PDX Finder——免费的癌症模型全球门户网站 | 药时代推荐

（CREDIT: SPENCER PHILLIPS/EMBL-EBI）

PDX Finder——免费的癌症模型全球门户网站

PDX Finder是全球首个开放式在线目录，允许研究者搜索来自全球各地的PDX癌症模型，可帮助癌症研究人员节省宝贵的时间

PDX Finder是欧洲分子生物学实验室/欧洲生物信息学研究所（EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY - EUROPEAN BIOINFORMATICS INSTITUTE，EMBL-EBI）和杰克逊实验室（JAX）共同开发的全球第一个开放的共享患者来源异种移植（PDX）模型的癌症研究门户网站，完全免费，由EMBL-EBI托管，信息覆盖来自全球各地的PDX模型。PDX Finder门户网站为合作研究提供了巨大的潜力，同时为研究人员节省了时间。现在研究者只需要搜索一个整合汇总的目录，而不需要光顾众多的分散的网站。

（图片来源：网站截屏）

临床相关

研究人员通过将来自癌症患者的肿瘤碎片植入免疫功能受抑制的小鼠中，建立PDX小鼠模型。通过使用这些模型，研究人员可以更好地了解特定患者对特定药物的反应。

EMBL-EBI的PDX Finder项目负责人Nathalie Conte说：“诸如PDX模型的临床前模型是抗癌药物的有效性的非常重要的预测因子，目前抗癌药物临床试验中的失败率很高，癌症模型对于理解和治疗癌症至关重要。PDX模型越来越被认为是临床相关的，因为它们保留了患者的肿瘤特征并比其它模型更准确地模拟了特定患者对药物的反应。但是，直到现在，PDX模型还没有开放的统一目录。 PDX Finder使癌症研究人员能够更快地搜索更多种模型，节省宝贵的时间并加强合作的可能。”

集中化的目录

随着对PDX模型的使用的增加，轻松查找世界各地不同组织分发的相关模型的需要与日俱增。PDX Finder建立在杰克逊实验室的PDX资源的基础之上进一步整合多方的努力。杰克逊实验室的PDX资源基于与美国20多个医疗中心及具有EurOPDX会员资格的EMBL-EBI的合作。

这确保了PDX Finder的内容和覆盖范围比任何其它可用的单个资源都更广。

JAX PDX资源科学总监Carol Bult指出：“EMBL-EBI和JAX均获得国家癌症研究所的独立资助，用于包括PDX模型在线目录的具体实施，两个研究组的目标都是帮助基础和临床癌症研究人员快速找到相关模型。得到NCI的批准后，我们合作建立了一个覆盖国际范围的统一门户。”

PDX Finder的最初版本包含来自多个PDX库的1900多个模型，跨越消化系统、呼吸道、皮肤、乳房、泌尿系统等的癌症。

高品质模型

PDX Finder的推出仅在EMBL-EBI和杰克逊实验室发布PDX最低信息标准的几个月之后，该文件为描述PDX模型的基本属性所需的基本信息设定了标准。“最低信息标准”是全球30多家学术和商业机构参与的具有重要意义的行业努力的结果。该标准确保了PDX Finder中的每个模型都经过仔细描述，以帮助研究人员选择与其工作最相关的模型。

研究人员可以在PDX Finder网站上搜索PDX模型，也可以自行提交自己的PDX模型。网址是http://www.pdxfinder.org。点击下方【阅读原文】可直达该网站！

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参考资料：

PDX finder -- Free global portal for cancer models（发表时间：2018-04-05）

图片来源：原文、公司官网、网络。版权归拥有者。

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