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西湖大学,为AI制药贡献了什么?

智药局 智药局 2022-05-21




3月19日晚7点,中科院院士施一公准时现身直播间,宣讲关于西湖大学本科生招生事宜。

 

尽管只招收60名本科生,外界对这所民办大学的兴趣依旧不减,纷纷在评论区留言,施一公也有问必答。

 

除了直播中介绍学术成果外,施一公还着重提到了学校产学研一体的氛围。

 

近年来西湖大学已经孵化出近20家成果转换企业,其中经由西湖大学自主转化的多达十余家。

 

包括西湖生物医药、西湖欧米、西湖制药、西湖智能制造....其中有2家都是AI药物研发公司,1家拥有AI研发平台。

 

这个成立仅5年的民办大学,为什么有如此强劲的科研成功转化能力?又为什么会有如此浓厚的AI制药基因?




科学家牵头,企业家托底

 

2017年,西湖大学还在筹备中,施一公找上了张磊,期望这位资本大佬能为学校捐款。

 

作为牵头人的施一公奔走拜访各个企业家,甚至辞去清华大学副校长职位,将精力放在西湖大学上,但缺钱的窘境却让他十分焦虑。

 

施一公和张磊同是河南老乡,甚至在同所中学上过学,恰好张磊才为母校人大捐了3亿元,施一公希望张磊能松松手,也给西湖大学捐上一笔。

 

没想到张磊却说:“师兄,你是科学家,把事情想得太简单了”

 

在张磊看来,学校捐赠也包含一种商业思维,前期的成立是小头,后续运营还需源源不断地筹集资金,就必须交由专业的机构来办,此事交给他再合适不过。

 

张磊呼朋唤友,把马化腾、王健林等都引来西湖大学,长长的捐赠名单里,是一个又一个大额捐款的企业家。

 

2018年,中国第一所民办研究型大学——西湖大学正式成立。


它最初占地不过70亩,只有7栋方块楼,由于人少,甚至看着不像一所大学。


西湖大学前身——西湖高等研究院,现为西湖大学云栖校区


2015年3月,清华大学副校长施一公领头,陈十一、潘建伟、饶毅、钱颖一、张辉、王坚等七人联名,正式向国家提交了试点创办民办研究性大学的文件,并获得支持。

 

他们每一个人都是生命科学、物理、计算机等领域的佼佼者,但同时也藏着一个“问鼎世界一流”的教育梦,希望通过民办大学灵活的机制,为中国的基础科学做出贡献。

 

这个效仿美国加州理工而创办的大学,创立之始就定下了它的主基调:小而精、高起点和研究型

 

建校始,西湖大学聚焦于STEM教育,只设立了三个学院:生命科学学院、工学院和理学院。


生命科学学院涵盖与生物学、生物医学工程、药学等相关的基础研究及应用研究各领域,理学院由潘建伟担任负责人,致力于在量子信息、凝聚态物理、纳米材料等前沿领域进行重点布局。

 

更重要的是,西湖大学一成立就带着学科交叉的底色。工学院的前身是前沿技术研究所,围绕国家战略性新型产业发展的需求,促进学科交叉与融合,旗下有多个研究中心,包括计算机科学、生物工程、环境工程等领域。

 

例如,工学院旗下的人工智能和机器人实验室近一半的同学都在和生物实验室进行各个领域的交叉合作,期望可以碰撞出灵感的火花。


为了达到高水平建校的目的,西湖大学选择从全球引进顶级人才,并且前几年只招收博士生。


学校账上不差钱,施一公甚至飞到哈佛“挖墙脚”,以“高薪+情怀”呼吁海外人才回国开展研究。

 

就这样,在加拿大生活40年的Mohamad Sawan教授来到中国;耶鲁大学讲席教授许田放弃终身教职;普林斯顿大学博士后李牮学成回国,马丽佳博士携全家来到杭州......

 

多年来,他们在海外接受系统专业的科研训练,回到中国将面临全新的科研环境,和一份意想不到的事业。


 


一份全新的事业

 

2018年3月,许田卸下了他在美国所有的职务,包括耶鲁大学终生教授、HHMI研究员等,全职加入西湖大学并出任副校长。

 

施一公曾评论,许田教授的全职加盟,是西湖大学发展历程中的重要一步。

 

从履历来看,许田几乎契合了西湖大学所有对人才的要求:遗传学领域的大牛学者,曾在耶鲁任管理职务,还创立过创新孵化器,成功孵化出13家企业。

 

更难能可贵的是,他是AI+生物医药的坚实拥趸者,甚至在他51岁之际(2013年)学习人工智能技术,之后更是参与创立人工智能药物研发公司。

 

在许田看来,西湖大学的新是其最有可塑性的地方,利用灵活的机制,可以打破原有的学科壁垒,学科交叉下,使研究成果进行产业转化。

 

西湖欧米的创立,正好源于两个学科的交流与碰撞。

 

2018年4月,已加入西湖大学的郭天南,启动了基于蛋白质组检测判断甲状腺结节良恶性的研究。

 

数据显示,每5个人就可能有1个人患有甲状腺结节,而大约30%甲状腺结节在手术之前无法被明确诊断,很容易造成甲状腺的过度诊断。

 

同样作为生命的基础物质,相较于现在的流行的基因组学,蛋白质组大数据的复杂程度要高处好几个量级,对数据处理能力也要求更高。

 

一个很偶然的契机,他和AI专家李子青在西湖大学学科交叉交流会上相遇,郭天南请教了李子青数据方面的问题,这恰好是李子青的强项。

 

李子青是计算机视觉识别的专家,曾研发出世界首个实时人脸识别系统,发表论文约400篇,引用数高达47800余次。

 

他加入西湖大学有两个目的,第一是加强人工智能基础研究,第二就是让AI照进现实,促进技术落地。

 

李子青与郭天南一拍即合,两个团队共同合作这个课题,分工十分明确:郭天南实验室提供蛋白质数据,李子青实验室负责设计数据分类分型的人工智能模型,不断完善AI模型。

 

经过6个月的奋战,两个团队不断改进人工智能模型,持续迭代版本,通过对2421个蛋白质组学数据进行分析,最终得到甲状腺蛋白质表达图谱,找到了14个关键蛋白质的组合,可对甲状腺结节进行良恶性判别。

 

AI模型在对甲状腺结节穿刺样本的良恶性的判断上,准确率达到了90%,在学校的帮助下,研究团队成功发表成果并申请专利。

 

2020年7月,杭州西湖欧米正式成立,由郭天南任创始人兼CEO,将蛋白质组学大数据与人工智能相结合,进行临床诊断或药物研发。

 

西湖欧米团队


两个意想不到的团队发表了几篇论文、获得专利,以及一个成果转化企业“西湖欧米”。

 

2021年,由马丽佳团队创立的西湖云谷智药业孕育而生,成为西湖大学自主转化的第二家AI药物研发公司,与西湖欧米不同的是,该公司聚焦“AI+基因编辑”方向,致力走通人工智能技术在基因治疗领域落地的全流程。

 

同年,由西湖大学副校长许田创立的AI制药公司——药物牧场也获得5600万美元融资,推动乙肝疗法道达尔突破。

 

能浮出水面的不过冰山一角。

 

在西湖大学生命科学院内部,成立了一系列核心实验室,包括基因组学与生物信息学实验室、智能生物标记物实验室、人工智能药物设计实验室等,这些实验室都在借由计算或AI的方法助力药物开发或新疗法。

 

其中人工智能药物实验室可谓是人才云集,卢培龙、曹龙兴博士都曾在蛋白质设计大神David Baker教授的实验室做过博后,黄晶分子动力学模拟及理性药物设计的专家,现为百图生科科学顾问。


他们极有可能是西湖大学下一个AI+生命科学项目的储备力量。

 

在常人的认知中,这本该是一个学术的伊甸园,西湖大学又如何做到成立这么多家硬科技公司呢?

 

 


5年时间,打造“西湖系”铁军

 

从第一家自主孵化的公司算起,西湖大学成立不过5年,已累计自主转化出了10余家企业,这个速度放眼全国都是遥遥领先。

 

当初西湖大学在办校理念参考加州理工,在成果转化方面则直接与斯坦福对标。

 

经过多年发展,斯坦福成果转化已经探索出一套成熟的运营体系,并成为国内外众多高校的范本。

 

全球最优秀的科技人才,和专业性强的科技成果转化团队,让斯坦福成果转化硕果累累,甚至可以说斯坦福成就了硅谷,输送了大量的人才与项目。

 

早在2019年,西湖大学成立不到一年时,便成立了成果转化办公室和发展公司,推进科技成果的转化。

 

办公室的员工大多都受过严谨的学术训练,博士出身,既懂论文,又懂合同,是连接高校与市场的桥梁。


西湖大学成果转化办公室

 

据主任王廷亮介绍,他们会跟踪和调研每个团队的科研方向,进行交流和评估,确定转化项目后,为研发团队提供一系列的服务,包括公司注册、专利布局、法律咨询、投资、收益分配等。

 

一边保证研究成果在工业界的落地,一边解决科学家们的后顾之忧。

 

而当初捐赠的张磊、沈南鹏等资本大佬,也让高瓴、红杉中国顺势成为和西湖大学联系紧密的风投机构,多个转化项目的资方都能看到它们的身影。

 

如今,西湖大学已经形成了“PI+学校转化+风投机构+政府扶持”的转化模式,即从全球吸引顶尖学术人才,打造一流实验室与项目,学校参与科研成果转化,再和市场进行对接。

 

这类转化公司既有前沿的创新性,又有高水平的研究成果,让它们一出世就有着高起点。

 

西湖欧米、西湖云谷智药、西湖生物医药等AI制药公司或生物技术公司,首轮融资便能拿到数千万元人民币,有的甚至过亿。

 

有“东方斯坦福”,自然也少不了“硅谷”的相辅相成。

 

近年杭州市一直致力将自身打造成中国硅谷,西湖大学则是杭州重要的的高新技术策源地,地处杭州城西科创大走廊。

 

为了打造好西湖大学,杭州市几乎下了血本,将在云谷校区周边17平方公里的范围内打造西湖大学城,建设西湖大学科技园及生物医药产业园,承接西湖大学科研成果转化。


西湖大学云谷校区

 

目前在西湖大学科技园云栖基地内,汇集了十几家企业,它们都来自西湖大学的科研成果转化,仅西湖生物医药一家公司的估值就已超过十亿元。


 


大学也来做VC了

 

显然,西湖大学已经不满足于做FA,还成为了早期投资人。

 

2020年8月,西湖大学成立西湖大学(杭州)股权投资有限公司,随后获得中基协私募股权、创业投资基金管理人登记。

 

这意味着西湖大学可以对外募集资金,设立创投或股权投资基金,直接进行VC投资。该公司法定代表人为王廷亮,正是西湖大学成果转化办公室主任。

 

由此,创投圈罕见地出现了一所民办大学。

 

在西湖大学产业投资基金的名单里,既有西湖欧米、西湖维泰等自家企业,许多公司也和西湖大学有着千丝万缕的关系。

 

例如新芽基因的首席科学顾问是西湖大学常兴教授;豪思生物创始人栗琳曾被施一公引进回国;瑞奥生物创始人程建军现为西湖大学讲席教授......

 

高质的“朋友圈”,加上专业的创投团队,西湖大学是生物医药投资机构中独特的一抹存在。

 

正如当初施一公创办西湖大学时的初心,充分发挥民办院校机制灵活、离市场更近的优势,走出一条截然不同的道路。

 

我们希望更多教授既奋战在实验室,也期待他们脱下白大褂,进入产业界,将研究成果造福人民。


参考来源:

https://www.hubpd.com/c/2016-12-12/550347.shtml

https://www.thepaper.cn/newsDetail_forward_7752548

https://hznews.hangzhou.com.cn/chengshi/content/2021-10/26/content_8081110_0.htm


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