【疯狂7月】⑧—免费在线小工具-突变分析系列：SNP突变类型图 | 云平台

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前言

之前我们分别介绍了突变信息的汇总图表小工具：

SNP（单核苷酸突变性）是突变分析的一块基础内容，本工具就聚焦于SNP的统计分析。

输入数据格式说明

参见 免费在线小工具-突变分析系列：突变注释信息汇总。

图片意义解读

左上图：碱基突变情况的统计，类似的图片在【突变信息摘要图】中也出现过。

右上图：碱基颠换和转换的比例，Ti指转换（嘌呤被嘌呤替代，嘧啶被嘧啶替代），Tv指颠换（嘌呤与嘧啶之间的替代）。

下图：所有样本中碱基突变比例，颜色与箱线图对应。箱线图（左上）呈现的是所有样本总的突变情况，百分比柱状图（下）呈现的是每个样本中突变的情况。类似的图片在【瀑布图】中也出现过。

参数说明

绘制图片类型：如图，可以只绘制部分图片。

样本Barcodes：决定是否显示样本，以及样本字号。

绘制箱线图刻痕：效果如下。

拓展分析

SNP突变类型分析只是突变分析中的基础内容，还有很多其他工具可以用于进一步挖掘数据，分析完成后，会自动跳出侧边栏，点击可直接进行下游分析，无需重新上传文件：

如我们点击一个【降雨图】分析，在弹框中点击跳转：

跳转后会提示文件传送成功，背景中的图片就是用您的文件进行绘制的结果（而不是示例数据啦）

更方便的是，在此分析完成后，您可以继续跳转完成其他拓展分析：

其他拓展分析我们会继续发文进行介绍，欢迎关注本公众号获取更多信息：

云工具

地址：https://www.omicstudio.cn/tool/74

参考资料

http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/maftools/inst/doc/maftools.html

参考文献

Mayakonda A, Lin DC, Assenov Y, Plass C, Koeffler HP. 2018. Maftools: efficient and comprehensive analysis of somatic variants in cancer.

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