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结构速递 | 一周“结构”要览 VOL.86(10.23~10.29)

谭佳鑫 北京生物结构前沿研究中心 2024-04-29

上周发布了哪些“结构”文章?又取得了哪些科研进展?


结构速递栏目以每周“结构”相关领域刊文为主题,梳理一周结构发文大事记,“结构速递”为您传递最新、最快、最权威的结构资讯。

2023.10.23~2023.10.29

CNS刊登文章

01

 Nature

2023/10/25

1.“Structures of a sperm-specific solute carrier gated by voltage and cAMP”


新鉴定的精子特异性Na+/H+交换蛋白因其独特的三方结构域组成而脱颖而出。它将一个经典的溶质载体单元与离子通道中常见的调控结构域(即电压感应结构域和环核苷酸结合结构域)结合在一起,这使它成为一个机械嵌合体和一个严格由膜电压激活的次级活性转运体。


来自荷兰格罗宁根大学Cristina Paulino课题组对海胆SpSLC9C1在没有配体和有配体的情况下的结构进行了研究,并揭示了其整体结构域排列和新的结构耦合元件。通过这些结构,研究人员提出了一个门控模型,即电压传感器的运动通过新表征的耦合螺旋传递的长距离异位效应,间接导致交换单元从锁定状态释放。研究人员进一步提出,其配体环磷酸腺苷(cyclic AMP)的调节作用是通过破坏细胞膜二聚体界面来实现的,从而降低了电压感应结构域中S4运动的能量障碍。由于SLC9C1成员已被证明对男性生育力至关重要,包括在哺乳动物中,因此这个结构代表了开发新型按需避孕药物的潜在新平台。

原文链接


https://www.nature.com/articles/s41586-023-06629-w


2023/10/25

2.“Structure and electromechanical coupling of a voltage-gated Na+/H+ exchanger”


电压感应结构域控制着电压门控离子通道的激活,但也有少数例外。精子特异性Na+/H+交换蛋白SLC9C1就是这样一个例外,它是唯一已知的受电压感应结构域调控的转运体。精子鞭毛超极化后,SLC9C1开始活化,导致pH碱化和CatSper Ca2+通道激活,从而驱动趋化作用。SLC9C1的激活还受可溶性腺苷酸环化酶(sAC)产生的cAMP的进一步调节。因此,SLC9C1是后生生物pH-sAC-cAMP信号通路的重要组成部分,并是精子运动和受精所需的。尽管SLC9C1非常重要,但其电压激活的分子基础尚不清楚。


来自瑞典斯德哥尔摩大学David Drew课题组解析了海胆SLC9C1在去垢剂和纳米盘中的冷冻电镜(cryo-EM)结构。研究人员发现,电压感应结构域以一种不寻常的构型位于SLC9C1同源二聚体的两侧。S4区段很长,长达90 Å,连接着电压感应结构域和细胞质环状核苷酸结合结构域。S4段处于向上构型,即SLC9C1的非活性状态。一致的是,虽然Na+可以通过带负电荷的空腔与SLC9C1的离子转运结构域结合,但与S4相连的胞内螺旋限制了它们的移动。根据SLC9C1的cryo-EM结构在cAMP存在下的差异,研究人员提出,在超极化时,S4段向下移动,消除了这一限制,从而实现了Na+/H+交换。

原文链接


https://www.nature.com/articles/s41586-023-06518-2


Science

本周无


Cell

本周无


2023.10.23~2023.10.29

子刊刊登文章


01

Molecular Cell

10.17

“Visualizing the chaperone-mediated folding trajectory of the G protein β5 β-propeller”

02

Nature Structural & Molecular Biology

10.24

1.“Concerted structural rearrangements enable RNA channeling into the cytoplasmic Ski238-Ski7-exosome assembly”

10.26

2.“Structural and functional insights into the enzymatic plasticity of the SARS-CoV-2 NiRAN domain”

03

Nature Communications

10.23

1.“How myosin VI traps its off-state, is activated and dimerizes”

10.23

2.“Hierarchical organization and assembly of the archaeal cell sheath from an amyloid-like protein”

10.23

3.“SIgA structures bound to Streptococcus pyogenes M4 and human CD89 provide insights into host-pathogen interactions”

10.23

4.“Staphylococcus aureus sacculus mediates activities of M23 hydrolases”

10.24

5.“Recognition and coacervation of G-quadruplexes by a multifunctional disordered region in RECQ4 helicase”

10.24

6.“De novo design of knotted tandem repeat proteins”

10.26

7.“Mechanism of substrate hydrolysis by the human nucleotide pool sanitiser DNPH1”

10.26

8.“Phosphorylation-dependent pseudokinase domain dimerization drives full-length MLKL oligomerization”

10.27

9.“Multivalent Tau/PSD-95 interactions arrest in vitro condensates and clusters mimicking the postsynaptic density”

10.28

10. “Mechanism of synergistic activation of Arp2/3 complex by cortactin and WASP-family proteins”

10.28

11.“Structural titration reveals Ca2+-dependent conformational landscape of the IP3 receptor”

04

Science Advances


10.25

“Structure of a diatom photosystem II supercomplex containing a member of Lhcx family and dimeric FCPII”



Cell Research

本周无

作者 | 谭佳鑫

审稿 | 肖媛

责编 | 囡囡

设计、排版 | 可洲




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