口腔菌群研究方向（2）：口腔菌群与口腔疾病间的关系 | 微生物专题

口腔微生物组极其复杂，成年人的口腔中平均含有约50至1000亿个细菌。这些细菌代表了约200种主要细菌种类，总共有大约 700 个主要分类群，与其他身体部位相比，口腔微生物组是独一无二的，采样方式（MPB：口腔菌群主要取样部位及方法 | 微生物专题）无创简单，容易获取。HOM（人类口腔微生物组数据库）包含 400 种口腔分类群的描述、1300多种微生物菌株的基因组序列和16S rRNA鉴定工具，是学者研究口腔微生物在健康与疾病中作用的重要工具！

在口腔环境中，可以绘制5个独特的生态位：唾液、舌头、口腔粘膜、矿化的牙齿表面和牙周组织，每个生态位都有不同的微生物群落（图1）。坚硬牢固的牙齿和牙釉质是口腔微生物膜生长成熟的基础舌头是菌群居住最多的生态位，对口腔其他区域有显著影响。在唾液的帮助下，舌头上的微生物经常在口腔内活动，并在其他区域定居。有些口腔菌群不易在口腔中定植，随着唾液进入到下消化道中，与肠道微生物共同作用（口腔菌群研究方向(1)：口腔-肠道微生物轴 | 微生物专题）调节身体健康或导致疾病的发生。

图1：口腔菌群不同的生态位[1]

口腔微生物组在人类微生物群落稳定以及人体健康中发挥了重要的作用。口腔中微生物协同相互作用，帮助宿主抵抗外界不良刺激的侵袭，当微生物群失衡时可能会导致龋齿、牙周炎等口腔疾病的发生。龋齿是最常见的慢性传染病，以细菌为主要病原体，在多种因素作用下可导致牙齿硬组织的慢性、渐进性破坏。龋病范围广，发病率高，可发生于任何年龄，从儿童到老年人。使用人类口腔微生物鉴定微阵列 (HOMIM) 来比较严重早期儿童龋齿 (SECC) 和无龋儿童的唾液和龈上菌斑样本中的细菌谱。学者发现包括链球菌、卟啉单胞菌和放线菌在内的几个属与 SECC 密切相关。

牙周病在人的口腔中经常发生，可分为牙龈病和牙周炎两大类。牙周病会导致牙周组织（牙龈和牙槽骨等牙齿支持组织）的破坏，并构成某些全身性疾病的潜在危险因素。通过对广泛性侵袭性牙周炎、广泛性慢性牙周炎、种植体周围炎、局部侵袭性牙周炎等病人口腔微生物的鉴定，发现所有病人中都包含高水平的巨核梭杆菌。

口腔癌的主要发生发展因素包括基因突变、细菌失衡和机体状态改变等，目前研究证明口腔癌与口腔微生物之间存在联系。健康组和口腔癌患者口腔微生物组成对比发信啊，在口腔癌患者中需氧菌和厌氧菌数量显著增加，多种细菌如芽孢杆菌、肠球菌、细小单胞菌、消化链球菌存在显着差异。

研究口腔微生物组及其与不同身体部位和不同健康状况的全身微生物组的相互作用对于我们对人体的认知以及如何对人类健康产生影响至关重要。

图2：口腔微生物组与口腔疾病[6]

口腔菌群与口腔疾病研究思路解析

我们精选2篇口腔菌群的文献，对其中的样本分组、研究方法、研究思路（从单组学到多组学）、入组与排除标准、以及研究发现进行了细致的解析，以帮助您更快地掌握口腔菌群与口腔疾病研究的主流思路。

1口腔癌变过程中唾液微生物群的分类和功能失调

据报道每年口腔癌在全世界造成约180,000人死亡。根据以往的研究可知口腔细菌以及其他已知的风险因素如吸烟、酗酒、嚼槟榔等都与口腔癌的发生发展相关。口腔癌变是口腔微生物群改变的关键因素，反过来微生物群失调可能会加剧宿主的疾病进展。虽然口腔癌与微生物之间存在联系，但微生物群对于癌变的反应以及生态特征尚未得到很好的研究。

发表期刊：Frontiers in Cellular and Infection Microbiology影响因子：5.293发表时间：2021样本数量：75名男性受试者（27名健康受试者，21名口腔疣状增生患者，27名口腔鳞状细胞癌患者） 样本类型：唾液实验方法：16S rRNA基因测序 

实验思路：

筛选标准：入组前一个月未接受抗生素治疗或者手术治疗

实验结果：通过对不同口腔癌患者和健康受试者唾液样本中微生物组成的分析，文章作者发现患病人群中微生物的系统发育多样性降低，并且口腔癌是核心微生物组改变的主要因素。口腔菌群改变的部分原因可归结为宿主的炎症反应以及对口腔疣状增生和口腔鳞状细胞癌的免疫反应。

正常、OVH 和 OSCC 队列中口腔微生物组的差异

2龈下微生物组和特殊分解脂质代谢通路与牙周炎症相关

牙周炎是一种由细菌引起的炎症性疾病，其特征是牙龈炎症和牙槽骨破坏。牙周炎患者口腔微生物群发生变化，而当牙周炎症得到控制后口腔环境恢复，不再适合牙周病原体生长时，共生微生物群可以在与宿主的稳态关系中重新建立。炎症消除由特定的促消解脂质介质（SPM）介导，它们与各种细胞上的特定G蛋白偶联受体结合。SPM诱导的炎症消退可以影响牙周炎中龈下微生物的组成。但该通路及通路标志物的水平变化与龈下微生物的关系尚不明确。

发表期刊：Frontiers in Immunology影响因子：7.561发表时间：2021样本数量：13名牙周健康受试者+15名牙周炎患者 样本类型：牙龈活检组织样本（脂质代谢组学）+牙龈下菌斑（16S rRNA基因测序）实验方法：代谢组学、16S rRNA基因测序 

实验思路：

筛选标准： 

实验结果：本文分析了13名牙周健康受试者和15名牙周炎受试者的脂质介质水平、SPM 受体基因表达和龈下微生物组数据。通过分析脂质介质水平、受体基因表达和细菌丰度之间的相关性发现，三组中脂质介质、受体基因和龈下微生物组的特征不同，脂质介质谱和龈下微生物组谱之间存在最强的相关性。在不同的牙周病况下，多种脂质介质和细菌种类高度相关（相关系数≥0.6）。脂质介质、受体基因和龈下微生物组的特征与牙周炎症相关并相互关联，表明脂质介质介导的炎症影响牙周炎中的微生物组成。

三组样本微生物种类和脂质介质之间的相关性

除了这篇精读的文献之外，我们在2020~2021年超过100篇的口腔菌群研究文献中筛选出了口腔疾病相关的高分文章，供您参考。 

除了上述的文章解读、调研之外，我们围绕实战中老师们高频关心的问题精心收集资料，融入项目经验，编写了《口腔菌群研究手册1.0》！为您的口腔菌群研究之路保驾护航！

参考文献1. Costalonga M, Herzberg MC. The oral microbiome and the immunobiology of periodontal disease and caries. Immunol Lett. 2014;162(2 Pt A):22-38. doi:10.1016/j.imlet.2014.08.0172.  Chen JW, Wu JH, Chiang WF, Chen YL, Wu WS, Wu LW. Taxonomic and Functional Dysregulation in Salivary Microbiomes During Oral Carcinogenesis. Front Cell Infect Microbiol. 2021;11:663068. Published 2021 Sep 16.3. Choi DH, Park J, Choi JK, et al. Association between the microbiomes of tonsil and saliva samples isolated from pediatric patients subjected to tonsillectomy for the treatment of tonsillar hyperplasia. Exp Mol Med. 2020;52(9):1564-1573.4. Willis JR, Gabaldón T. The Human Oral Microbiome in Health and Disease: From Sequences to Ecosystems. Microorganisms. 2020;8(2):308. Published 2020 Feb 23. doi:10.3390/microorganisms80203085. Krishnan K, Chen T, Paster BJ. A practical guide to the oral microbiome and its relation to health and disease. Oral Dis. 2017;23(3):276-286. doi:10.1111/odi.125096. Gao L, Xu T, Huang G, Jiang S, Gu Y, Chen F. Oral microbiomes: more and more importance in oral cavity and whole body. Protein Cell. 2018;9(5):488-500.

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