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生信工作资讯速递-single已成潮流

2017-07-04 徐洲更 生信技能树

你有没有想过?

一颗种子为什么会长成一棵大大树,或者变成其他植物,而不是被你用来下片?

所有人最开始都是一个受精卵,为什么经过不断的细胞分裂和细胞命运决定,最后形成了复杂的组织和器官,最后变成你现在这副挫样呢?

如何找到问题的答案

问题的关键在于细胞间到底有什么样的差异。也就是问发育前后的两个细胞到底存在什么样的差异。
在之前用的都是林奈分类法,我们用肉眼能见的标记,根据人类以为的分子标记去对万物进行分类,说这是植物的根,根从里到外又可以继续划分,最后一直划分到一群细胞,感觉是“一致”为止。

但是人的感觉就那么靠谱么?你以为的“一致”的一群细胞就真的是一致了吗?

单个细胞意味着什么

每个细胞都是不同的,就像每一个人都是不同的一样。中国人的平均身高是1.70m(我瞎编的),不代表每个人都是那么高,对不起我给组织拖后腿了。我们要关注每一个细胞的感受,真正地让每个细胞都能行使自己的权利,让每个细胞都能拥有发言的权利。

单细胞测序

对每一个细胞都进行测序,这是大家很久之前就有的梦想,但是由于每个细胞的物质是那么的少,个体的声音是微弱的。我们做不到,所以只能选取代表,代替广大的细胞兄弟发言。

神经细胞A对神经细胞B说:我有一个梦想,到那时,我再也不会被代表,到时候,我能和你区分对待,而不是被认为是某一类神经细胞。

随着时代的发展,技术的革新,到了今天我们终于有能力了,让每个细胞微弱的声音不断的放大,最终被illumina听到,最后传到每个科研工作人员的手中。
2013年,单细胞测序技术(single-cell sequencing)荣膺《自然-方法》年度技术2013年,单细胞测序技术(single-cell sequencing)荣膺《自然-方法》年度技术


但是,随之而来就有一个问题,我们应该如何落实细胞们的诉求,真正解决他们的问题。

还记得大明湖畔的…



Single Cell Genomics Centre

为了响应时代号召,为了顺应潮流发展,桑格研究所作为序列分析的领军人物,他没有退缩,他站了出来,于是联合EMBL-EBI成了单细胞基因中心(Single Cell Genomics Centre, SCGC)。



二话不说,就搞了好多小组去攻坚单细胞测序的各个难题,无论你想写一些开创性的算法,还是打算建立准确而又高效的pipeline,还是打算解读分析后的数据,还是单纯去打个招呼,这里都有属于你的位置!

这次我们谈情怀,不谈钱了!

欢迎访问(阅读原文), http://www.sanger.ac.uk/science/groups 了解更多详情!

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