新型冠状病毒流行源自蛇？遭学界质疑据雷锋网此前报道，1月22日，一篇发表在Journal of Medical Virology（医学病毒杂志）的论文指出，与刺猬、穿山甲等其他动物相比，2019-nCoV的密码子使用偏好与蛇类似，因此蛇最有可能是携带新型冠状病毒的动物。 不过，这样的消息很快得到了学界的质疑：科学媒体“知识分子”商周专栏在23日发表文章称，“此前流行的SARS和MERS病毒的自然宿主均是蝙蝠，通过果子狸和骆驼传染给人，也就是说，病毒的传递是在哺乳动物之间进行的。但蛇不是哺乳动物，而是爬行类。”圣保罗大学的病毒学家Paulo EduardoBrandão说：“他们没有证据表明蛇可以被这种新的冠状病毒感染并作为宿主。除了哺乳动物和Aves（鸟类）以外，没有一致的证据证明宿主中存在冠状病毒。”
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蝙蝠、水貂成候选？1月24日，北京大学工学院教授朱怀球团队在bioRxiv预印版平台发表题为《深度学习算法预测新型冠状病毒的宿主和感染性》的文章。基于深度学习算法开发的VHP（病毒宿主预测）方法，推测出蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主，水貂可能为病毒传播的中间宿主。文中提到，随着全基因组序列的在线发布，他们预测了新型冠状病毒2019-nCoV的潜在宿主。结果显示，2019-nCoV的6个基因组均具有较高（p值<0.05）感染人类的可能性。VHP法提供的50种冠状病毒潜在宿主的P值（人类冠状病毒呈红色，2019-NCoV标记为*）新型冠状病毒与44种病毒进化树（橙色区域为2019-NCoV）朱怀球团队研究得出结论，新型冠状病毒具有与严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）、蝙蝠SARS样冠状病毒（Bat SARS-like CoV）和中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）类似的感染人类的强大潜力。与感染其他脊椎动物的冠状病毒相比，蝙蝠冠状病毒具有与武汉新型冠状病毒，即2019-nCoV相似的感染模式。此外，通过比较所有宿主在脊椎动物上的病毒传染模式，发现水貂病毒的传染性模式与2019-nCoV更为接近。该课题组成员之一，浙江大学医学院第一医院、传染病诊治国家重点实验室副主任肖永红对媒体表示，研究发现，新型冠状病毒与其他冠状病毒有相似的传染过程。蝙蝠身上有多种冠状病毒，这些冠状病毒可能先传染至哺乳动物，再传染到人。比如MERS病毒，中间宿主就是骆驼。对于新型冠状病毒来说，研究预测，蝙蝠是它的最主要来源，中间宿主可能是水貂。需要指出的是，这一研究并非是基于动物实体的研究，只是采用计算机深度学习算法来进行的数据模式推论，准确性有待商榷。值得注意的是，23 日，中国科学院武汉病毒研究所石正丽团队在 bioRxiv 预印版平台上发文称，新型冠状病毒（2019-nCoV）或来源于蝙蝠。据了解，石正丽团队早期从5名患者体内获得了该病毒的全基因组，其中这5例基因组基本上一致，并与SARS-CoV的序列一致性达79.5%。同时还发现，2019-nCoV与云南菊头蝠中存在的RaTG13冠状病毒的序列一致性高达96.2%。另外，早前21日，中国科学院上海巴斯德研究所郝沛研究员、军事医学研究院国家应急防控药物工程技术研究中心钟武研究员和中科院分子植物卓越中心合成生物学重点实验室李轩研究员合作，在SCIENCE CHINA Life Sciences（中国科学：生命科学）上发表论文称，武汉冠状病毒和SARS/类SARS冠状病毒的共同祖先都是和HKU9-1类似的病毒。并推测和SARS一样，武汉冠状病毒的自然宿主也可能是蝙蝠，在从蝙蝠到人的传染过程中很可能存在未知的中间宿主媒介。