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学习工具 | 详解如何用Zotero高效梳理文献

沈劼 六把铲 2023-09-19
There is no more dreadful punishment than futile and hopeless labor.
-The Myth of Sisyphus, Camus

最近开始着手读文献,并且从头开始建立了一套自己的文献管理体系。说实话,怎么整理好文献是一个从大一开始就困扰我的问题,从最基础的电脑文件夹分类+手写笔记、到百度云盘存档+印象笔记,再到用NoteExpress,再到Onenote,中间走的弯路太多了。到了大四我才开始用文献管理软件,硕士结束了才勉强会用,最近才刚摸索出一套比较有效率而且可以长期使用的方法。
我已经浪费了那么多时间和精力,但仍然有很多人还在和我一样从头摸索着这一切,所以我这篇推送,是希望能省掉大家一些时间。我会主要介绍怎么利用Zotero这个文献管理软件,建立一套包括搜集文献、读文献记笔记、到输出论文参考文献的流程。即使是使用别的文献管理软件, 比如NoteExpress或者Endnote的人,也可以借鉴这个思路优化自己的文献管理。
这篇文章主要面向本科生和刚开始读硕博的朋友们,再往上大家可能都已经有自己的一套熟悉顺手的方法了,没必要再重头适应新的学习流程。以及,这一套东西对刚接触文献管理软件的人可能会稍显繁琐,但是差生文具多磨刀不误砍柴工,跟随我这篇介绍用最多两个小时设置好一切,能大大提高之后的学习效率。

这篇文章比较长,目录如下:
 三位一体:文献原文,引文和阅读笔记
1.1是什么和为什么:文献管理软件
1.2 常用的文献管理软件
Zotero基础设置
2.1 账号注册和文件夹存放地址
2.2 安装浏览器插件和Word插件
2.3 替换translator文件和安装各种便利插件
2.4 设置英文文献下载路径
 Zotero为中心的文献梳理
3.1导入引文和原文文件
3.2 阅读笔记
3.3 利用Tag做简要分类
3.4 记录关联文献
3.5 输出自己观点及输入引文


已经知道了文献管理软件并打算试用Zotero的可以直接看第二节,已经有了熟悉的文献管理软件只想看看我怎么用的人可以直接看第三节,还什么都不懂的就从头开始看。

一 三位一体:文献原文,引文和阅读笔记
1.1 是什么和为什么:文献管理软件
首先我要谈一下,文献管理是个怎么回事。常见的笔记类型的课堂笔记,成体系有框架,而且也不需要知道每一个知识点的原文出处,只要记录下老师所讲的内容就可以了。但是在进行自己研究或者写论文的时候,笔记是完全不同的。这时候需要自己读文献、记录重点、找到逻辑,自己建立一套框架将看到的东西放进去,以便之后输出为论文。
这个阅读、整理和输出的过程,包含了三个要素:文献的原文(一般是pdf格式),文献的引文(按照规定格式书写的文献来源信息),和自己的阅读笔记。(例子见下图)

如果按照最原始的方法,在电脑文件夹里分类放文献,直接在pdf上记笔记或者单独开一个笔记软件记笔记,最后写论文的时候手打引文,不仅需要三个App同时协作,增加了切换界面的麻烦,而且也不方便查阅,还要手打引文。特别是遇到一个遗址有好几个报告和研究论文的情况,就更难协调所有的东西了。

所以文献管理软件就是用来帮助我们把所需的文献、引文信息和笔记都放在同一个软件里,以便之后随时可以调阅所需信息,特别是在写论文的时候,能够快速找到自己所记的笔记和对应引用的文献。此外,写论文的时候需要按照规定格式标明文献的出处,也就是列在参考文献这一节中的“引文”。自己手打每一条引文费时费力,还容易打错字,文献管理软件可以将文献的信息拆分,分别记录一条文献的标题、作者、发表日期、期刊名称、出版社等条目。然后根据自己学位论文的要求或者要投的期刊的要求,选择一个引文格式,软件就会自动按照格式一键生成所有的引文。,即使之后要改格式,也是在软件里设置好,就可以一键全部修改。

1.2 常用的文献管理软件
一般来说,文献管理软件都会有以下几个最基础的功能:从各种中外数据库(如知网、Springer等)导入引文信息,如果有图书馆账号权限的话还可以顺便下载pdf;分文件夹管理不同Topic的引文(下图红框);按发表时间或标题或作者排序所有的引文(黄框);显示每条引文的基础信息,如标题、作者、摘要、期刊名、发表时间等(蓝框);以及每条引文下链接对应的pdf和笔记(绿框)。

目前中文文献最常用的是NoteExpress,美国比较常见的是Endnote和Zotero。比较不同软件优缺点的帖子在知乎和微信都有很多,我就不重复了,只简单说一下我偏好Zotero的原因:
  • 因为Zotero对中英双语的引文支持率都比较好,虽然中文管理不如NoteExpress,但是对需要同时接触中英文文献、以及之后有出国考虑的人来说,从长期收益来看Zotero是更好的选择。

  • 在大部分文献管理软件都收费的情况下,Zotero是全免费的。即使毕业失去了学校图书馆提供的免费账号,Zotero还能免费使用。

  • Zotero只要设置好了,就没有容量限制,不像别的软件还会限制引文数量或者储存的文件大小。

  • Zotero是开源软件,也就是说除了它提供的基本功能,还可以通过安装别人写的插件来增加新的功能。

  • Zotero的界面真的比Endnote和NoteExpress好看很多...


二 Zotero基础设置
Zotero的基础设置流程已经有很多人写过了,而且写得很细致,所以我就不细写了,找了几个比较好的教程放在这。

2.1 账号注册和文件夹存放地址
要注意的是Zotero里保存的所有引文、文献原文和笔记都是可以上传云端的,任何一台电脑只要登录你的账号都可以继续使用之前已保存的数据。但是Zotero提供的云端储存空间有限,所有需要更改一下文件夹储存的地址,将之改存到网盘或者移动硬盘上。如果使用网盘,则只要在新的设备上登录网盘就可以接着无限使用Zotero,使用硬盘就随身带着硬盘即插即用。
国内网盘一般使用坚果云,我因为有学校提供的免费帐户所以用的是Onedrive。
下载、注册账号和登录,以及链接坚果云的操作步骤都可以看这篇文章里的傻瓜教程的一—三:
Zotero 5.0使用教程/坚果云同步盘和Zotero的配置过程详解
如果不行就康康这一篇:
Zotero | 用坚果云无限扩展文献存储空间

如果是选择储存在硬盘或者Onedrive的,只需要将安装后的Zoteoro文件夹整体复制到硬盘或者Onedrive里,再回到Zotero点击【编辑】-【首选项】-【高级】-【文件和文件夹】-【数据储存位置】,将下图所示的数据储存位置更改为【自定义】,并输入新文件夹所在的位置即可:
更改之后重启软件,确认正常运行后即可将老文夹件删掉。

2.2 安装浏览器插件和Word插件
浏览器插件是在打开数据库内某一本书或者文章的页面时,Zotero可以自动抓取文献信息以及pdf文件,然后导入。
Zotero官方支持Chrome、Firefox、Safari和Microsoft  Edge的插件,使用别的浏览器的朋友可以自行百度对应的插件安装。以Chrome为例,打开知网搜索一篇文献,在文献页面右上角点击已经变成了一篇论文icon的Zotero插件(红框,如果是书会变成书的icon),点击后会保存到你选的文件夹内,然后下面有一行灰色字样的PDF(绿框),表示正在下载PDF,这时候不用关闭浏览器,等字样变成黑色(黄框),下载结束后再关闭。

Word插件则是用来写作时插入引文,然后一键生成参考文献。进入【首选项】-【引用】-【文字处理软件】安装加载项【Microsoft Word】或【LibreOffice】。

2.3 替换translator文件和安装各种便利插件
由于Zotero本身是英文语言环境下开发的软件,对中文文献的抓取不是太好,会有浏览器插件抓取不到的情况。但是幸好是个开源软件,换成更新后的文件后就可以。
用于替换的translator文件我放在网盘里,替换一下 Zotero 文件夹里 translator 文件夹里的同名文件即可:
链接:

https://pan.baidu.com/s/1eHA6O1zrWj36Svfo871SLg

提取码:j2ng


常用的插件文件及安装方式可见这篇指南的 2.2.2 插件:Zotero插件环境配置
Echo | Zotero——科研小白的第一款文献管理软件
Jasminum和ZotFile这两个插件的最新版我也放在上面那个网盘里了,可以自取。

2.4 设置英文文献下载路径
对一些毕业后失去了学校图书馆权限,或者学校图书馆对英文文献买得不全的朋友,可以选择设置让Zotero自动从Sci-Hub(最大的外文文献免费下载平台)下载pdf。这个方法摘自 :
How to configure Zotero to retrieve Publication’s PDF from Sci-Hub automatically 
(https://gagarine.medium.com/use-sci-hub-with-zotero-as-a-fall-back-pdf-resolver-cf139eb2cea7) 一文。
首先点击【编辑】-【首选项】-【高级】-【高级设置】-【设置编辑器】-【确认】:
然后在搜索栏输入:
extensions.zotero.findPDFs.resolvers
出现对应的编辑器后,右键-【Modify】-复制下面的代码后输入到跳出的框里:
{
   "name":"Sci-Hub",
   "method":"GET",
   "url":"
https://sci-hub.se/{doi}",
   "mode":"html",
   "selector":"#pdf",
   "attribute":"src",
   "automatic":true
}


点击【OK】后就完成了,不需要重启Zotero。

三 以Zotero为中心的文献梳理
3.1 导入引文和原文文件
一般来说,学习总是始于下载一大堆相关文献,然后边看边根据自己需要进行增减。Zotero提供多种导入方式:
  • 可以直接往Zotero内拖入下载好的pdf(但是需要是知网等正规数据库下载的),然后Zotero会自动识别引文信息,生成对应的引文。

  • 可以用浏览器打开自己想要的文献,然后利用浏览器插件同时下载引文和pdf文件。

  • 可以从各种数据库或者别人手里要来 ris. 或者 BibTex 或者 endnote格式的引文数据,然后导入Zotero内,再利用Zotero自动找到对应的pdf。

  • 当手握来源不明或者自己扫描的书籍章节时,由于Zotero无法识别这类不太正规的文件,就只能用最基本的操作:自己手动输入引文信息,然后将对应pdf拖入那一条引文。


中文文献详细的操作方式可见这篇文章的 3.2 下载论文:
Echo | Zotero——科研小白的第一款文献管理软件
以知网为例,搜索关键词“二里头”,然后点击右上角红框处已经变成文件夹形态的Zotero插件,就可以选择想要的文献进行导入,pdf也会同时下载。

外文文献以哈佛图书馆检索系统Hollis为例(这个系统的好用之处详见 生产力工具 | 一些学习和论文写作用得上的网站)。搜索关键词“Bone artefacts”,同理点击右上角红框处已经变成文件夹形态的Zotero插件,就可以选择想要的文献进行导入,pdf也会同时从sci-hub进行下载。

3.2 阅读笔记
三大要素之二的引文和pdf都有了,就差我们阅读之后的笔记了。记笔记的方式因人而异,有的人直接在pdf上标注,有的人倾向于手写,也有的喜欢打字。但是正如我一直强调的记笔记理念,笔记一定要是方便检索和查看的。所以我个人推荐利用Zotero的笔记功能,每一条引文都可以在右侧边栏找到笔记栏,然后随意增添笔记。

笔记栏里有基本的编辑器,也可以粘贴图片,能够进行简单的排版。还可以选择下方的打开浮动编辑窗口,边看文献边写笔记。笔记内容可以在Zotero的搜索栏里进行搜索,所以不用担心自己忘了记过的东西分别都在哪篇引文里。
我记笔记不会记得太细,特别是早期看综述的时候,一般是大致记一下主要论点或者重点的遗迹遗物,之后写作的时候再根据需要来回看。

如果习惯在pdf里高亮标注重点,可以试用提取笔记这个功能,这个功能需要安装Zotfile后才能使用(见本文2.3)。在pdf里标注完成后保存,然后右键引文-【Manage Attachments】-【Extract Annotation】,Zotero就会自动生成一个包含你所有高亮过的文字信息的笔记。


3.3 利用Tag做简要分类
给文献标Tag以便迅速归类讨论相同东西的文献是大部分文献管理软件都可以做到的。Zotero的Tag都显示在窗口左下角,点击就会显示所有有这个Tag的引文,还可以同时选中多个Tag作交叉检索。
除了用关键词标Tag,我最近摸索出了用Tag来注明文献重要性的方法。很多时候我会发现自己下的文献和想研究的东西并没有相关性,但是如果直接删掉,之后又可能忘了这回事重新下载又看一遍。但如果不删,文件夹里鱼龙混杂,最后很难迅速找出对自己有用的文献。所以需要一个Tag来标明文献的重要性。首先创建五个Tag,分别是*,**,***,****,*****,星号从少到多表示文献和我的研究的相关性从低到高。右键一个Tag,可以给它指派颜色和快捷键,选择的颜色会显示在有这个Tag的引文标题前。

所以在用五个不同颜色的Tag标注了已经看过的文献的重要性之后,就可以一目了然地知道自己看过哪些,哪些有用哪些无用了。我也会专门用一个Tag“已查参考文献”来表示这篇文章的参考文献我都搜齐了,这一点在初期文献搜集阶段非常有用。

3.4 记录关联文献
在右侧边栏的【关联文献】栏里,可以选择与这篇引文相关的文献链接起来。比如可以把一个遗址所有的简报和报告互相关联,或者某项研究相关的研究文章与报告相关联。

3.5 输出自己观点及输入引文
怎么从茫茫多的文献和笔记里找出一条思路写自己的东西,我其实还没有太好的方法,之前硕士论文写完的时候大致有了一些尝试:硕士论文写作回顾-一点经验分享和反思,有兴趣的可以看一下。

在word中插入引文的流程,在下面这三个帖子里写得很详细,我就不班门弄斧地重写了。请见:
【Zotero文档翻译】引用篇:使用Word插件(上):
https://zhuanlan.zhihu.com/p/164842311
【Zotero文档翻译】引用篇:使用Word插件(中):
https://zhuanlan.zhihu.com/p/165635623
【Zotero文档翻译】引用篇:使用Word插件(下):
https://zhuanlan.zhihu.com/p/165944254

文献以外的记笔记方式,可以参看这一篇 【学习工具】考古学生怎么使用笔记软件提升学习效率希望我分享的这些tips能给大家节约一点时间和精力吧,如果有什么梳理文献的方法和Zotero使用小技巧之类的,欢迎后台和我交流。

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