重磅丨华大基因正式推出安馨可®新生儿遗传病基因筛查服务

编者语

2月28日是国际罕见病日，罕见病是指发病率极低的疾病。2002年美国通过的《罕见病法案》将罕见病定义为在美国患病人数低于20万人的疾病；欧盟对罕见病的定义是危及生命或慢性渐进性疾病等患病率低于1/2,000的疾病；2018年中国国家卫生健康委员会等5部门联合发布了《第一批罕见病目录》^[1]，是中国首次以疾病目录的形式界定罕见病，中国罕见病患者预计超过1,680万^[2]。

目前，已经明确的罕见病有7,000多种，其中80%认为跟遗传因素相关^[3]。罕见病不等于不治之症，对于部分有一定治疗方法且遗传致病基因明确的疾病，可在新生儿期通过基因检测进行筛查，对疾病进行及早诊断与治疗，可改善患者生活质量，减少疾病对患者及家庭造成的影响。

凭借多年遗传病检测与分析的丰富经验，在中国《第一批罕见病目录》、美国医学遗传学与基因组学学会 (ACMG) 提出的新生儿筛查疾病标准 (RUSP)^[4]及国内外新生儿筛查疾病谱的基础上，华大基因安馨可^®新生儿遗传病基因筛查服务严格筛选出更符合中国人群的筛查疾病谱，可实现常见遗传代谢病、耳聋、地中海贫血、杜氏肌营养不良症 (DMD)、脊髓性肌肉萎缩症 (SMA) 等156种疾病的一站式筛查。通过新生儿遗传病基因筛查，及早发现可疑患者，并进行诊断与治疗，减少甚至避免由于疾病带来的不可逆严重后果，以基因科技的力量为宝宝的健康保驾护航。

安馨可^®新生儿遗传病基因筛查服务的疾病选择参考了国内外新生儿筛查疾病谱，结合中国《第一批罕见病目录》，从中筛选出在新生儿或儿童早期发病的、致病基因明确及有治疗方案的疾病，同时检索分析相关基因2000年至今在中文和英文学术期刊报道的中国人病例文献1,500余篇，去除了国内极罕见基因相关疾病或疾病亚型，正式推出更符合中国人群特点的156种疾病159个基因的筛查服务，囊括中国常规新筛项目中可通过高通量测序检测的疾病，还包含了地中海贫血、DMD、SMA等变异类型复杂的常见遗传疾病，综合性价比极高。

利用高通量测序技术优势，可对检测范围内159个目标基因的所有编码区进行捕获测序，同时分析点突变、小片段插入缺失 (≤20bp) 以及部分基因外显子水平的缺失/重复，提高筛查有效性。安馨可^®新生儿遗传病基因筛查服务的核基因组有效测序深度≥100X，线粒体基因有效测序深度≥300X，针对点突变检测灵敏性、特异性、准确性>99%，对于地中海贫血、SMA、DMD等以复杂变异致病为主的疾病，华大基因进一步优化探针设计并应用大数据校正的分析算法，可分析常见拷贝数变异 (CNV)^[5-7]，为临床提供更全面精准的检测服务。

基于标准品评估的灵敏性、特异性、准确性

对检测范围内的159个基因，参照已有的病例报道文献1.8万篇，全球权威公共数据库ClinVar、HGMD致病位点收录及华大遗传病位点数据库，根据ACMG/AMP变异致病性判定指南及相关细则^[8-12]进行精准解读，并通过双人复核等流程优化，打造新生儿基因筛查变异位点库，目前收录致病及疑似致病变异超1万个，充分提高筛查结果的解读效率，为临床疾病诊断与治疗争取更多时间。

华大拥有完全自主知识产权及国际先进水平的高通量基因测序平台，所生产的测序仪符合国家药品监督管理局制定的《高通量测序仪标准》(标准编号：YY/T 1723-2020)。在核酸提取、文库构建、上机测序、信息分析、报告发放等各个环节执行严格的质控标准，保证检测结果的准确性，对每一份样本负责。

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结  语  

对于单一病种的新生儿基因筛查已不鲜见，目前国内已有耳聋、脊髓性肌肉萎缩症、地中海贫血等疾病的新生儿筛查^[13-15]，但这些筛查项目的病种有限。2017年，全球基因组学与健康联盟监管与伦理工作组儿科团队建议，可将基因检测应用于新生儿疾病筛查，高通量测序可作为当前一级筛查的有效补充^[16]。高通量测序可实现一次实验检测几十种甚至几百种疾病，提高筛查效率，降低单病种筛查成本，使更多的可治性遗传病得到早诊断、早治疗。

2020年，中国学者的一项研究对1,127名新生儿进行严重遗传疾病相关573个基因筛查，并与临床生化检查结果对比，其中4例生化提示异常的患者均能通过基因检测进行确诊，基因检测还额外发现1例原发性肉碱缺乏症阳性，该例后续召回确诊为患者，高通量测序可提高新生儿筛查的有效性，降低漏诊率^[17]。

新生儿筛查在中国已开展40年，从最开始的一个方法筛查一种疾病，发展到生化筛查几十种代谢疾病，但只有生化筛查是不够的，很多疾病的根源在于基因。新生儿基因筛查可扩大遗传病筛查谱，并提高疾病的诊断和鉴别诊断效率，基因筛查将是新生儿筛查的重要组成部分。2021年1月，由上海交通大学医学院附属新华医院牵头的中国多中心新生儿遗传病基因筛查项目正式启动，华大基因作为技术实施单位助力项目顺利开展及进一步开拓中国新生儿基因筛查的道路。今天，在2021年国际罕见病日，华大基因正式发布安馨可^®新生儿遗传病基因筛查服务，发挥华大高通量测序技术优势和多年遗传病检测的丰富经验，为中国的新生儿打造更适合中国人群特点的156种疾病159个基因的筛查服务，通过一站式、高性价比的检测服务，用科技的力量为我们的下一代健康保驾护航。

拓展阅读

参考文献：

[1] 国家卫生健康委. 关于公布第一批罕见病目录的通知：国卫医发〔2018〕10号.

[2] 丁洁, 王琳. 中国罕见病研究报告（2018）. 北京：中国医药科技出版社, 2018.

[3] Krissi, Danielsson, Jun L, et al. Next-generation sequencing applied to rare diseases genomics. Expert review of molecular diagnostics, 2014.

[4] Watson M S, Mann M Y, Lloyd-Puryear M A, et al. Newborn screening: Toward a uniform screening panel and system - Executive summary. Pediatrics, 2006, 117(5):S296-S307.

[5] Shang X, Peng Z, Ye Y, et al. Rapid Targeted Next-Generation Sequencing Platform for Molecular Screening and Clinical Genotyping in Subjects with Hemoglobinopathies. EBioMedicine. 2017;23:150-159.

[6] Zhao S, Wang W, Wang Y, et al. NGS-based spinal muscular atrophy carrier screening of 10,585 diverse couples in China: a pan-ethnic study. Eur J Hum Genet. 2021;29(1):194-204.

[7] Dai Y, Wei X, Zhao Y, et al. A comprehensive genetic diagnosis of Chinese muscular dystrophy and congenital myopathy patients by targeted next-generation sequencing. Neuromuscul Disord. 2015;25(8):617-624.

[8] Richards S, Aziz N, Bale S, et al. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genetics in medicine, 2015, 17(5): 405.

[9] 遗传变异分类标准与指南.中国科学:生命科学,2017(06):76-96.

[10] Biesecker L G, Harrison S M. The ACMG/AMP reputable source criteria for the interpretation of sequence variants. Genetics in Medicine, 2018, 20(12): 1687.

[11]  Gelb B D, Cavé H, Dillon M W, et al. ClinGen’s RASopathy Expert Panel consensus methods for variant interpretation. Genetics in Medicine, 2018, 20(11): 1334.

[12]   Zastrow D B, Baudet H, Shen W, et al. Unique aspects of sequence variant interpretation for inborn errors of metabolism (IEM): The ClinGen IEM Working Group and the Phenylalanine Hydroxylase Gene. Human mutation, 2018, 39(11): 1569-1580.

[13]  《遗传性耳聋基因变异筛查技术专家共识》专家组, 国家卫生健康委员会临床检验中心产前筛查与诊断实验室室间质评专家委员会, 国家卫生健康委员会临床检验中心新生儿遗传代谢病筛查实验室室间质评专家委员会. 遗传性耳聋基因变异筛查技术专家共识. 中华医学遗传学杂志, 2019, 36(3):195-198.

[14]  谭梅, 卢森, 吴柳松,等. 高通量测序技术在新生儿地中海贫血基因筛查中的应用. 中国实验血液学杂志, 2015(05):1404-1409.

[15] Yiming, Lin, Chien-Hsing, et al. Newborn Screening for Spinal Muscular Atrophy in China Using DNA Mass Spectrometry. Frontiers in genetics, 2019, 10:1255-1255.

[16]  Friedman JM, Cornel MC, Goldenberg AJ, et al. Genomic newborn screening: public health policy considerations and recommendations. BMC Med Genomics. 2017 Feb 21;10(1):9.

[17]  Luo X, Sun Y, Xu F, et al. A pilot study of expanded newborn screening for 573 genes related to severe inherited disorders in China: results from 1,127 newborns. Ann Transl Med. 2020;8(17):1058.

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