体系课3课表出炉|多癌症多组学的综合数据挖掘,复现高分SCI
关于肿瘤标志物挖掘技术与应用体系课
由肿瘤测序及大数据分析专家委员会倾力打造,已搭建9大课程体系及主体课程内容,涵盖从基础的公共数据库使用分析,到高阶的组学测序数据挖掘。既有基础理论、实操讲解,还有研究设计与实例解析,更有独创分析方法/数据库讲解。学员可根据自身研究方向及实际科研需求选择多种课程。
体系课学术指导委员会(按姓氏拼音排序)
您将学到什么
关于体系课3-“综合组学数据资源实操”
在本课程中
您将学会使用傻瓜式的WEKA软件完成各种各样的数据挖掘任务。
您将学会使用GEO、SRA、GTEx数据库搜寻数据,多个数据集合并、使用GEO2R等在线工具及网站鉴定潜在的信号通路和核心基因。
您将学会使用TCGA和ICGC数据库,进行多癌症多组学的综合类数据挖掘与分析,包括癌症数据差异表达分析、癌症数据ceRNA分析和癌症数据的预后分析等。
讲师团队
关于体系课3-“综合组学数据资源实操”
(按讲课顺序排名)
张岩教授,哈尔滨工业大学,生命科学与技术学院,教授,博士生导师。2006年日本留学回国以来一直从事生物信息学和计算表观遗传学领域的教学和科研工作。现为中国计算机学会生物信息专业组委员,生物数据挖掘与计算专业组委员,功能基因组与系统生物学学会转化医学与生物信息学专委会专家,黑龙江生物医学工程学会理事。作为编委参与编写卫生部八年制规划教材《生物信息学》,副主编编写《生物信息学学习指导与习题》、《生物信息学与医学实践》,全国高等学校生物医学工程专业首轮”十三五”规划教材《生物医学信息学》副主编,全国高等学校五年制本科临床医学专业第九轮规划教材《医学生物学》编委。《基因组学与应用生物学》编委,《Plos One》学术编辑。共发表论文学术论文60余篇,SCI收录论文37篇,以第一及通讯作者累计发表SCI收录论文21篇(总SCI影响因子130),科研成果发表在《Nucleic Acids Research》、《Science Reports》、《Development》、《Database》、《Briefings in Bioinformatics》、《Genomics》、《PLoS ONE》、《Gene》等有重要国际影响的杂志上。所带领的课题组致力于肿瘤学研究领域的高通量数据挖掘算法和软件开发,可视化网络平台及数据库构建。
黄艳博士,生物信息专业博士研究生。研究方向主要为预测转录因子时空特异结合事件以及利用单细胞数据揭示结直肠癌中部分甲基化结构域的异质性。黄艳博士利用多组学数据(包括DNA甲基化、组蛋白修饰、基因表达)对组织处于不同状态下转录因子结合事件的预测研究(Epigenomics)。中国抗癌协会肿瘤标志专委会会员。
谢龙祥博士,河南大学基础医学院副教授,担任中国微循环学会转化医学专业青年委员会秘书长。近年来已发发表SCI论文55篇,论文总引用600多次,论文发表在专业著名期刊,包括Journal of Proteome Research, Journal of Proteomics, Aging, Genomics, Viruses等。近年来主要从事肿瘤的预后数据库开发、肿瘤基因标记物筛选,目前是数十个杂志的审稿人。
周殿双博士,生物信息专业博士研究生。研究方向为生物信息数据库搭建和非编码RNA研究。目前开发miRNA-疾病MSDD数据库(Nucl. Acids Res. IF: 11.561)
和超级增强子数据库SEA 3.0(Nucl. Acids Res. IF: 11.561)。中国抗癌协会肿瘤标志专委会会员。
课程内容
关于体系课3-“综合组学数据资源实操”
1
综述:组学数据在肿瘤标志物挖掘中的应用
(理论课:1.5h)
授课老师:张 岩 教授
本节概要:个性化课题思路设计及讨论
2
数据挖掘软件-WEKA
(理论+实操课:2h)
授课老师:黄 艳 博士
本节概要:WEKA软件详解应用与实操
https://www.cs.waikato.ac.nz/ml/weka/
3
GEO、SRA、GTEx数据库
(理论+实操课:6h)
授课老师:谢龙祥 副教授
本节概要:数据库详解及实操。复现案例:以一篇影响因子5分(中科院1区top期刊)为例,手把手带大家学习系统性利用在线工具和软件寻找肿瘤的潜在诊断和治疗标志物。
4
TCGA、ICGC数据库
(理论+实操课:6h,实操课时占比过半)
授课老师:周殿双 博士
本节概要:针对 mRNA、lncRNA、miRNA、DNA甲基化、蛋白质等多个层面,以实例出发为学员解析生信分析在SCI论文中的作用及体现,并复现高分SCI论文中的生信分析操作。
上课时间
采纳学员建议,本期课程内容分散在一周内的周四至周日,便于知识消化吸收
9月24日19:00-21:00,25日19:00-21:00,26日全天、27日全天
结业证书
将由肿瘤标志专委会和肿瘤测序及大数据分析专家委员会共同颁发、专家签名认证,是对您学习成果的权威认可。
优享福利
■ 独特授课
小班线上授课,直播+操作演示+1对1远程实操指导+听课群长期答疑
■ 专享回看
课程结束一周内听课群内获取回看地址,可限时回看授课视频一个月
■ 短期培养
可介绍推荐短期实习
■ 人才计划
得到肿瘤标志专委会“青年人才扶持计划”的机会
■培训优惠
可享受特别优惠参加体系课的其他课程
课程收费标准
■ 单价:
2400¥/人
■ 团购价(3人以上):
1800¥/人
■ 必修课(3门课):
4800¥/人(98%的学员选择,点击查看完整必修课)
报名方式
1.扫描填写报名表
2.扫码添加工作人员微信咨询
TBM学院
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