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独立样本T检验 | Graphpad prism8统计分析教程 第一期

Tests,点击OKGraphPadPrism提供了四种检验数据是否呈正态分布的方法,即Anderson-Darling
2020年6月21日
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配对比较图+Time line图 | Graphpad prism8绘图教程 第十三期

family选择Column,按下图指示选择:点击OK,出图:4.绘图②-Graphs(美化一下)Step:双击绘图区域,按下图修改Stytle、Symbols等参数。添加间隔线。Step2
2020年6月16日
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三维瀑布图+向量图 | Graphpad prism8绘图教程 第十二期

line/curve这一项中的颜色color、风格Stytle、线条粗细Thickness等参数。调整后,一幅矢量图(Vector
2020年6月15日
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点图(Dot plot) | Graphpad prism8绘图教程 第十一期

table&graph打开Graphpad,选择Grouped,点击Create2.输入/导入数据3.绘图①-Graphs点击左边Graph中的数据集Data1,GRaph
2020年6月14日
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柱状图(双向柱状图等)| Graphpad prism8绘图教程 第十期

柱状图一般用于,当我们都有一组分类变量以及每个类别的定量值,而我们关注的主要重点是定量值的大小时。今天给大家带来Graphpad绘制各类柱状图的教程!一.双向柱状图1.Graphpad中创建New
2020年6月13日
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ROC曲线 | Graphpad prism8绘图教程 第九期

今天给大家带来Graphpad绘制ROC曲线的教程及面积计算!受试者工作特征曲线(receiveroperator
2020年6月12日
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散点图 | Graphpad prism8绘图教程 第八期

第一期第二期生存曲线+热图。Graphpadprism8使用教程第二期第三期小提琴图+布兰德-奥特曼图。Graphpadprism8绘图教程第三期第四期箱线图+折线图。箱线图+折线图
2020年6月11日
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column图 | Graphpad prism8绘图教程 第七期

第六期今天,给大家带来了用prism8绘制column图的详细教程。(1)创建(2)写入/导入数据(3)结果图1-Graphs柱形图散点图(4)分析-T
2020年6月9日
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微生物组16S rRNA数据分析小结:从fastq测序数据到OTU table

primer(引物)是用于16S扩增与建库的引物序列,在测序技术中起到定位的作用。有些下机数据会已经将样本按照barcode分好,每个样本测得的序列片段都放在一个与样本对应的文件里。input:
2020年6月9日
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排序分析(Ordination Analysis)

lengths”的第一轴DCA1的值,根据该值判断该采用线性模型还是单峰模型:如果大于4.0,就应该选单峰模型;如果3.0-4.0之间,选线性模型或者单峰模型均可;如果小于3.0,
2020年6月8日
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Time scale axis-时间尺度图 | Graphpad prism8绘图教程 第六期

axis-时间尺度图的教程。(1)创建(2)写入/导入数据(3)结果图1-Graphs(4)结果图2-Graphs(美化一下)双击坐标轴:Step1:Step2:添加Ticks
2020年6月8日
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森林图+Cleveland 点图 | Graphpad prism8绘图教程 第五期

分析微生物组数据及可视化3.vegan包进行微生物群落主坐标分析(PCoA)及ggplot2作图4.R语言PCA分析教程
2020年6月6日
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R语言 | 相关性分析

推荐阅读1.ggplot2绘制曼哈顿图示例2.phyloseq
2020年6月6日
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箱线图+折线图 | Graphpad prism8绘图教程 第四期

分析微生物组数据及可视化3.vegan包进行微生物群落主坐标分析(PCoA)及ggplot2作图4.基础绘图
2020年6月5日
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R语言PCA分析教程 | Principal Component Methods in R

ExPosition包]无论您决定使用什么功能,您都可以使用factoextraR包中提供的R功能轻松提取和可视化PCA的结果。通过install.packages(“FactoMineR”,
2020年6月5日
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vegan包进行微生物群落主坐标分析(PCoA)及ggplot2作图

此处结合微生物群落研究中的16S扩增子分析数据,给大家分享怎样在R中进行主坐标分析(PCoA),顺便使用此处的PCoA排序结果,给大家展示怎样结合ggplot2绘制“好看”的PCoA排序图。在R中,可用于进行PCoA分析的R包有很多可供选择,如“vegan”、“ade4”等,这些均是在生态统计中常用的R包。此处作为示例介绍其中的“vegan”包。首先介绍示例数据。我们此处共有96个16S测序样本,均来自土壤。这96个样本共涉及了4个采样地点(地点A、B、C、D);2种处理梯度,即添加某化学物质的低浓度处理(low)以及高浓度处理(high);4个采样时期(时期1、2、3、4);对于每个采样地的每种处理梯度的每个时期下,各自进行了3个重复,共计4×2×4×3=96。此处我们希望通过PCoA分析,查看样本间细菌群落组成是否具有显著不同。作图示例文件、R脚本等,已上传至百度盘,无提取码(若失效请在下方留言)https://pan.baidu.com/s/1mL92U9DxMZKjqTNRhDW9ZA示例文件简要文件“otu_table.txt”为OTU丰度表格,其内容展示如下。每一列为一个样本,每一行为一种OTU,交叉区域为每种OTU在各样本中的丰度。
2020年6月4日
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Graphpad prism8绘图教程 第三期

Plot的介绍可参考:https://www.medcalc.org/manual/blandaltman.php声明:文章转自Jessie
2020年6月4日
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Graphpad prism8使用教程 第二期

prism8的安装教程(附带安装包),散点图(XY)、柱状图等的绘制。今天给大家带来了用prism8绘制生存曲线(Survival
2020年6月3日
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phyloseq | 用 R 分析微生物组数据及可视化

install.packages("BiocManager")BiocManager::install("phyloseq",
2020年6月3日
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ggplot2绘制曼哈顿图示例

plot),因其形似曼哈顿摩天大楼,故俗称为曼哈顿图(本想摆些大楼的照片做个样子来着,但是这种东西怕侵权,还是算了)。曼哈顿图最常见于全基因组关联分析(Genome-wide
2020年6月2日
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Graphpad prism8使用教程 第一期

test(1)创建table(2)写入/导入数据(3)结果图1-Graphs(4)分析-t
2020年6月2日