olex2如何计算孔洞率(olex2和platon法)
olex2不仅可以解析结构,而且可以做简单的数据分析和绘图(氢键图文、氢键视频、pipi图文、pipi视频),对于MOF材料,还可以计算常用的孔洞率,除了olex2和palton,materitals studios也可以计算,可以后台回复MS获取软件,操作如下(有需要可以移步B站搜索BV1Mz41187Ua观看视频,或者观看公众号的视频):
1,首先介绍用olex2自带功能的操作:打开zif-8的cif(公众号后台回复数据5获取),点击tools-maps-calculate solvent accessible voids ,然后点击show void ,在左侧界面即出现孔洞率等参数;
2.如果想保存下来这些参数,按照之前的图文和视频,输入text,保存弹出的文本即可;
3.olex2可以调用platon来计算孔洞率,对于不想单独安装pwt的小伙伴可以将palton执行文件放到olex2文件夹,使olex2可以调用,有需要的可以后台回复olex2,下载免安装优化版olex2(自带shelx和palton,注意解压路径不要有中文,否则打不开);
4.点击tools-palton-solv mode(calc solv)调用palton,在弹出的palton界面显示孔洞率,在cif文件夹会出现palton.out的文本文件,右键记事本打开,则看到需要的参数,点击exit退出palton;
5.两种方法算出的孔洞率基本一致,可根据需要。
本文所用数据请公众号后台回复数据5获取,感谢公众号@MOF铭铭 B站@Mof-铭铭 大佬的帮助。
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