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人类微生物组项目HMP是怎么取粪便样品的?

2017-10-30 锐翌基因 宏基因组

本文转自“锐翌基因 ”公众号,己获授权。

自从人类微生物组计划(HMP)开展以来,人类健康与肠道微生态研究持续升温,引无数英雄竞折腰,纷纷加入肠道菌群研究大军。

 

那么,问题来了:粪便样本该怎么取呢?相关的文章很多,但取样方法都写得很简单,很多细节处理起来心里都没底,怎么办!




不用担心,小锐将人类微生物组计划(HMP)和国际人类微生物组标准(IHMS)的取样方法进行了梳理和整合,给大家奉上史上最详细、最权威的的粪便取样方法。




方法

适用情景:取样4 h内可运输回实验室


1

准备所需器材


2

贴标签,标注信息

将标签纸③贴在带勺粪便采集管②(若粪便采集管自带标签可不用再贴)及自封袋④上。在所有标签上注明取样对象信息(姓名、样本编号、样本类型、取样时间等)。

温馨tips:用透明胶带在粪便采集管标签上至少缠绕一圈,并在管盖上标识名称,更加保险。


3

收集粪便样品

将粪便样本收集系统①置于马桶上,放下马桶座圈,排便,再将手洗干净。

温馨tips:尽量在收集粪便样本前将尿液排尽,再将手洗干净。


省钱tips:可以在盒子上套袋,多次使用。


4

取样

将粪便样本收集系统①的盒子拿出,用勺子②截取粪便中段内部一勺(约1 g,勺子不要装得过分满)。


5

装样

将勺子垂直放入粪便采集管②,拧紧盖子。


6

重复取样

一式三份,重复步骤4~5。


7

寄送样品

将粪便采集管②放入自封袋④中,需在4 h内寄送回实验室进行抽提或-80 ℃保藏。

运输、保存常见问题

解决方法

是否需要液氮速冻?

液氮速冻后,能立即放入冰箱或置于冰盒、干冰上,防止反复冻融的前提下,可以用液氮速冻。

若4 h内无法运送回实验室,该如何操作?

液氮速冻后或直接置于干冰上运输。

其他注意点?

无论采取何种方式取样、运输、保存,同一研究所有样本的采样、运输、保存方式需保存一致。




方法

适用情景:受试者自己在家取样;或取样后24小时内无法送到实验室且无法干冰寄送


1

准备所需器材


2

贴标签,标注信息

将标签纸⑤贴在带勺粪便采集管②(若粪便采集管自带标签可不用再贴)、运输保护管④及自封袋⑥上。在所有标签上注明取样对象信息(姓名、样本编号、样本类型、取样时间等)。

温馨tips:用透明胶带在粪便采集管标签上至少缠绕一圈,并在管盖上标识名称,更加保险。


3

收集粪便样品

将粪便样本收集系统①置于马桶上,放下马桶座圈,排便,再将手洗干净。

温馨tips:尽量在收集粪便样本前将尿液排尽,再将手洗干净。


省钱tips:可以在盒子上套袋,多次使用。


4

添加保护剂

将粪便采集管②垂直插入运输保护盖④中,打开粪便采集管②,倒入保护剂③。


5

取样

将粪便样本收集系统①的盒子拿出,用勺子②截取粪便中段内部一勺(约1 g,勺子不要装得过分满)。


6

装样

将勺子垂直放入粪便采集管②,保护剂③需没过粪便样本(勺子可剪断,没入保护剂中),拧紧盖子。


7

重复取样

一式二份,重复步骤4~6。


8

竖直静置,使样本和保护剂充分接触

粪便采集管②在室温下,竖直放置至少1 h(使粪便样本在保护剂至少放置1 h)。


9

寄送样本

将粪便采集管②塞入运输保护管④中,放入自封袋⑥,需在7天内寄送回实验室进行DNA抽提。


好嘞,

关于粪便的取样方法和注意事项,

就先讲到这儿喽。


肿么样

是不是收获满满?

那就赶紧撸起袖子,加入肠道菌群研究大军吧!


供稿:巫萍

编辑:王丽燕


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