H&E染色原理。分别用两种染色剂：苏木精和伊红。苏木精可以把嗜碱性的物质染成紫蓝色，如核酸；伊红可以把嗜酸性的物质染成粉红色，如蛋白质。颜色的深浅可以反映细胞的状态，如分裂活跃度，通透性等。

单细胞聚类的一般步骤有：数据质控，基因筛选，PCA降维，以及基于PCA预降维空间的聚类和进一步的降维可视化。之前的文章介绍了单细胞数据的PCA降维和聚类算法。本次文章介绍基于PCA空间的降维可视化算法tSNE，将单细胞数据降至2维或者3维可视化。

单细胞多组学整合也是一大研究趋势，例如染色体开放区域测序（ATAC-seq）与转录组测序数据的整合研究，最近一篇发表在NC上的测序方法scCAT-seq，揭示表观调控的多样性