核酸质量检测——微量分分光光度法
微量紫外分光光度法
检测原理
微量紫外分光光度法检测的是核酸的纯度和含量,DNA和RNA在260nm处有最大的吸收峰,蛋白质在280nm处有最大的吸收峰,盐和小分子则集中在230nm处。因此,可以用260nm波长的吸光度测定DNA或RNA浓度,其吸收强度与DNA和RNA的浓度成正比。
对于一个核酸样品,建议先电泳检测,再用紫外分光光度仪检测,电泳可以判断样品是否提取成功,以确认是否还需进行纯度和浓度测定。
核酸浓度计算
针对不同类型的核酸,其浓度的计算方法也并不相同:
dSDNA = 50 × (A260-A310) × 稀释倍数 (ng/μL)
ssDNA = 33 × (A260-A310) × 稀释倍数 (ng/μL)
RNA = 40 × (A260-A310) × 稀释倍数 (ng/μL)
检测过程
以IMPLEN生产的新产品NanoPhotometer N60为例介绍测定核酸浓度的具体过程。
选择检测模式
开机后,系统会自动进入上述界面,点击核酸浓度测定,进入核酸浓度测定界面。
进入核酸浓度测定界面后,点击左侧栏中的dsDNA,在右侧栏中选择待测样品的类型,之后点击最左侧的第一个图标进入样品测定界面。
校准和上样
首先在上样孔处点入1.5μL无菌水,注意点样时不要有气泡残留,扣上样品盖之后,点击页面中的空白,对仪器进行校准。
校准完成之后,应用擦镜纸将无菌水擦干净,之后点入1.5μL待测样品,扣上样品盖之后,点击页面中的样品,对待测样品进行核酸浓度和纯度的测定。
结果获得
上图为最后测得的结果,左侧的曲线为核酸在不同波长下的吸光度,纯的核酸的吸光值,在A230是谷底,在A260是峰顶,在A280则正好是半山坡。
右侧栏为核酸的浓度和纯度信息,当核酸纯度与理想值之间有差别时,仪器会自动表示为黄色感叹号,点击该处,即可给出可能的原因。
核酸纯度评估
双链DNA纯品的A260/A280为1.8,RNA纯品的A260/A280为2.0,故根据A260/A280的值可以估计DNA的纯度。
合格的双链DNA的A260/A280应在1.7~1.9之间,若比值较高说明提取的DNA中有RNA残留,若比值较低说明有蛋白质残留。
合格的RNA的A260/A280应为1.9-2.1之间,如果小于1.8,则表明提取的RNA中蛋白质杂质较多,如大于2.2,则表明RNA发生了降解。
基本分子生物学实验系列
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