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【6月8日】PAG Asia 纳米孔测序讲座:弥合植物和动物基因组中的缺口

OxfordNanopore 2019-12-12



时间:2019年6月8日(星期六)下午14:00-15:45


地点:深圳福田香格里拉酒店的Grand Ballroom3


主题:弥合植物和动物基因组中的缺口


演讲嘉宾:

  • 杨林峰 研发总监 华大科技

  • 周钢 研发总监/项目总监 百迈客生物科技

  • Min Sung Park 希望组研究院院长,希望组/未来组


报名方式:扫描下方二维码,免费参加




在已知的40万植物物种中,仅有 225个物种(0.06%)进行了基因组测序,主要原因在于植物基因组的大小和复杂性使得很难使用传统技术对其进行测序。动物基因组学研究是进行动物遗传资源保护和利用以及分子育种的一项重要基础工作,然而传统技术要求用户对短长度DNA进行测序,然后必须尽可能准确地将DNA重新组装回原来的顺序,这样的短读长测序技术带来了若干挑战,特别是难以准确分析重复区域和大型结构变异。


纳米孔测序常规可处理数千kb的完整片段,超长片段测序目前已超过2Mb读长,因此简化了基因组的组装过程,能够弥合短读长测序在重复区域和结构变异分析上的缺口,且已经被来自中国和全世界的科学家们成功应用于不同的动植物基因组的研究领域中。已有研究者们仅用4天,不到一千美元便获得了比现有金标准更连续的拟南芥(Arabidopsis thaliana)基因组组装。



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参考文献:

Michael, T.P. et al. 2018.Nat Commun. 9(1):541.




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