[变异毒株]关于μ（B.1.621）的一些八卦
太长不看版总结：
B.1.621（μ）传染性或宿主适应性强于AY.1和B.1.617.2，弱于AY.3（可能也弱于AY.4、AY.12和P.1.7），稳进top 3；
B.1.621（μ）免疫逃逸能力在有专属希腊字母封号的毒株里面暂时排第一（但是没专属希腊字母封号的屁民毒株里面还有更猛的）；
B.1.621（μ）毒力未知，但曾经刷出过100%完全接种的感染群挂掉三分之一的残暴记录；
感染Delta之后的康复者血清，对B.1.621（μ）没有很强的中和效果；
最近大约10%的B.1.621（μ）已经获得额外的K417N突变，估计免疫逃逸能力很可能更上一层楼。
μ的一些基本信息：
B.1.621（μ）最早于2021年1月11日现身于哥伦比亚。
截止8月底，全世界共有大约7000份测序记录（其中1000份是子毒株B.1.621.1）。
已经蔓延到40多个国家。
流行率最高的地区是原产地哥伦比亚，流行率一度飙到了八成，目前还剩四成多。
其他比较流行的地区包括南美洲北部和中美洲的厄瓜多尔、哥斯达黎加等。
曾经在美国顶着delta的达到6.5%左右的流行率（部分州高达10%），不过现在已经基本上没有了。
刺突蛋白部分的突变如下：
如上图，浅紫色字母数字组合是碱基突变，深紫色字母数字组合是对应氨基酸突变，以及各自在刺突蛋白上的位置。
按现在的标准来说，刺突蛋白部分的突变位点只能算朴实无华（毕竟是1月份的前浪了），但每一个都踩中了要害。
——比如说，请品鉴：
上图是巴塞尔大学Emma Hodcroft老师整理的VOC/VOI刺突蛋白突变发生频率排行榜。
B.1.621这货把前五名给集齐了……
——顺便看看这几个刺突蛋白突变的功能呗，请品鉴：
如上图，红色箭头代表传染性，蓝色箭头代表免疫逃逸能力。B.1.621这几个突变，简直个个好使~
（另外，这货之所以这么猛，至少有一部分是因为刺突蛋白之外的突变，比如ORF3a:Q57H、ORF3a:256/257del、ORF8:S67F和N:T205I这些可能都有份）
μ的传染性（transmissibility）/宿主适应性（affinity）：
南美那边的毒株，历来各种实锤出得慢，所以咱暂时只能观察观察外部现象了。
而B.1.621（μ）最大的外部特征正是流行率涨起来飞快，造成这一现象的原因可能是更高的传染性，也可能是更高的宿主适应性，又或者两者皆有。现在谁也说不清。
不过对于咱围观群众来说差别也不大，反正最后结果都是更容易中招~
所以咱现在只能说说流行率相对增长趋势（如果觉得不好理解的话，可以把流行率粗略地想象成市场占有率）
问题描述里面那张唬人的图，说的正是这货在南美的流行率突飞猛涨。
但那张图的比较对象实在太弱鸡了，Alpha和Iota都已然是昨日黄花，完全不足以说明B.1.621有多猛。
还是让老夫转几张更适合产生焦虑的（老）图吧。
——比如说，请品鉴：
上图纵轴是各个毒株，横轴是全球42个国家周均流行率相对增长率，流行率增长越明显，则可以很粗略地代表该毒株传染性越高（higher transmissibility）或宿主适应性越好（higher affinity）。
另外横轴0.0处的那根虚线是作为对照标杆的alpha（前任扛把子已然沦落为背景板…）
可以看出，
B.1.621（μ）流行率相对增长率仅次于Delta，稳坐全球第二把交椅。
那么二把手和一把手的差距有多大呢？
——请继续品鉴：
上图纵轴是各个不同国家/地区，横轴是周均流行率增长情况，
图中黑色圆点是一把手Delta（包括一代目B.1.617.2和各种徒子徒孙），绿色圆点是二把手B.1.621。
（前任扛把子Alpha继续充当背景板）
圆点越靠右，则流行率增长越迅猛。所以不难看出，虽然B.1.621整体来说负多胜少，但已然在不止一个国家/地区拔得头筹。所以：
μ是疫情以来第一个不靠奠基者效应就足以跟Delta拼正面的毒株。
Westeneng老师八卦之魂熊熊燃烧，他专门挑了测序工作比较到位的英国做主战场，帮咱们把Delta大家族里面的一代目B.1.617.2以及实力最强的AY.3单独拎出来，跟二把手B.1.621分别对线。
——请接着品鉴：
这张图信息量超大，足以让人反复焦虑三遍。
首先，在英国，二把手B.1.621的流行率增速超越了B.1.617.2（也超越了陪跑的AY.1）；
然后，Delta显然也不是啥善茬，徒子徒孙当中的AY.3又甩了B.1.621足足一个身位；
最后，跑个题，请大家注意左上角有个不起眼的小黑点，那个是陪跑的beta（B.1.351）……之前常年被alpha摁在地上摩擦的beta，流行率不知不觉反超了背景板Alpha。
μ的免疫逃逸（immune evasion）/突破感染（breakthrough infection）：
——东大佐藤佳老师团队新鲜出炉的预印本，请品鉴：
如上图，佐藤老师分别做了康复者血清和BNT疫苗接种者血清的抗体中和试验；每个柱子代表一种毒株，柱子上面写在括号里面的数字是该毒株相对于原始株（最左边灰色柱子对照组）中和能力下降的倍数。
B.1.621/μ的抗体中和试验成绩，在各大拥有专属希腊字母的毒株当中暂列榜首。
μ的毒力（virulence）/病死率（CFR）：
这部分严重欠缺实锤数据，但目前已经掌握的少量信息非常不乐观。
——请品鉴：
比利时某养老院，已全员接种，爆发了B.1.621聚集性感染，21位老人中招。
挂了7位。
当然了，这个例子样本量太小，完全不够实锤。
但全世界那么多的养老院在发生突破性感染，一次中招20多个的聚集性感染群也不少见，
还真没听说挂掉三分之一的……
关于μ的总结：
总之，如果说Delta是传染性专精，其他方面中等的话，
B.1.621就尼玛是个六边形战士（三角形战士）：
传染性top 3，免疫逃逸top 1，毒力/病死率说不定又是top 3。
所以说啊，WHO后知后觉，分配希腊字母还严重缺乏统一标准。
居然直到这两天才舍得安排一个专属希腊字母给B.1.621~
失败。
未来展望：
B.1.621和Delta的同台竞技非常有意思。
根据耶鲁大学Grubaugh老师的观察：
B.1.621会跟Delta联手快速做掉其他选手，
在这期间B.1.621的增长速度甚至可能超过Delta。
然而一旦进入两强对决阶段，B.1.621会快速被Delta取代。
——比如，请品鉴：
如上图，一图秒懂系列，B.1.621和Delta在美国的流行率消长情况（注意坐标轴魔法）。
所以现在美国B.1.621的流行率只剩下0.1%的样子。
但这样就尘埃落定了吗？
可能还没有……
——咱品一品英国佬的一个说法啊：
感染Delta之后的康复者血清，对B.1.621并没有很强的中和效果。
而个人盲猜，这一点可能正是B.1.621流行率增长如此迅猛的原因之一。
（也是英国的Beta流行率触底反弹的原因之一）
各位宿主大人蒙住眼睛W字脚躺平，
Alpha先收割一轮，
Delta再收割一轮，
最后B.1.621（以及Beta）上场恰点残羹剩饭……
大概就是类似这样的场景吧。