收藏 | 2022年时空及单细胞组学知识大盘点
回首2022年,“华大时空”知识库努力传递、共享时空及单细胞多组学在个体发育、生命演化、疾病病理等生物医学领域的应用前沿知识,共推出了7期时空及单细胞多组学文献追踪月度速览,30期精选主题文献的时空简讯(自有科研成果专题3篇),41篇代表性文献的深度解读(自有科研成果15篇)。
翘首2023年,“华大时空”知识库将继续秉承学术至上的原则,为读者产出时空及单细胞多组学技术与应用的高质量内容。在此,我们总结了2022年全年推送的时空及单细胞多组学技术与应用的解读合辑,供参考(点击题目即可查看文章)。
2022
深度文献解读
技术工具类
1.Nat Commun | Spatial-ID:通过迁移学习和空间嵌入进行空间高分辨转录组数据的细胞注释
2.Science | MERFISH揭示人和小鼠大脑皮层细胞的保守性和差异性
3.Immunity | scRNA-Seq揭示炎症性皮肤病的细胞状态和分子特征
4.Science | spatial-CUT&Tag:细胞水平的空间分辨染色质修饰图谱
5.Nat Biotechnol | Cell2location : 贝叶斯算法联合分层分析绘制精细空间转录组图谱
6.前沿综述 | Nature子刊:空间转录组学的临床和转化价值
脑科学研究
9.Science | 鬃狮蜥与小鼠大脑神经元类型的保守性及其分子机制研究
10.Science | 蝾螈的细胞类型分析揭示脊椎动物前脑进化的创新
11.Science | 蝾螈端脑组织、神经发生和再生的单细胞分析
12.Nat Commun | 成年猕猴大脑皮层空间分辨基因调控和疾病易感性图谱
13.Nat Neurosci | 单细胞原位转录组图谱揭示哺乳动物大脑皮层中星形胶质细胞分层
14.Science | Stereo-seq鉴定蝾螈端脑再生过程中的重要神经干细胞亚型
15.Nat Neurosci | 小鼠大脑星形胶质细胞异质性炎症响应的时空图谱
16.Cell Stem Cell | 人类下丘脑发育的时空转录组动态特征
个体发育研究
19.Dev Cell | 单细胞转录组学对出生后肝脏发育和成熟的时序性分析
20.Cell Rep | 间充质-上皮相互作用调控小鼠胚胎的胃肠道发育
21.Nat Commun | 健康和损伤愈合时小鼠肠道的空间转录组图谱
23.Science | Tabula Sapiens:人类多器官单细胞转录本测序图谱
24.Cell Res | 单细胞时空转录组技术鉴定胎肝中HSC/MPP扩增单位
25.Dev Cell | scStereo-seq揭示拟南芥叶片表征区域特异性细胞和空间转录组变化
26.Dev Cell | Stereo-seq高分辨率构建果蝇胚胎和幼虫的三维时空发育图谱
27.Dev Cell | Stereo-seq绘制斑马鱼胚胎的时空图谱和发育轨迹
28.Cell | Stereo-seq构建小鼠器官发育时空转录图谱
29.Nature | 一作详解首个非人灵长类动物全身器官细胞图谱研究
疾病病理研究
33.Life Med综述 | 时空组学技术在病理应用中的革命性意义
34.Nat Genet | 不同肿瘤中癌细胞状态的复发及其与肿瘤微环境的相互作用
35.Nature | 华大Stereo-seq助力揭示黑色素瘤细胞的生长和转移机制
36.Cancer Discov | 多区域单细胞测序解析肺腺癌的空间和细胞结构
37.JASN | 雌性小鼠急性肾损伤和恢复过程的时空转录图谱
38.Nat Commun | snRNA-seq和snATAC-seq解析成人肾组织细胞构成异质性和损伤发病机制
其他研究
41.Cell Metab | 胰岛素调节人类白色脂肪组织脂肪代谢的细胞生物学机制
2022
时空简讯
技术工具类
1.单细胞及空间多组学数据分析——深挖生物学内涵,助力精准医学 | 时空简讯38期
脑科学研究
8.单细胞水平解析慢性神经退行性疾病的发病机制 | 时空简讯24期
个体发育研究
疾病病理研究
17.呵护“小心肝”,从了解这篇“肝货”开始 | 时空简讯33期
19.剖析胃肠癌分子机制:护“胃”健康,让爱“肠”在 | 时空简讯27期
20.9篇综述+研究,涵盖肝发育、生理和疾病 | 时空简讯18期
21.时空组助力揭“凶猛”新冠病毒“真面目” | 时空简讯17期
植物研究
华大科研成果专题
28.Cell专题 | 华大Stereo-seq系列成果发布,揭秘超高分辨率生命全景时空图谱
2022
时空月速览
1.时空月速览 | 179篇文章,追踪发育/再生/进化/疾病前沿研究(2022年12月)
2.时空月速览 | 191篇文章,追踪发育/再生/进化/疾病前沿研究(2022年11月)
3.时空月速览 | 199篇文章,追踪发育/再生/进化/疾病前沿研究(2022年10月)
4.时空月速览 | 194篇文章,追踪发育/再生/进化/疾病前沿研究(2022年9月)
5.时空月速览 | 219篇文章,追踪发育/再生/进化/疾病研究(2022年8月)
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