蛋白组学常见研究模式 | 蛋白质组专题

蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象，研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。运用蛋白质组学技术可以大规模研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识。

本期专题将围绕蛋白质组学技术简介及应用场景展开，主要介绍蛋白相对定量技术、绝对定量技术以及蛋白修饰分析的原理及技术优势，蛋白组学常见研究模式，蛋白样本准备注意事项以及经典案例解读等。

今天内容主要为蛋白组学常见研究模式介绍。

一起开启学习模式吧~

蛋白组学常见研究模式主要有两种：

1.通过蛋白质组学寻找疾病发生发展的新型标志物；

2.结合其它组学建立疾病或者研究主题的表达谱和分子机制。

蛋白新型标志物挖掘

蛋白新型标志物挖掘基金中标项目汇总举例：

1.基于iTRAQ技术的阿尔茨海默病早期诊断血液生物标志物研究。

2.基于SISCAPA-MRM技术的定向蛋白质组学在肝癌血清生物标志物验证研究。

3.基于质谱的药物蛋白质组学研究血清生物标志物与赫赛汀疗效相关性及其分子机制。

4.基于蛋白质组学技术筛选急性主动脉夹层早期分子诊断标志物。

5.药物蛋白组学与AD生物标志物和药物新靶点研究。

6.基于稳定同位素标记定量蛋白组学的儿童哮喘中医证候血清标志物筛选与鉴定。

7.基于代谢组学蛋白质组学多组学技术的锌缺乏生物标志物筛选和代谢通路分析研究。

8.基于蛋白质组学检测的卵巢癌化疗耐药生物标志物的提取及机理研究。

标志物挖掘技巧：

1.Discovery set：小样本（≥20个）血清/血浆/尿液外泌体，做蛋白组；

2.换方法验证：差异标志物第一轮筛选（约有100个），第二轮筛选缩小到20个 candidate biomarker。如有组织样本可以取交集继续缩小范围；

3.Validition Set：扩大样本量（≥80-100个）同时进一步缩小candidate biomarker数量至3-5个，构建ROC曲线，与临床病理参数进行相关性分析来评价效果；

4.单分子研究：对某一个特别关心的蛋白进行深入的分子机制研究。

蛋白组和其他组学联合

蛋白组和其他组学联合分析基金中标项目

1.基于转录组学和血清蛋白质组学包虫病诊断标志物的筛选及其免疫应答机制的研究。

2.基于代谢组学和蛋白组学的朝医方“千金文武汤”治疗糖尿病肾病机制研究。

3.基于蛋白组学和代谢组学研究慢性高原病HAPH症的机制及香青兰干预后的作用靶点研究。

4.蛋白组学结合代谢组学揭示中药绞股蓝治疗代谢综合征的生物机制。

5.基于蛋白组学和代谢组学的皂苷类中药注射剂类过敏成分及监测方法研究。

6.TRAb对脑血管内皮细胞功能影响与Graves病小鼠延髓蛋白质组学及转录组学的研究。

蛋白组学专业期刊总览

综合期刊青睐蛋白组学汇总

Cell Metabolism

Blood

Circulation/Circulation Research

Cancer Research/Clinicial Cancer Research

Biomaterials

Cancer Cell

Nature Communications

Genome Research

Nucleic Acid Research

今天的内容分享完啦，大家记得收藏好慢慢学习哦~

相关阅读推荐