circRNA研究汇总（20190826|20190901）

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欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献19篇，下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。

1、环状RNA在约1000种人癌细胞系中的综合表征研究

论文标题：Comprehensive characterization of circular RNAs in ~ 1000 human cancer cell lines.

期刊：Genome Med  影响因子：10.886

通讯作者：韩冷教授 (德州大学休斯敦健康科学中心)

人癌细胞系是癌症研究和开发治疗策略的基本模型。然而，目前在许多癌细胞系中并没有表征环状RNA（circRNA）的数据。该研究中，研究者对CCLE（Cancer Cell Line Encyclopedia，癌症细胞系百科全书）数据库中的RNA-seq数据，应用四种circRNA识别算法分析了约1000种人癌细胞系中circRNA的表达谱特征，还综合分析探索不同癌症谱系中circRNA的表达情况，生物形成，细胞功能和药物反应等。研究结果揭示了circRNA在不同癌症细胞中具有高度特异性表达模式，表明circRNA可能是癌症治疗中强有力的诊断或预后标志物。研究者还通过实验鉴定了涉及circRNA生物形成的关键基因，证实TGF-β信号通路在该过程中起到重要作用。更引人注目的是，研究者发现一些癌症临床上常见基因上富集RNA结合蛋白（RBP），更可能产生circRNA。其中，circMYC可促进细胞增殖。我们观察到circRNA的表达与药物反应之间的强烈关联，特别是那些靶向染色质组蛋白乙酰化的药物。同时，该研究还开发了一个癌细胞系circRNA数据库——CircRiC（https：//hanlab.uth.edu/cRic），该数据库目前包含了来自CCLE的22个癌症谱系中935个癌细胞系中circRNA的表达特征、生物形成、药物应答和整合分析等数据，对circRNA研究提供了非常有意义的参考。

图注：circRic数据库主页 https://hanlab.uth.edu/cRic/

2、由环状RNA-AKT3编码的新型肿瘤抑制蛋白通过竞争性激活磷酸肌醇依赖性激酶-1抑制胶质母细胞瘤的致瘤性

论文标题：A novel tumor suppressor protein encoded by circular AKT3 RNA inhibits glioblastoma tumorigenicity by competing with active phosphoinositide-dependent Kinase-1

期刊：Mol Cancer. 影响因子：10.679

通讯作者：张弩副教授（中山大学附属第一医院）

RTK/PI3K/AKT信号通路在许多癌症（包括脑胶质瘤GBM）的发展和进展中起关键作用。丝氨酸/苏氨酸激酶Akt作为癌症调控分子和潜在的药物靶标，是目前研究的热点致癌基因。AKT包含三种亚型AKT1，AKT2和AKT3，但它们各自在GBM中的分子功能仍然存在争议。此外，尚不知道AKT是否存在更多的可变剪切体。该研究，首先采用高通量测序RNA-seq和定量PCR技术在GBM样品和成对正常组织中筛选和鉴定差异表达的circRNA。研究结果发现了AKT的一个新型可变剪切变体环状RNA——命名为Circ-AKT3。与GBM邻近正常脑组织中相比，Circ-AKT3在GBM组织中的表达水平更低。研究者进一步通过质谱、WB和免疫荧光等实验证实，Circ-AKT3利用重叠起始密码子可编码174个氨基酸（aa）的新蛋白——AKT3-174aa。GBM细胞中过表达AKT3-174aa，可抑制细胞增殖，抗辐射和体内致瘤能力，而敲低circ-AKT3后则增强了星形细胞瘤细胞的恶性表型。机制研究表明，AKT3-174aa与磷酸化PDK1竞争性相互作用，减少AKT-thr308磷酸化，并在调节PI3K/AKT信号强度中起负调节作用。该研究结果表明，GBM中，起源于AKT3基因的环状RNA，circAKT3表达降低，促进了GBM肿瘤发展，恢复AKT3-174aa同时抑制活化的AKT可抑制GBM细胞的恶性表型，该研究成果为GBM患者的治疗提供了新靶标和思路。

图注：Circ-AKT3编码一个174aa的全新蛋白AKT3-174aa

3、ERα介导的circ_0023642和miR-490-5p信号传导的改变抑制了膀胱癌的侵袭

论文标题：ERα-mediated alterations in circ_0023642 and miR-490-5p signaling suppress bladder cancer invasion.

期刊：Cell Death Dis  影响因子：5.959

通讯作者：欧臻宇和王龙（中南大学湘雅医院）

最近研究结果表明，膀胱癌（BCa）的发病率和预后存在明显的性别差异。雌激素受体α（ERα）在BCa中起保护作用。然而，ERα介导BCa进展的机制需要进一步阐明。在该研究中，研究者探索了ERα通过调节circRNA表达水平抑制BCa侵袭的机制。ERα通过降低circ_0023642的表达来抑制BCa侵袭。染色质免疫沉淀（ChIP）和荧光素酶实验测定显示ERα通过在转录水平调节UVRAG（circ_0023642的宿主基因）的表达来减少circ_0023642表达。ERα降低circ_0023642水平并随后增加miR-490-5p表达（Circ_0023642直接与miR-490-5p结合），miR-490-5p通过结合位于EGFR mRNA的3'-UTR中的miR-490-5p结合位点来调节EGFR表达，导致EGFR表达降低以抑制BCa细胞侵袭。体内小鼠模型的临床前研究也证实该ERα/circ_0023642/miR-490-5p/EGFR信号传导途径抑制BCa进展。因此，该研究发现的ERα，circ_0023642新的信号传导途径可以作为开发治疗BCa的新治疗策略的基础。

图注：ChIP和荧光素酶实验证实ERα调控circ_0023642表达。

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