(文章篇)S5E49:看看国内团队是怎么研究环状RNA的?
好久没有写文章了,今天我们看一篇环状RNA的文章:Screening differential circular RNA expression profiles reveals the regulatory role of circTCF25-miR-103a-3p/miR-107-CDK6 pathway in bladder carcinoma.Sci Rep. 2016 Aug 3;6:30919. doi: 10.1038/srep30919.文章的通讯作者是重庆医科大学陈俊霞教授,文章的主题非常清晰:膀胱癌环状RNA表达谱首次报道,以及circTCF25-miR-103a-3p/miR-107-CDK6通路在膀胱癌中的作用研究。
文章主要内容就是以上两部分:
膀胱癌中环状RNA表达谱首次报道;(这部分门槛较低,服务公司可以提供,难点是如何进行个性化分析和结果展示)
新环状RNA circTCF25-miR-103a-3p/miR-107-CDK6通路的调控机制;(这部分重点是对新环状RNA circTCF25的挑选, circTCF25的体外功能,以及通过miR-103a-3p/miR-107对靶基因CDK6的调节机制。)
下面是文章的研究思路:
一、 表达谱结果展示最常用的“三图一表”
二、qPCR验证芯片、测序结果之——趋势一致
三、以circTCF25为主角的microRNA预测和功能分析
四、 circTCF25细胞功能实验和调控研究
虽然文章的分数不是很高,但是研究却非常有借鉴意义,思路从组织样本的芯片结果出发,结合对调控microRNA和靶基因的分析、信号通路功能分析,挑选6条lncRNA进行qPCR验证,然后选取microRNA Sponge这一最为经典的套路,功能实验仅从体外细胞水平展开,机制上也以qPCR和WB表达检测为主。整体很接地气,是做环状RNA研究很好的入门级教材,值得研读。
下载链接:http://pan.baidu.com/s/1o8TKJN0 密码:b3vc
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