大爆发！中国科学家成果霸屏世界顶级期刊！施一公“远离垃圾论文”的梦想正在实现！

引言
这两日，顶尖学术期刊《科学》、《Cell》等杂志刊登了来自中国科学家的科研成果及文章。上海交大赵立平团队在《科学》杂志上面的文章表明膳食纤维可助肠道菌群治疗糖尿病；而来自中科院基因组所刘江、山东大学陈子江与广州医科大学三附院刘见桥合作团队在线发表在《Cell》上面的文章则首次报道人类早期胚胎发育染色质调控的动态图谱。在最新一期《Cell》期刊聚焦的微生物领域，其中，中国疾控中心主任高福院士发表新发突发传染病评论文章，而复旦大学及中国疾病预防控制中心的张永振研究员也发表了一篇关于利用宏基因组发现RNA病毒的评述文章。

▶施一公炮轰垃圾论文◀

就像著名人物马丁路德金说过的那样：I have a dream！

碰巧，估计中国最出名的科学家之一，请辞清华大学副校长，上任西湖大学校长的施一公教授也有一个梦想（Shi Yigong have a dream）：那就是让中国远离垃圾论文。

是的，最近，施一公在全国政协十三届一次会议上，参与讨论时坦言：“我以前曾经预测，中国会在2020年论文数超过美国，没想到我们提前完成了。”“有些文章，通俗点叫‘垃圾文章’，就是纯粹为了发文而发文，这种情况太多了。”

▲施一公在近日全国会议上炮轰中国的“垃圾论文”（图片来自网络）

“这是科技评价体系的问题。”施一公说，在各个单位，无论是决定晋升还是评绩效，都会把专利数、文章数、被引数和文章发表期刊的影响因子数作为重要参考指标，“这个风气愈演愈烈”。

确实，中国早在2016年论文数量就超过美国，据美国国家科学基金会（NSF）发布《2018年科学和工程指标报告》，指出2016年中国发表学术论文42.6万份，首次超过美国，成为全球第一（欢迎点击阅读本公众号相关文章：最新报告！中国超越美国首次成世界第一论文大国！是喜是忧？）。

然而，中国学者的论文被国际同行引用的比例却不断走低，而其他国家的科学家同行的论文比例则处于上升态势。

▲中国论文被国际同行引用的比例不断走低，而其他国家则处于上升趋势

这不能不引起大家的注意！

当然，一部分科学家还是相当优秀的，从高被引论文的指数增长就能够看得出来。然而，从被国际同行引用低这一角度来看，恐怕反映出我国一些学者的论文原创性不足的问题，发表过论文的人都有感觉，同一个领域，原创度高的文章通常引用率都远远大于跟风做的研究。因此，施一公担心的“垃圾论文”问题不是空穴来风。

▶高质量论文回归◀

诚然，发表在高影响因子上面的论文未必就是一定比发表在不知名杂志上面的文章质量高或者意义大。

然而，不得不说的是，著名学术期刊《自然》、《科学》、《细胞》等等上面发表的文章普遍文章质量都还是较高，要不为何它们在学术界的影响力如此之广呢？大多数科学家还是能够比较容易地对文章质量做出判断的。

如今，在顶尖期刊《Cell》、《Nature》及《科学》上面发表文章对于中国本土科学家而言早已不是什么难事了，几乎每个月都会有多篇中国科学家的身影。

这两日，顶尖学术期刊《科学》、《Cell》等杂志刊登了来自中国科学家的科研成果及文章。上海交大赵立平团队在《科学》杂志上面的文章表明膳食纤维可助肠道菌群治疗糖尿病；而来自中科院基因组所刘江、山东大学陈子江与广州医科大学三附院刘见桥合作团队在线发表在《Cell》上面的文章则首次报道人类早期胚胎发育染色质调控的动态图谱。在最新一期《Cell》期刊聚焦的微生物领域，其中，中国疾控中心主任高福院士发表新发突发传染病评论文章，而复旦大学及中国疾病预防控制中心的张永振研究员也发表了一篇关于利用宏基因组发现RNA病毒的评述文章。

接下来我们简单地看一看这几篇文章。

▶胚胎发育染色质图谱◀

3月9日，Cell在线发表了中科院基因组所刘江、山东大学陈子江与广州医科大学三附院刘见桥合作团队完成的题为“Chromatin Accessibility Landscape in Human Early Embryos and Its Association with Evolution”的研究成果，首次报道了人类早期胚胎发育过程中染色质开放性逐步建立的过程，特别指出了人类胚胎合子基因组激活（zygotic genome activation，ZGA）过程中转录因子OCT4是必须的而小鼠中则是非必需。此外，该研究还从发育进化的角度来理解人类早期胚胎发育中基因和转座子的表达调控，具有重要的意义。

▲中科院基因组所刘江、山东大学陈子江与广州医科大学三附院刘见桥合作团队在《Cell》杂志上面发表的文章（图片来自CellPress）

研究哺乳动物早期胚胎染色质动态图谱来说，从技术上角度讲可以使用DNase I超敏感位点测序（DNase I hypersensitive site sequencing， DNase-Seq）或者利用转座酶研究染色质可接近性的高通量测序技术（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high-throughput sequencing，ATAC-Seq）。

为了研究人类早期胚胎发育中染色质的调控状态，研究人员收集了82对夫妇受精后二细胞、四细胞、八细胞、桑椹胚和囊胚阶段的细胞，通过DNase-Seq技术进行了分析。研究发现全基因组DNase I超敏感位点数量随着胚胎发育逐渐增加，说明染色质的可接近性也在逐渐增加，总的趋势和在小鼠中的结果高度相似。

▶十年磨一剑◀

《科学》杂志最新在线发表了一篇论文，介绍了上海交通大学赵立平、张晨虹和彭永德教授等人合作完成的重量级研究成果：利用多种膳食纤维的组合，改善了糖尿病人的肠道菌群，选择性地促进一组产短链脂肪酸细菌的富集，这组菌的丰度和多样性越高，血糖改善越好。

这是赵立平教授和团队的厚积薄发之作，在经过十几年的摸索和沉淀后，他们的研究成果终于登上世界最顶级的学术期刊。

▲上海交通大学赵立平、张晨虹和彭永德教授等人合作完成的重量级研究成果荣登《科学》杂志（图片来自Science）

研究者们将2型糖尿病患者分为两组：一组接受常规治疗的对照组（U组，最终入组16人），另一组接受高膳食纤维饮食干预的实验组（W组，入组27人）。

结果发现，两组患者的糖化血红蛋白比例（衡量血糖总体控制情况的指标），在起初都会出现明显下降，但从28天以后，W组的下降水平会更加显著。糖化血红蛋白达标的患者比例，W组也明显高于U组（89% vs 50%），此外W组的其他血糖指标、体重和血脂情况的改善也更好。

▲赵立平（图片来自热心肠日报）

这表明接受高膳食纤维饮食干预的2型糖尿病患者其病情改善。这背后的机制是什么呢？为何吃高膳食纤维饮食的2型糖尿病患者病情改善呢？

研究者们聚焦到了肠道微生物上面。研究结果表明，肠道菌群快速响应高膳食纤维信号，导致的代谢产物变化使得宿主代谢在随后发生变化。这样的时序差异不仅仅意味着膳食纤维改变的肠道菌群是宿主代谢改善的主要原因，而且提供了以肠道菌群为早期靶点预测饮食干预效果的可能。

▶从A到Z◀

1918年，由甲型H1N1流感病毒引发的 “西班牙流感”爆发流行，在全球超过5亿人感染，造成5千万到1亿人死亡，死亡人数甚至超过了第一次世界大战和第二次世界大战死亡人数的总和，可谓是世界历史上最严重的流行病疫情。

 而今，在“西班牙流感”暴发100周年之际，中国疾病预防控制中心主任高福院士应邀为国际顶级学术期刊《细胞》撰写评述文章“From ‘A’IV to ‘Z’IKV: Attacks from Emerging and Re-emerging Pathogens”，用生动的语言和详实的数据系统地评述了全球新发突发传染病形势及应对策略。

▲高福院士在《Cell》上发表的评述文章（图片来自CellPress）

高福院士在文章中指出经过SARS之后，中国已经建立起高效的病原监测与防控体系。而中国疾病预防控制中心作为政府举办的实施疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的国家级专业机构，自成立以来通过不断巩固相关基础研究，大力推进疾病预防控制的应用研究，在重大传染病的防治和疾病预防控制的基础、前沿技术研究方面取得了丰硕成果，并以此为支撑，在疾控基础平台体系建设、新发突发传染病应对、重大传染病和慢性病防控等方面取得了突出成绩。 

▶宏基因组发现新病毒◀

对中国疾病控制中心的张永振研究员也许并不陌生，在2016年，他领导的团队在病毒起源和进化的研究中取得重大发现。他们对九个动物门的超过220种无脊椎动物标本进行了宏转录组测序，发现了1445种全新的病毒，这些病毒的发现改变了当今病毒学的认识，填补了对生命起源的认识。当时发表在了《自然》杂志上面，多家国内著名媒体也迅速进行了头版报道。

▲中国疾病控制中心的张永振（Yong-Zhen Zhang）研究员在《Cell》上发表的评述文章（图片来自CellPress）

在这篇《Cell》评述文章中，张永振研究员指出人类对于病毒还只是了解了一小部分而已。地球上存在的很多病毒并未被发现，更别谈了解了。

张永振研究员在文中还指出，对于探索RNA病毒而言，宏基因组（metagenomics）方法能够比其他常用的发现病毒的方法覆盖更广的范围。并且，宏基因组学方法已经在发现自然界RNA病毒过程中发挥了重要作用。

参考资料：

1. Chromatin Accessibility Landscape inHuman Early Embryos and Its Association with Evolution.2018.

2. Gut bacteria selectively promoted bydietary fibers alleviate type 2 diabetes.2018.

3. From “A”IV to “Z”IKV: Attacks fromEmerging and Re-emerging Pathogens.2018.

4. Using Metagenomics to Characterize anExpanding Virosphere.2018.

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