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生信分析平台搭建(十):Rstudio-server

2018-01-17 基因学院 基因学苑

编者按

Rstudio是我最喜欢使用的软件之一,这款软件是集成开发环境的典范,非常的好用,而且设计的非常人性化。如果有服务器,推荐安装Rstudio-server软件,这样一方面可以充分利用服务器的计算资源,另一方面通过浏览器远程使用图形化的Rstudio软件也非常方便。

接前面:

手把手教你生信分析平台搭建(一)

生信分析平台搭建(二):安装Linux系统

生信分析平台搭建(三):系统设置

生信分析平台搭建(四):共享文件夹

生信分析平台搭建(五):个性化设置

生信分析平台搭建(六):系统配置

生信分析平台搭建(七):bioconda

生信分析平台搭建(八):利用Synaptic安装生物软件

生信分析平台搭建(九):Aspera


十四:安装Rstudio-server

1、Rstudio只是一个集成开发环境,需要调用R软件,首先下载和安装R软件。

apt install -y r-base #我们前面安装过R软件

2、Rstudio-server以deb格式打包,需要使用gdebi进行安装。需要下载安装gdebi。

apt install -y gdebi-core #安装gdebi

3、访问Rstudio网站,获取下载地址,有收费版与免费版,收费版支持多线程,普通版也够用。这里我们下载普通版,注意是Rstudio-server,不是Rstudio。


4、下载Rstudio-server安装包

wget https://download2.rstudio.org/rstudio-server-1.1.383-amd64.deb #下载安装包

5、安装软件

gdebi rstudio-server-1.1.383-amd64.deb #安装软件

6、启动服务

rstudio-server start #启动服务

7、通过浏览器访问,IP地址后面加上端口号8787,注意Rstudio-server不能使用管理员账户访问。因为没有连外网,内网IP访问,http://127.0.0.1:8787/。

8、通过配置文件可以进行设置,例如端口号,登录账户限制等。主要使用下面两个配置文件。

/etc/rstudio/rserver.conf

/etc/rstudio/rsession.conf


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