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BGISEQ LncRNA助力发13分文章,还有限时优惠!

王佳 华大科技BGITech 2019-06-02


BGISEQ LncRNA助力发13分文章


2019年1月8日,中国科学技术大学单革教授实验室,在《Genome Biology》上发表了名为《Systematic evaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants》的文章,影响因子13.2。这项研究颇具开创性,第一次在多细胞动物秀丽隐杆线虫中利用CRISPR-cas9技术,对155个已知的基因间区长链非编码RNA(lincRNA)进行敲除,发现23个lincRNA突变体会影响线虫的生理表型,并系统完成其生理功能及机制的研究。这篇文章选用的正是BGISEQ LncRNA测序。


图1 文章lncRNA数据上传GEO数据库



应用趋势


lncRNA的作用机制、研究方法丰富,一直被广泛重视,国家投入的科研力度也逐年加大。2018年lncRNA相关国自然基金项目共387项,累计资助金额近1.58亿元。《2018研究前沿》报告中,将“长链非编码RNA与肿瘤进展及预后关系”列为临床医学领域11个新兴前沿的第4名。

图2 lncRNA相关国家自然科学基金中标金额统计


图3 lncRNA相关国家自然科学基金年度中标量统计

(数据来源于科学网 http://fund.sciencenet.cn)


图4 2018年临床医学领域的11个新兴前沿

 


产品升级


通过不断优化升级,BGISEQ LncRNA全新产品上线,一次测序了解lncRNA、mRNA信息,开启RNA研究新时代。新品的交付周期比原产品至少缩短一周,且价格大幅度优惠,更有高数据质量作为基础保障。

 

定量准确性高

BGISEQ LncRNA测得人标品(UHRR)的mRNA定量结果,与qPCR相关性高,大于0.88,可与转录组测序相匹敌。对于低表达丰度的mRNA定量结果同样准确,与qPCR相关性达0.81以上,与H平台表现一致。


图5 人标品(UHRR)mRNA定量与qPCR相关性


图6 人标品低丰度mRNA(RPKM<200)定量与qPCR相关性

 

组装效果优

当测序数据量相同时,BGISEQ LncRNA的组装结果更有优势。以BGISEQ平台及H平台各自测得的人标品(UHRR)数据为例,取相同原始数据量,过滤、比对后组装,比较mRNA在外显子水平上的一致性,对比所有已知mRNA的组装情况,BGISEQ平台组装出一致性高的mRNA数目更多


图7  BGISEQ平台与H平台数据组装结果分析


技术重复性强

以人标品(UHRR)为例,分别用两个平台测序,进行相关性分析。BGISEQ平台建库、测序的技术重复性高达99.8%,与H平台间相关性也在0.9以上。


图8 BGISEQ平台与H平台技术相关性


活动信息

BGISEQ LncRNA全新上市,

1月31日前,新品6.6折

欢迎详询各地科技代表



“中国智造”BGISEQ平台优势


2015年,华大实现了高通量测序仪国产化,打破了国外对测序上游技术的垄断。自主测序仪BGISEQ从“出生”到规模化生产,掌控核心技术,不断优化,让“质优价低”的高通量测序成为可能。


随着自主平台深入人心,华大科技服务也不断推陈出新,陆续推出BGISEQ系列产品,现已有9大类产品为科研伙伴助力。据不完全统计,包括《Nature》《Cell》等顶级期刊文章在内,BGISEQ平台产品共助力发表文章146篇。


撰稿:王   佳

编辑:市场部


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