七夕刚过，bioconda中国镜像来临

bioconda是conda上一个分发生物信息软件的频道，现在已经有超过2700款软件。由于国内没有基镜像，下载安装生物信息软件速度十分缓慢，经常中断，生物信息人迫切需要一个国内镜像。Bioconda is a channel for the conda package manager specializing in bioinformatics software。

昨天，偶然发现：

8月22号，让生信小伙伴日顾夜盼的bioconda中国镜像已经在清华tuna镜像源的一个服务器上建成了，感谢那个去呐喊的小伙伴@hyacz。

镜像地址： https://nanomirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

一直一来，小伙伴们倍受bioconda服务器在国外，没有国内镜像，下载软件缓慢，不时报错的煎熬。这个镜像的到来将为我们解决这个问题。

下面介绍一下镜像的使用方法：

1. conda config --add channels https://nanomirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/conda

2. config --set show_channel_urls yes

进行一下速度对比，公司百兆电信宽带条件下，以安装bwa软件为例：

不使用镜像，平均速度169.09KB/s，还是在网络较好的情况下，而且下载大软件容易中断。

使用镜像情况，平均速度已经是1.86MB/s，整整提高了十倍，虽然可能还没有进入官方源，有个警告，但是不影响使用。我们可以把更多的时间用在分析数据而不是折腾软件上。

怎么样，给力吧？快点上车吧！

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编辑：曾健明

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