单细胞数据分析环环相扣，步步惊心？看视频学Dr. Tom多组学数据挖掘系统，一招解决！
随着高通量单细胞测序研究技术快速发展，高性价比优势促使单细胞研究成功进驻“寻常百姓家”。实验易做，测序数据易得，但如此庞大的单细胞数据，该如何高效分析？懂得数据分析的正确打开方式，才能捕获信息的真实及全貌。
科技君
前两周的“开讲了单细胞”，科技君介绍了样本前处理、图谱研究分析技巧，为大家解析了多个关键问题点。
科技君
本周，科技君将为大家介绍华大Dr. Tom多组学数据挖掘系统！
无需生信分析基础，可实现图谱随心定制，图表全面交互。
科技君
做单细胞数据分析，难免会遇到各种各样的问题，快和科技君一起看看如何解决这些问题！
Part.1
细胞聚类结果太多，
无法修正，怎么办？
（点击视频可放大观看）
科技君划重点：
Dr. Tom多组学数据挖掘系统，细胞聚类参数按需调整，随心定制二次聚类。
细胞筛选方式：可以选择满足一定基因个数（默认＞200）和线粒体比例（默认≤5%，肝脏等线粒体比例较高样本可适当提高该参数）的细胞进行重新聚类；
定义高变基因：对所选细胞的高度变异基因数进行定义，建议500-5000之间，默认为2000；
细胞聚类方法：可选UMAP或t-SNE；
Marker基因计算方法多种选择：包括wilcox（默认）、MAST、LR、poisson、negbinom、t-检验和bimod。
Part.2
细胞注释不符合预期，
需要更换软件数据库，怎么办？
（点击视频可放大观看）
科技君划重点：
Dr. Tom多组学数据挖掘系统，提供三种类型注释工具，实现多维注释结果供您选择。
细胞注释工具包括：
SCSA（对应数据库为CellMarker，并支持自定义上传Marker数据库）
SingleR
SciBet
Part.3
拟时间分析不用全部细胞，
只想分析某些细胞亚群，怎么办？
（点击视频可放大观看）
科技君划重点：
Dr. Tom多组学数据挖掘系统，任意点选多个目的细胞类群，轻松绘制拟时间轨迹。
单击聚类图页面右上角图标，可实现在单选和多选间切换，进一步可选择单个或多个细胞亚群后进一步采用小工具进行拟时间分析，详见视频讲解。
让单细胞更简单
下周，科技君将继续为大家带来单细胞研究全流程关键点分享，且听且珍惜哦！
更多关于华大科技单细胞全流程服务介绍，请锁定“开讲了单细胞”，华大科技小讲堂与您不见不散~
供稿：小春、豆儿
编辑：市场部
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