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联川生物零基础生物信息培训班来了!!!

联川生物 2022-05-21

The following article is from 基因学苑 Author 王通

R语言培训课程已结束一星期,联川记录—R语言培训班结课(点击观看上期课程纪实)上期课程我们请到了曾任职华大基因高级讲师,具有9年以上生物信息工作经验,全网首位生物信息在线视频制作者王通老师,王通老师细致、幽默的讲课收获了学员的一致好评反馈。本期生物信息培训课程将继续由王通老师担任讲师!!!

本次培训依然采用五天教学,通过五天的系统学习,带您入门生物信息行业,让您熟练掌握Linux操作,测序原理,常用生物软件的使用,并能独立完成基因组,重测序,外显子分析等内容。让您对生物信息有一个全面的了解。培训之后,通过观看视频课程,继续使用服务器练习,巩固生物信息分析技能,让您今年彻底学会生物信息,助您尽快发表SCI。

课程特色

1、真正的小班授课本次培训只招25名学员U型会议室,方便指导每个学员;
2、科学设计课程,循序渐进,课程包含Linux,测序原理,基因组分析,重测序分析,外显子等,适合零基础开始。

3、以完整项目为案例,通过亲自上手操作,快速掌握技能,五天完成1万行代码。
4、赠送32G优盘,含有大量生物信息学习资料,可继续巩固学习。

5、赠送半年生物云服务器(32线程,256G,24T)使用权限,可分析自己数据;
6、赠送100页以上纸质版讲义一份;
7、参加线下培训班学员默认为我们VIP会员,享有我们提供的VIP服务;

主讲老师:

王通:曾任职于华大基因,9年以上生物信息分析经验,擅长基因组,转录组,宏基因组,肿瘤基因组等数据分析。曾任华大基因高级讲师。2015年开始创业,主要做生物信息培训工作。国内最早生物信息教学视频制作者,已制作视频500集以上。首创视频+云服务器培训模式,目前已在北京,深圳,哈尔滨,杭州,武汉,南京,长春,广州,青岛等组织过多场培训班,线上线下累计学员超过4000多名。公众号“基因学苑”作者,已写作生物信息教程150多篇。

课程安排:

日期

主题

课程安排

第1天

生物信息学简介及Linux操作

生物信息学简介

Linux操作

xshell使用

传输文件

选项参数

目录结构

权限管理

编写脚本

进程管理

生物软件下载与安装

软件搜索下载

自行编译

bioconda管理生物软件

PATH变量

生物数据下载

参考序列下载

数据库下载

SRA数据下载

sratoolkit工具

edirect工具

第2天

(上午)

测序原理

测序原理

一代测序

二代测序

三代测序

fastq文件格式 

质量值体系

第2天

(下午)

数据质控过滤

数据质控原理

利用fastqc进行数据质控

数据过滤原理

数据过滤操作

第3天

(上午)

基因组拼接

查找基因组大小

如何制定测序策略 

kmer估计基因组大小

基因组拼接原理

二代测序基因组拼接

三代测序基因组拼接

混合拼接

拼接结果统计

拼接结果评估

如何改善拼接效果


 第3天

(下午)

基因组分析

基因预测

ncRNA分析

重复序列分析

基因功能注释

基因家族分析

练习:鉴定一个未知物种

第4天

(上午)

比较基因组分析

参考序列下载

屏蔽重复序列

全局比对

局部比对

多序列比对

构建系统发育树

利用iTol美化系统发育树

第4天

(下午)

重测序基础

重测序基础

简化基因组

非人基因组重测序 

参考序列屏蔽重复

bwa比对

bam详解

第5天

(上午)

非人物种变异检测

samtools工具

Tablet可视化比对结果

利用freebays筛选SNP

vcf格式详解

bcftools工具

SNP分型

SNPeff注释工具

第5天

(下午)

人全基因组分析

外显子测序

Panel测序

利用GATK进行变异检测

SV检测

CNV检测

利用IGV可视化变异结果

Annovar工具

利用clinvar数据库筛选致病突变

利用IGV可视化比对结果

根据现场情况适当调整进度

报名须知:

上课时间:2019年6月26—6月30日(五天)

上课地点:杭州(详细地址报名后统一发送

请自带电脑(windows与mac系统均可)


付款方式:

培训费用:4900元
付款方式:对公转账

账户:杭州联川生物技术股份有限公司

账号:383158327308

开户行:中国银行杭州经济技术开发区支行


优惠政策:


  • 往期培训班学员报名,每人优惠 200元

  • 经往期学员推荐报名,可享优惠200元

  • 注:以上优惠不可同享

报名方式:

1. 微信公众号报名:关注联川公众号,对话框回复:培训+姓名+单位+电话;

2. 邮件报名market@lc-bio.com:邮件主题“培训报名”,正文:姓名+单位+电话;

3. 委托联川驻各地科技代表报名;

4. 联系胡女士:hyqluna(微信号),黄女士:18506829175(微信号),或扫描二维码,直接报名预约。

常见问题:

1、零基础是否可以学会?

完全没有问题,我们本次培训班就是针对零基础学员,或者刚刚接触生物信息的学员,不要害怕自己是零基础,如果不学习,永远都是零基础。


2、上完课就能够自己做分析了吗?

可以,我们课上会演示大量操作案例,将脚本以及案例数据放到服务器上,只需要替换为自己数据即可完成分析。


3、赠送的服务器账号是做什么的?

生物信息分析需要大量的计算资源以及部署软件数据库,赠送的服务器在大家学习完成之后,可以使用该计算资源进行自己的数据分析,而无需继续购买计算资源和花费大量时间部署软件和数据库。


4、可以开发票吗?

可以,包括培训通知等,方便用户报销。


5、需要做哪些准备?

课程开始之前会发送在线视频和讲义,让用户预习Linux操作。


6、培训完后面有不会的问题怎么办?

生物信息学习是一样长期的任务,培训班结束了,学习并没有,我们有培训交流群,后续可以在群内继续交流学习。


往期精彩回顾

【生物信息学】序列回帖和变异鉴定的分析演示 | 学习课

【生物信息学】隐马尔科夫模型 | 学习课

【生物信息学】隐马尔科夫模型 | 学习课

【生物信息学】从状态到马尔科夫链 | 学习课

云平台火山图使用指南 | 云课堂(27)

Cytoscape软件使用说明 | 云课堂(26)

云平台表格操作-信息提取专栏| 云课堂(24)

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