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#变异毒株
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话说,昨天咱简单八卦了一下VOC(受关注变异株)的三朵过气黄花。其中Alpha和Gamma还勉强保存了一丢丢日渐萎缩的大本营,刚好相反,Alpha和Beta各自经历了武林奇遇,今天咱继续品鉴英国卫生安全局《第28期英格兰地区新冠病毒VOC/VUI技术简报》的9种VUI(正在调查的变异株)。AY.4.2(Delta徒子徒孙之一)
B.1.525(Eta)
B.1.617.1(Kappa)
B.1.621(Mu)
P.2(Zeta)
P.3(Theta)
B.1.617.3
AV.1
B.1.1.318
对了,大伙儿会不会觉着上面那堆代号……就跟天书一样?用人话来说,pango命名法通常由从左到右3-4个小节组成,其中第一个小节是大写字母(一位字母或两位字母都可以),比如说B.1.1.7,或者AY.4.2;从左到右每个小节,都对应演化树上的一次进化枝分化,其中最左边的“B”,代表新冠病毒的B进化枝(当初武汉两种初始毒株之一);
“B.1”则代表B进化枝下的第一个分支;
然后“B.1.617”代表B.1进化枝下的第617个分支;
再然后,“B.1.617.2”代表B.1.617进化枝下的第2个分支。在变异株名称长度达到4个小节之后,Pango team的老师会约定一个新的专属英文简称,用来专门指代上述4个小节。
比如AY.4.2里边的"AY",指代的就是"B.1.617.2"这4个小节。所以AY.4.2的意思,就是“B.1.617.2.4.2”。
(或者说,AY.4.2相对于原始株而言,演化树已经分支了6次)
AY.4.2是Delta家族最耀眼的当红新星;
Mu是当前新冠病毒江湖仅次于Delta的六边形全能战士(可惜照样不太挡得住Delta的蚕食);
B.1.1.318是被WHO忽略的实力派干将(可惜还是挡不住Delta的猛攻);
其他六位……则全都是已经过气但暂时没有死在沙滩上的前浪~
现如今的《技术简报》清单,其实非常形象地说明了新冠病毒演化至今已经发生的一种范式转换:
2021年3月底到达流行率顶峰,约占全球1%的样子~主要流行范围是以尼日利亚为中心的中部非洲地区,以及美国加拿大;
主要原因是曾经和B.1.526并称为“纽约变异株”,
B.1.617.1(Kappa)和B.1.617.3入围《技术简报》和喜提WHO专属希腊字母的主要原因,则在于沾了亲兄弟Delta的光……其中Kappa还勉强有一次拿得出手的爆发记录,也就是2021年5月份导致墨尔本封城两周的那次~结果被墨尔本超神发挥,反手就给它摁没了,毫无悬念……
这两兄弟最后现身都是2021年9月中旬(印度和英国都有)。哦对了,B.1.617.1的专属希腊字母也惨遭回收了~
同样从头到尾都毫无存在感的变异株,同样是希腊字母称号惨遭剥夺的弱鸡。入围《技术简报》和喜提WHO专属希腊字母的主要原因,照例是沾了亲兄弟P.1(Gamma)的光……最后一次现身是2021年10月6日(美国佛罗里达州)。
2021年1月底被日本入境检疫机构挡获,来源于菲律宾。由于长相和同样被日本入境检疫机构挡获的P.1(Gamma)太神似,所以备受重视,毕竟菲律宾测序工作太一言难尽,所以我们其实并不知道这货在菲律宾境内到底流行到了什么程度,以及现在还有没有继续存活~时不时就要在日本/韩国/香港/新加坡等入境检疫刷个存在感~
(这也侧面说明了,菲律宾的主要支柱产业,就是劳务输出)
AY.1是Delta家族的长子长孙(虽然现在看起来挺挫),跟上面的P.2、P.3一样,这货完全没有实际战绩,特别是刺突蛋白部分(打红框的就是看着唬人的部分)~
没办法,那时候大伙儿被Beta和Gamma吓破了胆,看到E484K就瑟瑟发抖……
简单来说,B.1.1.318是整个VUI清单上仅次于AY.4.2和Mu的强悍存在,B.1.1.318于2021年1月初诞生于尼日利亚(又是尼日利亚),陆续抢到了毛里求斯、乌干达、希腊等好几个国家/地区的堂口,并且直到7月中旬,都有能力在少数地区跟元祖版Delta正面拉锯~
↑ 上图是荷兰乌特勒支大学Henk-Jan Westeneng老师搞的希腊各变异毒株流行率增长速度多项式拟合(截止2021年7月15日)。其他毒株则用黑点表示。黑点上面的黑色线段代表了置信区间,黑点越靠右,则意味着该毒株相对于alpha的流行率增长率越高。
7月份的希腊,可能是Delta吃瘪最惨的场合……连前三都没挤进去哦对了,上图排名第二的Other其实就是B.1.1.318的子毒株AZ.2~
Westeneng老师是搞算法的,毒株分类他不太熟,没认出来,
故事的结局,B.1.1.318在多个地区刚住了元祖版Delta,但很快就被更高更快更强的徒子徒孙版Delta推到了沙滩上……最近刚刚入围WHO的VUM(正在监测的变异株)清单。
不过AZ.5之所以能幸免于难,主要还是因为命好,生在毛里求斯~毛里求斯啥地方?
全非洲防疫top 2,防疫水平甩了非洲平均水平8条街,甩了英美欧28条街。
——请品鉴:
但虽然身为非洲top2,
毛里求斯还是力有不逮,没法实现社区感染快速清零,
只能一边慢慢解决AZ.5,一边尽量延缓Delta入侵。
结果AZ.5没摁死,Delta的输入和传播又受到限制,
这就相当于阴差阳错,变相保护了本该被Delta长江后浪推前浪的AZ.5……
最终结果就是AZ.5继续在毛里求斯苟活……
至于说突变,AZ.5的突变大致是这么个造型~
——请品鉴:
但比起《技术简报》上藏身于最后一部分的几个大怪物还是有不少差距。
最后,还剩下Mu和AY.4.2两个大魔头,之前已经专门八卦过了~
最近甚至还开枝散叶,搞出了后浪AY.4.2.1……所以Mu所在的南美和AY.4.2所在的英国,可想而知……前景都不太妙~
——南美(以智利为例,其他地方的曲线才刚刚抬头):