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张丽华研究员/张玉奎院士团队: 全自动化蛋白质样品处理系统

中国科学化学 中国科学化学 2022-06-22
蛋白质作为生命活动的执行者在诸多生物学过程中发挥着至关重要的作用,因此近年来蛋白质组分析受到了越来越多的关注。然而由于样品制备步骤多,且通常采用离线方式进行,不仅严重制约了蛋白质组分析的通量,而且还影响了定量的精准度和覆盖度。
针对上述问题,中国科学院大连化学物理研究所张丽华研究员和张玉奎院士团队基于中空纤维膜和固定化酶反应器的双重限域效应,研制了全自动化蛋白质样品处理系统(图1),不仅可将蛋白质组变性、还原、除盐和酶解时间从传统自由溶液方法的12 h以上缩短到20 min以内,而且该系统可以与液相色谱-质谱系统在线联用,实现大批量样品的全自动化定性定量分析。此外,由于避免了样品在转移过程中的损失,还为实现微量蛋白质组样品的高精准和深度覆盖的定量分析提供了重要技术支撑。作者利用该系统对肝癌高低转移细胞株进行了定量分析,发现了37种差异蛋白质,其中15种在癌症转移中未见报道。为深入研究肝癌的转移机制和发现潜在药物靶点提供了重要基础数据。

图1 全自动蛋白质组样品处理系统

详见:Huiming Yuan, Zhongpeng Dai, Xiaodan Zhang, Baofeng Zhao, Hongwei Chu, Lihua Zhang, Yukui Zhang. Fully Automated Sample Treatment Method for High Throughput Proteome Analysis. Sci. China Chem., 2020doi:10.1007/s11426-020-9878-8)。点击左下角阅读原文,可免费阅读和下载全文。


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作者简介



袁辉明,大连化物所项目研究员,硕士生导师。2010年在该所获得博士学位,同年留所工作至今。先后主持国家重大科学仪器与设备开发专项、国家自然科学基金等项目。主要从事微量样品、单细胞蛋白质组分析新方法、新材料和新装置研究及在精准医学等领域中的应用。在Anal. Chem., Sci. China. Chem., Anal. Chim. Acta.等SCI期刊上发表论文40余篇;获授权发明专利14项。

 


 

张丽华,大连化物所研究员、博士生导师。 2000年在大化所获得博士学位;先后在德国和日本访学。2003年4月至今在大连化物所工作;现为生物分子高效分离与表征研究组组长。先后入选中科院“百人计划”、科技部“中青年科技创新领军人才”和中组部“万人计划”;2017年获国家杰出青年基金资助。曾获得国家自然科学奖二等奖(排名第二)等奖项。先后承担了国家重大科学研究计划、国家重点研发计划,以及国家自然科学基金重点基金等项目。主要从事蛋白质组定性、定量和相互作用分析的新方法研究。在Nat. Commun., Adv. Mater., Anal. Chem., Sci. China Chem.等期刊发表SCI论文200余篇。任Sci. China Chem.等期刊编委。







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