RNA转录后调控 | eCLIP、RNA-tracking发明人Gene Yeo研究RNA结合蛋白对ALS的影响

谁来调控我感兴趣的lncRNA/circRNA/miRNA | 100%可行的解决方案V2.0一文从转录（蛋白质对DNA）调控和转录后（蛋白质对RNA）调控两个层面介绍了RNA调控机制研究的方案。

转录水平的实验相对容易做，转录后的研究对实验技术要求高。幸好ENCODE产生了大量高质量的公共数据，挖掘出对我们感兴趣的ncRNA起调控作用的蛋白质。

ENCODE采用CLIP-seq、RIP-seq和RNA Bind-n-Seq研究蛋白质结合的RNA：

332套eCLIP-seq和7套iCLIP-seq，by Yeo lab；

25套RIP-seq，by John Rinn Lab；

160套RNA Bind-n-Seq，by Chris Burge。

今天扒一扒Gene Yeo。先看实验室主页，Research的词云长这样：

再看google scholar主页

在ENCODE中，Yeo lab产生了332套eCLIP-seq数据和7套iCLIP-seq数据，建立了ENCORE数据库。点击此处查看该数据库介绍视频和ppt获取方法。

Gene研究兴趣之一是RNA结合蛋白对ALS的影响。

又是枯燥的学术报告？NO，是用动画生动有趣的讲故事。

https://v.qq.com/txp/iframe/player.html?vid=o0548tob5wp&width=500&height=375&auto=0

在核内，mRNA被转录出来，剪掉intron，再由hnRNP A2/B1砍掉尾巴，这一加工过程中RBP如果出了状况，就会影响神经系统。

例如ALS，「漸凍人」( 肌萎縮側索硬化症）

还记得2014年的冰桶挑战吗？Neuro Team接受了挑战

商量冰桶挑战方案

跟Gene参观一圈儿wet lab和dry lab，看冰桶挑战实况视频

https://v.qq.com/txp/iframe/player.html?vid=v05495j128d&width=500&height=375&auto=0Gene，你这么做，真的好吗？

用CRISPR/Cas9在活细胞里追踪RNA

Gene的生动活泼讲解视频

https://v.qq.com/txp/iframe/player.html?vid=f0548dxhlsk&width=500&height=375&auto=0

我们平时所说的CRISPR/Cas9编辑DNA，是sgRNA结合到DNA上，Cas9来切切切

细胞质里用Cas9-GFP追踪RNA

活细胞的RNA-targeting Cas9能用来研究啥？

您可能还想看：

1. Factorbook | 翁志萍 | ChIP-seq in ENCODE

---

想用ATAC、ChIP实验研究感兴趣的基因？想用已发表的ChIP-seq、ATAC-seq、eCLIP-seq、ChIA-PET、DNA甲基化测序、RNA-seq数据寻找线索？找嘉因生物吧！从实验、测序，到多种数据整合分析，为您一站式解决。（点击文中蓝字了解详情）

---

嘉因生物公众号定位：客户共性问题解答，生信学习资源导航，高通量实验导购 | 为您提供高通量实验-测序-分析-验证一站式解决方案

电话：[phone]

Email：[e-mail]
地址：上海市杨浦区赤峰路65号同济科技园1号楼611室