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多动态模型揭示了时变静息功能磁共振成像的强相关性

社区创作团队 脑机接口社区 2023-02-08

大脑功能网络的活动是时变认知和行为的基础。研究证实,静息功能磁共振成像中的时变相关性(即功能连通性)可以预测行为特征、精神疾病和神经系统疾病。本文提出了一种研究方法,将平均大脑活动和功能连接(FC)的变化建模为能够在不同的时间相互发生。本文将这种方法称为多动态对抗生成器-编码器(MAGE)模型,在fMRI数据上使用生成对抗网络的原理进行评估,并可以捕获时间依赖性的网络动态模型。


 1   MAGE模型的生成


本文提出的解耦平均活动和FC的方法称为多动态对抗生成器-编码器(MAGE)。提出了一种允许平均活动和FC在时间上相互独立地波动多动态建模方法。


本文提出的方法假设fMRI数据是由一个多元正态分布过程产生的,具有时变均值和协方差。为了分别建模时变方差和相关性,本文将协方差划分为每个大脑区域的一个NxN对角线标准差矩阵和一个NxN相关矩阵。其中,相关矩阵捕获了大脑区域之间的瞬时相关性,并称为瞬时FC。研究过程中,MAGE将均值和方差的动态联系在一起,并假设相关性是独立波动的。


图1:MAGE生成模型


在上图中,首先,该模型通过瞬时均值和瞬时相关矩阵(即功能连通性)来生成数据。瞬时均值使用一组底层状态进行建模,其中的状态时间过程是使用长短期记忆(LSTM)模型生成。瞬时相关性使用一组底层状态进行建模,其状态时间过程使用一个不同的LSTM生成,使该方法是多动态的。


 2   单动态和多动态的大脑网络的对比


图2:单动态和多动态的大脑网络

[A]上图显示了两种情况下的脑网络动态实例;线宽表示功能连通性(FC)强度,节点大小表示平均活动幅度。中间和底部的显示了单动态情况下如何假设平均值和FC一起变化,而在多动态情况下,可以在不同的时间发生变化。

[B] 说明了多动态方法的优势。多动态的方法能够准确地调整波动FC,而单动态的方法不能准确地捕捉这些波动。


 3   研究结果


MAGE可以推断出FC中的动态,不同于大脑活动中的动态 

研究比较了多动态方法(MAGE)和单动态方法(SAGE)的性能。如下图所示,本文绘制了相关性和均值的状态时间过程的预测精度。与SAGE相比,MAGE表现更佳。

图3:比较了多动力学方法(MAGE)和单动力学方法(SAGE)在多动力学模拟上的性能。在实验过程中,比较了多动态方法和单动态方法的预测性能。x轴表示平均和相关状态时间过程的寿命参数,y轴表示推断的状态时间过程的预测精度。


MAGE学习显示适当的任务依赖关系的网络状态动力学

为了研究MAGE的任务依赖性,本文将其应用于任务fMRI数据。在未知任务时间(即无监督)的情况下训练MAGE,观察MAGE推测与任务相关的动态。


图4:验证MAGE在任务fMRI数据集上的性能


[A]被试有四种不同的任务(休息、视觉、运动和视觉运动)。MAGE四个任务(未知任务时间)的诱发占比图,其中x轴表示时间点的数量,y轴对应该状态的平均激活值。具体来说,任务诱发图曲线显示了所有15名被试在每个实验条件下的四次重复运行的平均值和标准偏差。

[B]功能连通性(FC)和平均活动的状态特定的空间地图,根据二者状态时间过程最对应的任务条件进行标记。对于平均活动图,显示了每个节点/通道的平均振幅。负的平均活动(例如,在运动任务中视觉网络的失活)指的是与基线相比,信号变化的减少。特定状态的FC空间图(色条)的值的大小对应于每个区域与大脑其他部分的连接程度。


多动态方法揭示了静息功能磁共振成像中FC随时间的变化更强烈

多动态方法比单动态方法能更好地识别时变功能连接(TVFC)。本文通过将单动态(SAGE)和多动态(MAGE)方法应用于静息态fMRI数据来进行验证。研究使用了来自英国生物样本库(UKB)的13301名被试和来自人类连接体项目(HCP)的1003名被试的静息态fMRI数据。UKB和HCP预处理的主要步骤为(1)运动校正,(2)用ICA去除结构伪影。最后,本文应用了一种流行的数据驱动的分割方案,为空间组独立成分分析。



图5:[HCP数据]   与单动态(SAGE)方法相比,多动态(MAGE)方法显示出特定状态的FC图有更强的变化。

显示了两种方法的四种建模状态的特定状态的平均活动和FC相关图。对于特定状态的平均活动图,显示了每个节点/通道的平均振幅,对于特定状态的FC映射,显示了估计FC相关映射的秩分解(第一特征向量)。


图6:[UKB数据] MAGE评估的FC和平均活动空间图在不同的非重叠被试集是可重复的。[A] 显示了6次重复中状态特异性FCs之间的平均相关性。此外,对于运行1和运行2,显示了4个已识别状态(在12个推断状态中)的FC相关图,表明FC状态在重复测试中是一致的。[B]  显示了6次重复运行中针对特定状态的平均活动估计值的平均相关图。


 4   总结


本文提出了一种可靠地推断出FC的时间点估计的新算法。在本文中,研究人员在几个模拟研究和一个认知任务数据集上证明了MAGE的有效性。也将该方法应用到了静息态功能磁共振成像的研究。研究发现,与现有的单动态方法相比,这种多动态方法揭示了更强的FC随时间的变化,并且能更好地预测个体行为变异性。并解释了时变FC在静息功能磁共振成像数据中稳定的原因。


参考文献链接

http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Usama Pervaiz , Diego Vidaurre , Chetan Gohil , Stephen M. Smitha,Mark W. Woolrichb Multi-dynamic modelling reveals strongly time-varying resting fMRI

correlations


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