清!

Coolaber 2023-03-29


一、Rich media(完全培养基)

YPD系列培养基属于Rich media,也可以称为完全培养基。YPD Medium由蛋白胨、酵母提取物和葡萄糖按适当比例混合组成;YPDA培养基是在YPD培养基中添加了适量的硫酸腺嘌呤,硫酸腺嘌呤可以防止含有ADE1和ADE2突变等位基因的酵母菌株(如Y2HGold、AH109和Y187)在长期培养后变成粉红色或红色。YPD Agar、YPDA Agar分别在YPD、YPDA基础上加入了Agar,作为固体培养基倒板用。YPD系列培养基用于酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的常规培养。

二、Minimal media(不完全培养基)

SD(synthetically defined)系列培养基属于Minimal media,也可以称为不完全培养基。Minimal SD Base由硫酸铵、微量元素、葡萄糖按比例混合而成,可以提供野生型酵母菌维持生存所需的基本物质,但不包含突变菌株必需的氨基酸。Minimal SD Agar Base在前者基础上加入Agar。Minimal SD Base Gal/Raf由硫酸铵、微量元素、半乳糖及棉子糖混合而成;Minimal SD Base Gal由硫酸铵、微量元素、半乳糖混合而成;Minimal SD Base Raf 由硫酸铵、微量元素、棉子糖混合而成,对应的固体培养基均在其基础上加入Agar。缺陷型氨基酸混合物添加到Minimal SD Base中可以配制成筛选培养基,用于选择培养含有特异载体的酵母或进行杂交筛选。

三、缺陷型氨基酸混合物

DO Supplement 亦即Dropout Supplement,缺陷型氨基酸混合物(包含核苷酸),将这些混合物添加到Minimal SD Base中配制成组分明确的筛选培养基。每种缺陷混合物中缺失特定的氨基酸,如DO supplement -Leu含有除亮氨酸外的各种必需氨基酸。DO Supplements也可以添加到 minimal E. coli medium M9中组成E. coli的筛选培养基。用于酵母双杂交和酵母单杂交筛选营养缺陷型表型的酵母转化株,以及用于含有特异载体酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的批量培养。


四、筛选培养基

1、SD+缺陷型氨基酸混合物

SD+缺陷型氨基酸混合物是由Minimal SD Base与缺陷型氨基酸混合物混合而成,如SD/-His Broth即Minimal SD Base混合了DO Supplement-His。用做筛选培养基,用于选择培养含有特异载体的酵母或进行杂交筛选。又如,SD/-Leu Broth,SD/-Trp Broth分别用于筛选bait和prey载体(bait和prey载体带有合成色氨酸和亮氨酸的基因)。携带这两个载体的酵母细胞可以在双缺筛选培养基SD/-Leu/-Trp生长,而不含有这两个基因的亲代酵母菌株(如Y2H Gold)不能生长。

2、SD+缺陷型氨基酸混合物+Agar

SD+缺陷型氨基酸混合物+Agar是由Minimal SD Agar Base与缺陷氨基酸混合物混合而成,如SD/-His with Agar即Minimal SD Agar Base混合了DO Supplement-His。用做固体筛选培养基,用于选择培养含有特异载体的酵母或进行杂交筛选。

3、SC+缺陷型氨基酸混合物

SC培养基是不含葡萄糖等碳源的Minimal SD Base,亦即不含碳源和氨基酸的酵母氮源培养基,含有硫酸铵和微量元素等。SC+缺陷型氨基酸混合物,就是不含碳源的筛选培养基,对于有特殊要求的实验,碳源需要单独过滤除菌再加入灭菌后的SC+缺陷型氨基酸混合物中。葡萄糖高温灭菌会有碳化现象,培养基变黄棕色,严重碳化甚至变成黑色。控制好灭菌温度和时间会降低碳化,葡萄糖的微量碳化对实验影响并不大。没有特别要求一般建议用SD+缺陷型氨基酸混合物。


五、YPD Plus Liquid Medium(YT0004)

用LiAc转化法进行酵母转化时,会通过使用Carrier DNA,选用对数期的酵母菌,优化质粒DNA的质量和浓度等方法来提高转化效率。YPD Plus用于转化后复苏酵母菌,可以有效提高转化效率50-100%。



培养基具体使用方法参见www.coolaber.com网站,或关注Coolaber公众号。



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