联川生物零基础生物信息培训班来了!!!
The following article is from 基因学苑 Author 王通
R语言培训课程已结束一星期,联川记录—R语言培训班结课(点击观看上期课程纪实)上期课程我们请到了曾任职华大基因高级讲师,具有9年以上生物信息工作经验,全网首位生物信息在线视频制作者王通老师,王通老师细致、幽默的讲课收获了学员的一致好评反馈。本期生物信息培训课程将继续由王通老师担任讲师!!!
本次培训依然采用五天教学,通过五天的系统学习,带您入门生物信息行业,让您熟练掌握Linux操作,测序原理,常用生物软件的使用,并能独立完成基因组,重测序,外显子分析等内容。让您对生物信息有一个全面的了解。培训之后,通过观看视频课程,继续使用服务器练习,巩固生物信息分析技能,让您今年彻底学会生物信息,助您尽快发表SCI。
课程特色:
1、真正的小班授课,本次培训只招25名学员,U型会议室,方便指导每个学员;
2、科学设计课程,循序渐进,课程包含Linux,测序原理,基因组分析,重测序分析,外显子等,适合零基础开始。
3、以完整项目为案例,通过亲自上手操作,快速掌握技能,五天完成1万行代码。
4、赠送32G优盘,含有大量生物信息学习资料,可继续巩固学习。
5、赠送半年生物云服务器(32线程,256G,24T)使用权限,可分析自己数据;
6、赠送100页以上纸质版讲义一份;
7、参加线下培训班学员默认为我们VIP会员,享有我们提供的VIP服务;
主讲老师:
王通:曾任职于华大基因,9年以上生物信息分析经验,擅长基因组,转录组,宏基因组,肿瘤基因组等数据分析。曾任华大基因高级讲师。2015年开始创业,主要做生物信息培训工作。国内最早生物信息教学视频制作者,已制作视频500集以上。首创视频+云服务器培训模式,目前已在北京,深圳,哈尔滨,杭州,武汉,南京,长春,广州,青岛等组织过多场培训班,线上线下累计学员超过4000多名。公众号“基因学苑”作者,已写作生物信息教程150多篇。
课程安排:
日期 | 主题 | 课程安排 |
第1天 | 生物信息学简介及Linux操作 | 生物信息学简介 Linux操作 xshell使用 传输文件 选项参数 目录结构 权限管理 编写脚本 进程管理 生物软件下载与安装 软件搜索下载 自行编译 bioconda管理生物软件 PATH变量 生物数据下载 参考序列下载 数据库下载 SRA数据下载 sratoolkit工具 edirect工具 |
第2天 (上午) | 测序原理 | 测序原理 一代测序 二代测序 三代测序 fastq文件格式 质量值体系 |
第2天 (下午) | 数据质控过滤 | 数据质控原理 利用fastqc进行数据质控 数据过滤原理 数据过滤操作 |
第3天 (上午) | 基因组拼接 | 查找基因组大小 如何制定测序策略 kmer估计基因组大小 基因组拼接原理 二代测序基因组拼接 三代测序基因组拼接 混合拼接 拼接结果统计 拼接结果评估 如何改善拼接效果 |
(下午) | 基因组分析 | 基因预测 ncRNA分析 重复序列分析 基因功能注释 基因家族分析 练习:鉴定一个未知物种 |
第4天 (上午) | 比较基因组分析 | 参考序列下载 屏蔽重复序列 全局比对 局部比对 多序列比对 构建系统发育树 利用iTol美化系统发育树 |
第4天 (下午) | 重测序基础 | 重测序基础 简化基因组 非人基因组重测序 参考序列屏蔽重复 bwa比对 bam详解 |
第5天 (上午) | 非人物种变异检测 | samtools工具 Tablet可视化比对结果 利用freebays筛选SNP vcf格式详解 bcftools工具 SNP分型 SNPeff注释工具 |
第5天 (下午) | 人全基因组分析 | 外显子测序 Panel测序 利用GATK进行变异检测 SV检测 CNV检测 利用IGV可视化变异结果 Annovar工具 利用clinvar数据库筛选致病突变 利用IGV可视化比对结果 |
根据现场情况适当调整进度
报名须知:
上课时间:2019年6月26—6月30日(五天)
上课地点:杭州(详细地址报名后统一发送)
请自带电脑(windows与mac系统均可)
付款方式:
培训费用:4900元
付款方式:对公转账
账户:杭州联川生物技术股份有限公司
账号:383158327308
开户行:中国银行杭州经济技术开发区支行
优惠政策:
往期培训班学员报名,每人优惠 200元
经往期学员推荐报名,可享优惠200元
注:以上优惠不可同享
报名方式:
1. 微信公众号报名:关注联川公众号,对话框回复:培训+姓名+单位+电话;
2. 邮件报名market@lc-bio.com:邮件主题“培训报名”,正文:姓名+单位+电话;
3. 委托联川驻各地科技代表报名;
4. 联系胡女士:hyqluna(微信号),黄女士:18506829175(微信号),或扫描二维码,直接报名预约。
常见问题:
1、零基础是否可以学会?
完全没有问题,我们本次培训班就是针对零基础学员,或者刚刚接触生物信息的学员,不要害怕自己是零基础,如果不学习,永远都是零基础。
2、上完课就能够自己做分析了吗?
可以,我们课上会演示大量操作案例,将脚本以及案例数据放到服务器上,只需要替换为自己数据即可完成分析。
3、赠送的服务器账号是做什么的?
生物信息分析需要大量的计算资源以及部署软件数据库,赠送的服务器在大家学习完成之后,可以使用该计算资源进行自己的数据分析,而无需继续购买计算资源和花费大量时间部署软件和数据库。
4、可以开发票吗?
可以,包括培训通知等,方便用户报销。
5、需要做哪些准备?
课程开始之前会发送在线视频和讲义,让用户预习Linux操作。
6、培训完后面有不会的问题怎么办?
生物信息学习是一样长期的任务,培训班结束了,学习并没有,我们有培训交流群,后续可以在群内继续交流学习。
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