基因组学开年盛会 | Stereo-seq亮相2023 AGBT
Advances in Genome Biology and Technology (AGBT) 作为全球基因组学的年度盛会,于当地时间2月6日-9日在美国佛罗里达州好莱坞举行。该会议旨在为世界顶尖的基因组学研究人员、学者、行业领导者等,提供与同行分享交流的窗口。在基因组学研究领域领先全球的华大将参加本次大会,同时,华大时空组学技术Stereo-seq也将亮相本次大会,敬请关注。
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时空组学主题报告
当地时间2月9日上午8:00-9:00,来自美国斯托尔斯医学研究所(Stowers Institute for Medical Research)的Ron Yu博士,将在318号会议室作“Identifying Odor Code in the Mouse Brain with Spatial Transcriptomics”主题报告,与您分享时空组学技术Stereo-seq在小鼠生长发育中的创新性研究。
Ron Yu博士简介
Ron Yu, Ph.D. is a molecular biologist and neuroscientist and an Investigator at the Stowers Institute since 2005. His lab focuses on mammalian olfactory systems involved in perception and behavior.
Ron Yu博士是知名分子生物学家和神经科学家,自2005年起在美国斯托尔斯医学研究所从事与感知和行为有关的哺乳动物嗅觉系统研究。
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华大时空组学技术Stereo-seq
华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq,是一项实现超高通量、超高精度的全景式时空转录组技术。Stereo-seq通过时空捕获芯片,结合原位RNA捕获,实现了500 nm的分辨率,最大捕获面积可达13 cm×13 cm,成为全球领先的能同时实现“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的技术,且实现了基因与影像同时分析。与当前其他技术相比,在相同的精度下,Stereo-seq具备更灵敏和更强的mRNA捕获能力。
Stereo-seq目前已被成功应用到动物胚胎发育、植物发育、脑科学、肿瘤等多个不同领域。2022年5月,深圳华大生命科学研究院联合多家机构在Cell出版社官网以时空组学联盟(STOC)专题的形式发布了全球首批生命时空图谱。这是首次从时间和空间维度上对生命发育过程中的基因和细胞变化过程进行超高精度解析,为认知器官结构、生命发育、人类疾病和物种演化提供全新方向。
时空组学联盟成果Cell专题页面
除了生命时空图谱的绘制,时空组学技术Stereo-seq在疾病病理、脑科学等研究领域也发挥了重要作用。
助力揭示宫颈癌恶化“帮凶”
2022年8月,深圳华大生命科学研究院联合华中科技大学医学院附属同济医院、重庆西南医院,利用时空组学技术Stereo-seq,首次在宫颈鳞癌临床组织中鉴定了一类促癌的肿瘤相关肌成纤维细胞(myCAFs),并深入诠释其功能。此类细胞有望成为治疗晚期宫颈鳞癌的潜在靶标,有助于开发新的预后和治疗方法,对宫颈鳞癌临床用药研发具有科学指导意义。该研究成果于北京时间8月19日发表在国际期刊Advanced Science上。
构建首个高分辨率蝾螈脑再生时空图谱
2022年9月,杭州华大生命科学研究院、深圳华大生命科学研究院联合广东省医学科学院、华南师范大学、武汉大学等多家科研单位,利用华大自主研发的高分辨率时空组学技术Stereo-seq,绘制了全球首个蝾螈端脑发育及再生的时空单细胞转录组图谱,鉴定了蝾螈端脑再生过程中的重要神经干细胞亚型(reactive ependymoglial cell, reaEGC),并比较了其状态与发育时期神经干细胞的相似性。该研究成果于北京时间9月2日发表于国际期刊Science上。
揭示黑色素瘤细胞的生长和转移机制
2022年9月,比利时鲁汶VIB癌症生物学中心的研究人员,利用包括华大Stereo-seq等在内的scRNA-seq、空间转录组测序联合分析方法,在黑色素瘤中鉴定出一群数量有限但能有效支持肿瘤生长的致瘤细胞群,为开发黑色素瘤的早期检测以及制定治疗措施提供帮助。该研究成果于北京时间9月21日晚发表在Nature上。
生命科学的进步有赖于技术及工具的发展。作为新时代的分子“显微镜”,时空组学技术Stereo-seq将推动继显微镜和DNA测序技术以来的生命科学领域第三次科技革命,助力器官图谱、疾病病理、个体发育和生命演化等研究领域的深入探索。
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