生信小王子

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使用iTOL美化进化树

NODE_ID,label,COLOR,label_style(normal为普通,bold为加粗,italic为斜体,bold-italic为加粗并且斜体),label_size
2018年8月23日
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使用ggtree对进化树进行分组美化

最近,小编的老师想要在一张进化树上标出不同来源的材料,平时这种“累活”小编都是使用iTOL、evolview等工具进行手动美化的,但是这次进化树里的样本足足有800多个,想要清楚、准确的标完所有的颜色,势必要耗费大量的时间,在这危急关头,小编发现了传说中Y叔写的“ggtree"!拯救小编于水火之中!ggtree可以像ggplot2一样,用图层化的语法绘制进化树,通过不同的图层组合即可绘制出更为复杂的进化树。首先,我们要安装好“ggtree"。source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
2018年8月22日