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​​精准高效文献检索,这里有新版PubMed的超强攻略!

利刃君 投必得学术 2022-05-07


利刃君在之前的推文硕博生必学 | 手把手教你PubMed的正确打开方式中,为大家分享了PubMed数据库的基本使用方法,相信大家很容易就能掌握,本期内容利刃君继续为大家分享一些PubMed可能会被大家忽略的使用技巧。


01

检索结果过滤



在PubMed中可通过过滤器来缩小检索结果的范围,包括文章类型、拥有全文、出版日期、物种、语言、主题、期刊类型等。



如果默认提供的筛选器不能满足需求,可以点击“Additional filters”选择更为详细的筛选条件。



02

优化结果显示




在检索结果界面,点击“Display Options”可修改检索结果的排序以及结果显示方式。如修改以“Abstract”,即文摘格式显示,检索结果会同时显示文章摘要,更容易了解论文研究内容,而且会显示全文获取指示图标。还可设置显示全记录格式、PMID列表等,可自行探索~



03

引用参考文献




新版的PubMed在检索结果中每条文献下方都提供了引用功能,对于我们需要引用的文献,可直接点击文献下方的“Cite”就可以复制文献引文。



选项中提供了“AMA”、“APA”、“MLA”及“NLM”四种参考文献格式,可根据发表期刊的要求进行选择。此外,也可直接下载.nbib格式文件导出文献至文献管理软件如EndNote中。



如果需要批量导出文献,也可选中需要导出的文献,然后点击“Send to -> Citation manager”来批量导出。



04

添加邮箱订阅



我们可以使用PubMed实现邮箱订阅,让PubMed定期向自己的邮箱推送关注的领域内最新的文献,方便我们及时掌握科研动态。


首先需要注册PubMed账号,在PubMed首页的右上角点击“Log in”就可进入注册页面。



我们需使用第三方账户进行注册,大家可使用微软或谷歌学术账户注册登录,需要注意的是,PubMed会默认填写的邮箱地址为今后接收推送文章的邮箱,因此尽量使用自己常用的邮箱账户。



下面使用设定的检索式进行检索,检索词的制定可根据个人习惯设定。如我们关注发表在“Journal of Medicinal Chemistry”期刊上有关“HSP90”的论文,可使用“("Journal of Medicinal Chemistry"[Journal]) AND (HSP90[Title/Abstract])”进行检索。然后在检索结果界面的检索框下面点击“Create alert”按钮;



“Name of saved search”表示检索式的名称,默认名称为检索式,可以自己更改为方便分类与记忆的名称;“Search terms”为检索式,PubMed会依据该检索式检索的文献结果推送至邮箱,点击下方的“Test search terms”可以测试检索式检索的结果是不是自己需要的。



可以设置推送的邮箱(E-mail)、频率(Frequency)、推送的日期(Which day?)、推送格式(Report format)、每次推送的文献条目数(Send at most),设置完成后,点击“Save”即可,之后就等待邮箱接收文献吧~



05

期刊检索



在PubMed首页可找到期刊检索入口--Journal in NCBI Databases;



可输入主题、刊名、ISSN号等进行检索,如我们输入“Journal of Medicinal Chemistry”查询这个期刊;



在检索结果中找到该期刊,点击期刊即可查看该期刊相关的信息,如创刊年、出版周期、出版商等;



如需进一步了解该期刊里的文献内容,可点击“Add to search builder”将该期刊创建检索式,然后点击“Search PubMed”就可以看到发表在该期刊的论文啦~



06

临床查询



在PubMed首页可以找到临床查询的入口“Clinical Queries”,点击该链接便可进入临床查询;



在检索框中可输入疾病名称或主题进行查询,“Filter”的下拉列表可选择查询的类型,包括治疗(Therapy)、临床预防建议(Clinical Prediction Guides)、诊断(Diagnosis)、病因学(Etiology)、预后(Prognosis);“Scope”的下拉列表可选择查询的范围,其中“Broad”表示拓宽检索范围,“Narrow”表示缩小检索范围。



07

单篇引文匹配器



单篇引文匹配器是PubMed高级检索中的重要内容,适用于精确检索某一篇文献!在PubMed首页,可以找到单篇引文匹配器的入口“Single Citation Matcher”,点击链接可进入检索界面;



在该检索界面输入文献的已知信息,点击“Search”,可精确检索某篇文献。其中:


Journal”输入刊名的任何有效信息,系统会主动给出提示,帮助选择正确的刊名;Date”输入期刊的出版日期;Details”输入期刊的卷、期、起始页码;Author”输入作者的姓名,姓在前,名在后,且名只能用首字母缩写;Limit authors”可限制作者是第一作者还是最后一名作者;

Titlewords”输入文献篇名的任意词。



输入相关信息完成后,点击“Search”进行检索即可。



今天就介绍到这里,欢迎大家留言讨论~


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