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百迈客云平台使用指南一:查找报告及数据基础功能简介

桃子甜呀 百迈客医学 2023-03-27



对于各位测序大佬来说,应该比较熟悉咱们百迈客云平台了,使用起来想必也是得心应手。但对于初次接触测序的老师,刚开始使用云平台,可能会感觉很“蒙圈”。小编常常会接到电话,询问该怎么查看项目进展?在哪找报告和数据?今天这篇文稿作为入场级小白使用,为您的百迈客云旅程提供导航。


一.如何查找分析结果?

真核转录组、LncRNA、sRNA、circRNA、全转录组、ONT全长转录组、微生物多样性


查找大法

 1)快捷查找法:在主界面往下拉,在最下面“我的报告”里即可找到,点击“查看报告”便可浏览报告正文和进行个性化分析。


2)项目管理-我的项目里进入查看。

从此处进入可以看到您账号下所有合同目前的进展,点击项目名称,可查看具体详情以及分析报告。(PS:如果合同签订时云账号填写错误,项目进行中途才改成正确的,则无法绑定项目进展,所以一定要填对邮箱哦)

 

外显子、重测序、甲基化、HiC、ATAC、cut&tag、空间转录组、宏基因组、细菌完成图、真菌精细图、10X单细胞

查找大法


【项目管理】-【我的数据】-【analysis-report】 

注:从项目管理-我的数据-analysis-report里查找的报告都是压缩文件,无法直接在线预览,需要下载后查看。您可能会疑问,为什么不能像上面的产品一样可直接预览呢?那是因为能直接预览的产品都是已实现个性化分析功能的,而这些尚在开发或试运行个性化分析阶段的产品,目前只能以压缩包的形式传送,不过我们的研发小伙伴正在夜以继日的开发中,相信很快就能实现啦~
 
二、怎么查找下机fq数据?

目前仅微生物多样性项目的fq数据采用云平台交付,其他的产品fq数据均通过邮件或硬盘交付。所以不要贸然清理云平台的微生物数据哦,除非您已经下载保存到自己的电脑上了! 

1)微生物多样性的数据查找和下载方式:
路径:【项目管理】-【我的数据】-【biomarker_project】-【microbial_*】-【Needed_Data】-【Rawdata】
此时会发现有两个文件夹:Rawdata和Contigs。其中Rawdata是指下机的原始数据,Contigs是指拼接后的有效数据。假如要上传NCBI的话,是需要上传Rawdata。

 
2)次账号项目
路径:【项目管理】-【我的数据】-【biomarker_raw_data】
这里的数据不支持下载,仅供您跑次账号流程时使用。


三、如何查看分析进展
点击【项目管理】-【我的任务】,可看到次账号的分析和个性化小工具分析的进展以及状态。如果发现长时间运行不出来或出现报错,可终止运行重新投递,或及时联系我们。 


以上简单的介绍,希望能帮助您快速了解自己的项目概况,当然这只是云平台强大功能的冰山一角。如果您在使用过程中遇到任何问题,可咨询云平台右下角的在线客服,或者致电内部运营;同时欢迎各位老师给云平台使用提供建议,我们会积极采纳并改善维护,以便更好的满足您的科研需求。


百迈客云平台52款研究APP118款分析工具40PB公共测序数据私有生物云系统交互的个性化分析让基因分析更简单

文:桃子甜呀

排版:市场部


 
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公司拥有Nanopore、PacBio、Illumina、Waters、10XGenomics等主流服务平台,以及基于云架构的生物云计算平台—百迈客云,提供涵盖人重外显子、三维基因组、单细胞与空间转录组、基因组组装、转录调控、微生物、群体遗传、质谱及表观遗传等研究方向的技术服务。目前百迈客云平台拥有200多款基因分析工具,分析结果可直接用于文章发表,更有近百部科研相关视频和8大基因数据库助力科研工作者深度数据挖掘。

自公司成立起先后在《Cell》、《Nature》、《Nature Genetics》、《Nature Communications》、《Plant Cell》等学术刊物发表论文数千篇,拥有国家发明专利技术40余项,软件著作权近200余项。

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