EmEditor--为生物学文件量身打造的windows文本编辑器
点击上面蓝字关注我们
高通量测序技术和生物信息学的蓬勃发展，为我们带来了各种格式的生物学文本文件，而这些文件大多数对windows用户不太友好。比如，大家肯定遇到过以下情况：
fastq文件太大，打不开怎么办？
vcf文件打开后乱码怎么办？
对于部分属于windows用户的生命科学工作者而言，乐与fastq、fasta作伴，却疲与GFF、VCF周旋。
今天我们给大家介绍EmEditor，一款针对windows用户的软件，可以广泛适用于生物学相关的各种格式的文本文件的查看和编辑。
软件介绍和安装
正如EmEditor官网所说的，这是一款为windows用户开发的易于使用的文本编辑器。
可以在官网 https://www.emeditor.com/#download 直接下载安装，可以选择安装免费版。
免费版保留了文本编辑的核心功能，足以满足大多数用户的使用需求。
强大的功能
1
使用方便
安装完软件后，如果需要使用EmEditor编辑文本文件，有多种方式可以打开文件：
可以直接点击文件，打开方式选择EmEditor；
在桌面建立快捷方式，将文件拖动到EmEditor快捷方式图标。
2
适用性强
EmEditor具有十分广泛的文件适用性：
常见的生物学相关的fastq、fasta、VCF等文件；
一些特定软件生成的命名十分奇怪的文件（比如rename.template.all.seq）；
还可以查看和编辑脚本代码，因为EmEditor还支持语法高亮。
3
支持大文件
有时候获得生物信息分析结果文件十分大，面对超过几G乃至几十G的大文件，windows系统难道真的束手无策了吗？
EmEditor可以很好地解决这个问题。EmEditor编辑文本文件时，是边打开边查看，不需要像普通的编辑器将文件全部载入然后才能查看，它查看再大的文件也是秒秒钟的事情。有了EmEditor，再也不用担心文本文件太大而无法在windows下查看了。
4
支持正则
我个人认为，支持正则表达式，使EmEditor拥有了灵魂。打开一个很大的生物学文件，配合正则表达式进行搜索，能够实现很多功能。例如：
查找“\s”，可以筛选文件中的空格；
将筛选出来的信息进行替换、替换设置为空时，可以删除所有匹配的信息；
将筛选到的信息全部提取，方便单独查看（可以用于在KEGG的结果文件中筛选感兴趣的通路）。
结束语
EmEditor是对windows用户十分友好的文本编辑器，对于需要跟生物信息分析结果文件打交道的广大生命科学研究工作者，更是值得一用。
这里分享的只是大家经常需要用到的功能，EmEditor的功能远比这里介绍的要强大。大家可以自己探索哦^_~
参考：
https://www.emeditor.com
作者：文人
审稿：童蒙
排版：amethyst