云平台在线绘制ROC曲线：单指标诊断、多指标联合诊断 | OmicStudio重磅云工具

ROC曲线（receiver operating characteristic curve）是一种评价二值分类器（binary classifier）的优劣的常见方法，在生物医学领域，现在主要应用于判断某因素对于疾病的诊断价值，筛选可靠的biomarker。联川生物ROC曲线工具现已开放，可以应用于单指标诊断效果、多指标效果比较及多指标联合诊断效果评估等，使用简单、应用广泛。

工具使用方法-单指标类型

1.打开云工具

首先打开联川生物云平台ROC工具：https://www.omicstudio.cn/tool/58，选择左侧开始绘制页面。

2.上传数据

打开工具是默认使用示例数据，如果需要使用自己的数据进行图片绘制，需要打开页面上方绘图数据的+，展开数据上传模块，然后分别上传输入数据和分组信息共两种表格。

输入数据表格格式如下（第一列为样本名称，第二列为指标丰度），也可以点击下载图标查看示例数据格式。

分组信息表格格式如下（第一列为样本名称，第二列为分组名称），也可以点击下载图标查看示例数据格式。

3.完成绘图

点击下方开始绘制按钮，稍等片刻即可完成图片绘制。

4.细节调整

图片的相关调整参数可以在下方参数调整进行修改。

（1）组别选择：ROC曲线分析的是二元分类模型，也就是只能包含两组类别，例如阴性/阳性，正常/疾病等，因此对于分组表格大于3组的数据，需要先选择两个分组。

（2）线条粗细：默认的线条粗细可以自行修改。

（3）区域多边形：对于单指标绘制的ROC曲线，可以进行区域多边形绘制，并自行选择颜色。

（4）平滑曲线：根据您的绘图需求，也可以将折线改成平滑曲线样式。

（5）置信区间：可以在非平滑曲线条件下，绘制置信区间，并自定义颜色和样式。

（6）图例位置：可以根据展示情况，自定义图例的位置。

5.图片下载

图片调整完毕后，可以点击结果下载的+图标，展开下载框，选择需要的图片类型，点击结果下载即可完成图片下载。

工具使用方法-多指标类型

疾病的诊断有时候需要多个指标联合才能做出诊断，在文献中也常用多种标记物数据进行联合诊断预测，本工具也可进行多指标的ROC曲线分析。

1.打开云工具

与单指标ROC曲线绘制方法相同。

2.上传数据

与单指标ROC曲线绘制方法相同。

输入数据表格格式有所区别：第一列为样本名称，第二至n列分别为多个指标丰度。

分组信息与单指标ROC表格格式相同：第一列为样本名称，第二列为分组名称。

3.完成绘图

点击下方开始绘制按钮，稍等片刻即可完成图片绘制。

默认绘制出来的是多条ROC曲线，可以用于比较两个或多个标志物的诊断价值优劣，曲线下面积（AUC值）越大，代表分类器效果更好。

当AUC＝0.5时，说明诊断方法无诊断价值，AUC越接近于1，说明诊断价值越高：  

AUC在0.5-0.7时，诊断价值较低；  

AUC在0.7-0.9时，有一定诊断价值；  

AUC在0.9以上时，诊断价值较高。

4.多指标联合

在左侧参数选择进行逻辑回归，即可将示例数据中的两个指标联合诊断，右下角图例中显示了联合诊断的AUC值，可以查看联合诊断效果。

5.图片下载

图片调整完毕后，展开结果下载框，选择需要的图片类型，点击结果下载即可。

相关阅读