circRNA研究汇总 | 20191230-0105

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索（收集最新发布的circRNA文献共计25篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式：circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract] 

1、环状RNA的准确定量及识别广泛的环状RNA可变剪切事件。

标题：Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform switching events.

杂志：Nature Communications

IF：11.878

通讯作者：赵方庆（中国科学院北京生命科学研究院）

环状RNA（circRNA）的检测和定量面临若干重大挑战，包括较高的错误发现率，rRNA去除和RNase R处理效率不均匀性，以及反向剪接读数可能被低估。该研究中，研究者提出了一种新颖的算法——CIRIquant，用于circRNA的精确定量和差异表达分析。通过构建伪circRNA参考组重新排列RNA-seq读段，并采用复杂的统计模型来纠正RNase R处理偏倚，CIRIquant可以为circRNA提供更准确的表达值，并显著降低错误发现率。研究者进一步开发了实施两种独立措施的一站式差异表达分析流程，有助于揭示circRNA及其线性对应转录本之间竞争性剪接的调控。CIRIquant在处理肝细胞癌的RNA-seq数据集中，可表征circRNA转录组及其对应线性转录组之间竞争性剪切关系，表明CIRIquant在探索肝脏肿瘤发生中广泛的转录组变化能力方面表现突出。

图注：CIRIquant分析流程示意图

2、大肠癌中外泌体传递的circRNA通过miR-122-PKM2轴促进糖酵解并诱导化疗抗性。

标题：Exosome-delivered circRNA promotes glycolysis to induce chemoresistance through the miR-122-PKM2 axis in colorectal cancer.

杂志：Molecular Oncology

IF：5.962

通讯作者：巴一 和 应国光（天津医科大学附属肿瘤医院）

大肠癌（CRC）及其其他恶性肿瘤通常依靠有氧糖酵解来产生ATP，以实现快速生长和化疗耐药性。丙酮酸激酶（PKM2）的M2同工酶在催化糖酵解中起关键作用，PKM2的表达甚至在同一肿瘤内也会发生变化。在这项研究中，研究者证实PKM2在CRC细胞中的表达是异质的，即在奥沙利铂抗性细胞中较高，而在敏感细胞中相对较低，并且发现化疗抗性细胞糖酵解和ATP产生增强。并且发现此为一种依赖PKM2的化疗耐药机制，通过该机制，化疗敏感性细胞可能逐渐转化为化疗抗性细胞。环状RNA hsa_circ_0005963（在该研究中称为ciRS-122），被确定为靶向PKM2的miRNA-122的海绵，与化疗抗性呈正相关。体外和体内研究表明，来自奥沙利铂抗性细胞的外泌体将ciRS-122传递至敏感细胞，从而通过海绵吸附miR-122和上调PKM2促进糖酵解和耐药性。此外，外泌体转运的si-ciRS-122可通过调节体内的ciRS-122-miR-122-PKM2途径抑制糖酵解并逆转CRC细胞对奥沙利铂的耐药性。源自化疗抗性CRC细胞的外泌体可以跨细胞转移ciRS-122并促进糖酵解，从而降低化疗敏感性细胞中的药物敏感性。这种细胞间信号传递暗示了潜在的新型治疗靶点，并为耐药性CRC的未来临床应用奠定了基础。

图注：小鼠尾静脉注射exo-si-ciRS-122可在体内导致SW480细胞对奥沙利铂（L-OHP）的敏感性。

3、环状RNA circSLC26A4通过miR-1287-5p / HOXA7轴加速宫颈癌的进展。

标题：Circular RNA circSLC26A4 Accelerates Cervical Cancer Progression via miR-1287-5p/HOXA7 Axis.

杂志：Molecular Therapy-nucleic Acids

IF：5.919

通讯作者：朱元方（暨南大学附属深圳市宝安区妇幼保健院）；罗新 （暨南大学附属第一医院妇产科）；丁岩（新疆医科大学第一附属医院）

该研究关注circRNA在宫颈癌中的作用及生物形成。研究者鉴定出一种新型的circRNA，circSLC26A4在宫颈癌组织和细胞中显著上调。在临床上，circSLC26A4的高表达与宫颈癌患者生存率低有关。细胞功能上，circSLC26A4敲低抑制了体外和体内宫颈癌细胞的增殖，侵袭和肿瘤生长。此外，circSLC26A4充当miR-1287-5p的海绵；而miR-1287-5p靶向HOXA7 mRNA的3'UTR。此外，RNA结合蛋白（RBP）——QKI被确定与SLC26A4基因内含子中的QKI反应元件（QREs）相互作用，从而促进circSLC26A4生物形成。这些发现表明，circSLC26A4通过QKI / circSLC26A4 / miR-1287-5p / HOXA7轴促进宫颈癌的进展，这可能为宫颈癌带来新的治疗策略。

图注：circSLC26A4通过QKI / circSLC26A4 / miR-1287-5p / HOXA7轴促进宫颈癌的进展示意图

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