查看原文
其他

国内非编码RNA研究现状分析

2016-11-24 句月山人 circRNA

声明


欢迎个人转发到朋友圈,公众号、自媒体、网站等媒体转载请联系授权,circRNA@163.com


近期,IUBMB Life杂志邀请陈玲玲教授系统分析了我国非编码RNA研究的主要现状(Xing et al., 2016)。



改革开放三十多年来,我国经济建设取得了举世瞩目的巨大成就。作为国家核心竞争软实力的科学研究和工程技术水平也取得了巨大进步。陈玲玲教授在这篇综述文章中系统总结了我国非编码RNA领域的发展历程和我国科学家对非编码RNA研究的主要贡献。


作者首先统计了我国科学家在非编码RNA领域所发表的论文的总体情况(详见下表),从表中不难看出我国在非编码RNA研究领域的飞跃式发展过程。2000年以前,国内还没有一篇非编码RNA的SCI的研究论文,但2015年总数就高达656篇,占到了全世界非编码RNA研究总论文数的一半。高质量论文(IF>10)方面,2011年之前一直没有发表出来,而到了2015年就达到了18篇。从总体的情况来看,我国非编码RNA研究的体量增速惊人,但高质量论文的产出还相对偏弱。


表1 我国非编码RNA研究论文发表状况统计(来自(Xing et al., 2016))


接下来,作者分别介绍了主要我国科学家完成的重要非编码RNA研究成果:


lncRNA与细胞多能性和分化的关系

干细胞多能性维持及分化过程涉及到转录调控和表观遗传调控等多层次的精密调控机制,LncRNA在其中的一些调控回路中起到了重要作用。我国科学家在lncRNA与干细胞多能性和分化过程的调控作用机制的研究方面发表了一些重要的文章。山人以表格形式汇总如下:


表2 我国科学家在lncRNA与细胞多能性和分化的关系研究方面的主要贡献汇总(整理自(Xing et al., 2016))


lncRNA与肿瘤发生和迁移作用的关系

众多的研究表明lncRNA在肿瘤发生和转移的过程中扮演了非常重要的角色,我国科学家在lncRNA在癌症发生和迁移等作用机制的研究领域有众多重要的贡献,例如第二军医大学的孙树汉教授和周伟平教授在肝癌中lncRNA的一系列重要发现等等。

表3 我国科学家在lncRNA与肿瘤发生和迁移作用的关系研究方面的主要贡献汇总(整理自(Xing et al., 2016))


lncRNA与免疫细胞分化和功能的关系

我国一些科学家也报道发现了lncRNA与免疫细胞分化和功能有关,也发表了一系列有重要影响的学术成果。


表4 我国科学家在lncRNA与免疫细胞分化和功能的关系研究方面的主要贡献汇总(整理自(Xing et al., 2016))


植物lncRNA研究 

已有众多的我国科学家在植物研究领域中lncRNA相关的研究报道,这一领域发表的文章有数十篇,作者挑选了其中比较有代表性的进行大致汇总。


表5 我国科学家在植物lncRNA研究方面的主要贡献汇总 (整理自(Xing et al., 2016))


环状RNA研究 

我国科学家对环状RNA领域的贡献非常巨大,以陈玲玲和杨力教授为代表,发表了一系列重量级的环状RNA研究成果。


表6 我国科学家在环状RNA研究方面的主要贡献汇总 (整理自(Xing et al., 2016))


LncRNA数据库

早在2005年,中科院生物物理研究所构建了第一个非编码RNA的数据库NONCODE,目前的版本NONCODEv4收录了21,0831条lncRNA的记录(Liu et al., 2005; Xie et al., 2014)。中山大学赵海涛首次针对微阵列分析获得的LncRNA的功能进行了注释(Liao et al., 2011)。北京大学崔庆华开发的LncRNADisease数据库收集整理了疾病相关的lncRNA,目前共收录了480条记录,涉及166种人类疾病,并预测出了1564条疾病相关的lncRNA(Chen et al., 2013)。今年该团队在核酸研究杂志发表了预测疾病相关lncNA的软件工具:LncDisease(Wang et al., 2016a)。哈尔滨医科大学的Wu Qiong开发了一种新的准确性更高的预测发育相关的lncRNA的方法(Lv et al., 2013)。


看到这一系列的重大成果和骄人的成绩,山人热血沸腾,相信我国在非编码RNA以及其他科学技术领域的贡献将越来越多,越来越大。


参考文献点击查看原文。


近期热文


1

 单细胞测序表明单细胞circRNA

表达状态呈现高度异质性

2
 环状RNA常用数据库使用介绍
3  十月份环状RNA研究汇总


4

 陈玲玲课题组发现新型lncRNA

5
 探讨circRNA研究方法现状
6
 首个汇总编码蛋白环状RNA的数据库


长按二维码关注 circRNA 公众号传递最新研究进展|分享科研干货
长按二维码加入环状RNA QQ交流群分享研究技巧|经验交流平台



您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存