做口腔菌群研究,你还缺少什么?
常言道,病从口入,微生物同样会从口入。口腔菌群是人体内第二大共生菌群,仅次于胃肠道菌群。越来越多研究证实,口腔菌群在人类健康维持与疾病发生发展中发挥非常重要的作用。口腔菌群不仅在牙周病、口腔癌等口腔疾病中发挥重要作用,还与心血管疾病、类风湿性关节炎以及肿瘤等全身性或慢性系统疾病密切相关(图1)[1]。口腔菌群还可以通过消化道或血液循环等途径迁移至身体的其他部分引发感染和局部炎症。不仅如此,口腔菌群和肠道菌群也存在着相互联系和作用,即存在口腔-肠道微生物群轴(Oral–Gut Microbiome Axis)(图2)[2]。由此可见,口腔菌群的研究场景和临床应用价值十分广阔,值得更多地探索。
图1 口腔菌群相关的口腔和全身性疾病
图2口腔细菌从口腔转移到肠道的可能途径
口腔菌群有其自身的特点,在研究中除了使用微生物组研究的一般方法外,也需要根据口腔菌群的特点,做个性化的调整。比如口腔菌群会定植在不同的口腔生态位,比如唾液、舌头、口腔粘膜、牙齿表面和牙周组织,每个生态位都有不同的微生物群落组成,为此,根据不同的研究目的,应选择不同的生态位的口腔菌群做研究。又比如口腔菌群明显不同于肠道菌群,在口腔菌群的鉴定上,又应该注意哪些事项。还有做口腔菌群研究,闭门造车肯定不行,需要了解国内外都做过哪些研究方向,并且已经有了哪些研究发现,等等。然而,目前很少见到有一套从实战出发,系统介绍怎样开展口腔菌群研究的指导资料。
为此,我们围绕实战中老师们高频关心的问题,精心收集资料,融入项目经验,编写了《口腔菌群研究手册1.0》。1.0版手册包括五个章节(含附件),分别是第一章菌从口入,介绍口腔菌群的研究背景和研究策略;第二章口腔菌群研究应重视的事,介绍口腔菌群研究应收集的临床信息以及不同采样部位的优缺点;第三章口腔菌群的5个研究方向,分别是口腔菌群与口腔疾病的关系,口腔菌群与全身性疾病的关系,口腔-肠道微生物群轴,口腔菌群生物标志物,以及生活方式、种族对口腔菌群的影响;第四章口腔菌群研究思路解析,借助代表性案例来解析其中的研究思路;附件口腔菌群样本采集指南,特别致谢微生物组实验手册(Microbiome Protocols eBook, MPB)项目组的卓越工作,为科研工作者提供了一套详实可靠的微生物组包括口腔菌群在内的样本采集指南(图3)
图3 《口腔菌群研究手册1.0》
我们会持续更新《口腔菌群研究手册》。欢迎读者发送感兴趣的口腔菌群相关的问题过来,我们将选出共性的问题做详细解答,并在下次手册更新时收录进去。我们将寄送一份精美礼品给提出精彩问题的读者,以表感谢。
参考文献
1.Willis JR, Gabaldón T. The Human Oral Microbiome in Health and Disease: From Sequences to Ecosystems. Microorganisms. 2020 Feb 23;8(2):308.
2.Kitamoto S, Nagao-Kitamoto H, Hein R, et al. The Bacterial Connection between the Oral Cavity and the Gut Diseases. J Dent Res. 2020 Aug;99(9):1021-1029.
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