答读者问 （十三）查看Seurat对象时的ERROR：type='text'

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问题

我们在“手把手教你做单细胞测序数据分析（二）——各类输入文件读取”的文末教过大家如何查看Seurat对象的数据结构，后台中运行最后一行时经常有粉丝报错，集中回答一下。

怎么解决问题

这个问题发生的根本原因在于mm函数所在的mindr包更新了，在1.2.3版本（左图）中mm中是存在type参数的，而在1.3.3中type函数被拆解为了input_type和output_type（实际上原来的type对应这里的input_type），并且参数的选项也有所更新，很遗憾'text'这一选项不存在了，而更新后的几个选项（"auto", "markdown", "mindmap", "R", "dir"）我也都替大家尝试过了，并不能成功运行。 ,
显然，用新的版本已经无法解决这个问题了，只能按下面的代码下载老版本了。

remove.packages('mindr')#先把原来的卸了require(devtools)install_version("mindr", version = "1.2.3",repos = "http://cran.us.r-project.org")#安装更早的版本packageVersion('mindr')#安装后检查一下版本
此外，我也把这个函数生成的文件存成html，需要的同学可以从百度云链接中下载。

链接：https://pan.baidu.com/s/1iMK3xlVU-LQhrOan_qpefQ?pwd=uo8l

提取码：uo8l

其实R语言中报错的根本原因无非就两种：版本和数据格式。大家只要检查好这两点，很难遇到报错。几乎每次教程的底部我都会附上我所用R包的版本，最好还是保证版本与我一致，避免不必要的麻烦，毕竟代码在我这都是可以跑通的，一些你们遇到的报错我也不曾遇到过（基础报错除外）。除了按照上述的方法去一一安装与我相同的版本，以下还有两种方案供大家选择：
1、超过600种的常用生物信息学package我已经在R3.6、R4.0、R4.1中给大家安装好了，可以直接加载，有需要的同学请自取：给你安排一个懂生信的工具人（六）：再也不怕装不上packages了
2、以后的教程都会在西柚云中演示，给你们申请到了免费的版本，大家可以去用免费版跟着学：给你们申请到了免费的128GB云服务器

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最近发现后台中有一些消息我没能及时看到并答复，微信后台中超过48h后便不允许回复读者消息，这里还是再给大家留一下答疑的扣扣号，方便大家随时交流：1913507043。微信号可以点击喜欢作者后自动回复里有。欢迎大家向我咨询或者提供建议。大家可以阅读完这几篇之后添加我：如何搜索公众号过往发布内容
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