IF 38!重磅综述,总结代谢组在精准医学中的应用
2023年3月20日,一篇题为“Small molecule metabolites: discovery of biomarkers and therapeutic targets”的综述论文发表于Signal Transduction and Targeted Therapy(IF=38.104)。该文正文15,468字,参考文献800+篇,全面阐述了代谢组在生物研究中的重要作用、主要的研究方法以及在医学领域的广泛应用。
代谢物是代谢过程的最终产物或中间体,与生物系统的表型密切相关,控制表型功能的调节,因此比其他“组学”(如转录组学、蛋白质组学或基因组学)更能反映身体表型。探索代谢组有助于增强疾病诊断、预后、监测和个体化治疗。文章从诊断生物标志物、疾病分类和分层、预后生物标志物、代谢途径、精准治疗、调节新陈代谢、生化活性、探索代谢网络、药物功效评价、活性成分发现、活性成分的代谢过程、代谢稳态和肠道微生物群等多个研究方向介绍了代谢组在精准医学中的应用前景。
接下来,科技君将给大家简单分享下文中生物标志物部分内容。
代谢紊乱或功能失调的征兆表现为代谢物浓度异常,在疾病发现阶段可通过代谢信息找到新的疾病生物标志物和靶点。已有很多研究发现并利用各种代谢物作为生物标志物来检测早期疾病,预测疾病进展、临床结果或药物反应等(图1和表1)。
图1 具有代表性的潜在代谢物生物标志物
表1 临床研究中与疾病相关的代谢物和代谢途径
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更多文章内容可查看原文:
https://www.nature.com/articles/s41392-023-01399-3#Sec5
代谢变化通常先于重要的生理变化发生,因此早期诊断是代谢组学的优势之一。近年来,随着高通量技术的出现,代谢组学也得到了长足的发展,非靶向代谢组学、靶向代谢组学、广泛靶向代谢组学、高通量靶向代谢组学、空间代谢组学等代谢组学技术接踵而至。多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等)技术的联合使用更是为疾病相关生物标志物的发现与机制探究等提供了有力的研究手段,成为近年来的研究热点。华大质谱平台深耕于代谢组学研究领域十余年,紧跟前沿技术,持续推出代谢组学新产品,满足广大科研工作者的需求。
华大科技提供代谢组学服务
华大科技提供一系列代谢组学产品助力精准医学研究,包括非靶向代谢组学、脂质组学、高通量靶向代谢组学HM Pro2300/HM700/HML1600、靶向代谢组学以及代谢组相关多组学关联分析等。
1. 非靶向代谢组学
非靶向代谢组学适用于研究代谢物的全局变化,可以无需事先了解代谢物的信息,系统地检查代谢物的整体水平。这种方法通常用于生物标志物的发现、代谢途径的探索、环境暴露评估等研究。
非靶向代谢组学产品优势
两大标准品数据库
华大自建库(BGI library,含保留时间、一级质谱、二级质谱信息),mzCloud数据库(化合物2万+,内源性代谢物3,000+);
领先的质谱及分析平台
使用Thermo Scientific Q Exactive、Q Exactive HF等QE系列的高分辨质谱仪进行检测;Compound Discoverer软件进行分析;
鉴定效果佳
代谢物鉴定数可达到2,000+,鉴定数量多、准确度高、覆盖各类型内源代谢物;
大样本经验丰富
高通量自动化样本制备,成功检测单个项目2,000例队列样本;
分析内容丰富
正负离子数据整合展示,减少数据冗余,图表呈现形式多样;
深度挖掘
采用Dr. Tom交付,提供多组学关联,助力数据挖掘。
查看相关应用场景请点击:科研遇到瓶颈?来看这篇非靶向代谢组学文章解解惑!
2. 靶向代谢组学
靶向代谢组学适用于研究特定几十种代谢物或代谢途径的变化,高通量靶向代谢组学可以一次性对数千种代谢物进行靶向检测分析,且无需后续验证。这种方法通常用于疾病诊断、药物开发、生物标志物研究等领域。
靶向代谢组学产品列表
HM Pro2300高通量靶向代谢组学产品优势
超高通量
一次性靶向检测2,000多种代谢物,400+种肠道菌群相关代谢物;
高灵敏度
小分子物质通过衍生化处理;有效区分脂质同分异构;
精准定量
外标+内标绝对定量,小分子配高、低两条标曲;
指标可选
可选择只检测亲水性小分子(HM700)或脂质(HML1600);
分析智能
自动识别信号峰,兼具准确与高效,尤适合于大规模队列研究;
深度挖掘
采用Dr. Tom交付,提供多组学关联,助力数据挖掘。
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3. 代谢组学相关多组学关联分析
多组学关联分析可以将代谢组学数据与其他组学数据(如微生物组、蛋白质组学、转录组学等)相结合,从而更全面地了解生物体内的代谢过程,发现潜在的生物标志物。
多组学关联分析产品优势
经验丰富
关联分析研究经验丰富,在Nature等高分期刊上自主及合作发表多篇文献;
关联分析全面
充分挖掘两组学的特征数据,分析内容丰富,层次分明,逻辑充整;
一站式服务
提供代谢组和微生物组、转录组、蛋白质组等多组学关联分析服务;
Dr. Tom交付
代谢组+宏基因组关联分析上线Dr. Tom,自主即可进行关联分析。
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邮箱:info@genomics.cn
参考文献:
Qiu S, Cai Y, Yao H, Lin C, Xie Y, Tang S, Zhang A. Small molecule metabolites: discovery of biomarkers and therapeutic targets. Signal Transduct Target Ther. 2023 Mar 20;8(1):132. doi: 10.1038/s41392-023-01399-3.
供稿:翎儿
编辑:市场部
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