纳米孔测序夏季突破 | 紧随最新信息
在我们为2019年剩余时期的繁忙工作做准备之际，中国Nanopore Tech Tour启程在即，我们利用片刻闲暇回顾了纳米孔社区在过去几个月里取得的惊人进展。
划重点
纳米孔社区的科学家们近期发表了数个高影响力的文章，本文列出了一部分与君共赏，您可以访问我们网站的资源中心阅读更多文献：
有多少人类基因组是完整的？自16年前完成了人类基因组计划以后，Karen Miga和他的团队发布了首个零间隙人类染色体组装过程。(doi: https://doi.org/10.1101/735928)
Shafin等人在短短9天内用一台PromethION对11个人类基因组进行了测序和组装。利用Canu和Wtdbg2组装工具，测量了1个重叠群中高度重复和多态的MHC区域。(doi: https://doi.org/10.1101/715722)
Soren Karst和他的团队在预印稿中发表了他们的方法，即采用单分子标签测量长扩增子，在长为4.4 kb的rRNA操纵子上，错误率为0.03%。(doi: https://doi.org/10.1101/645903)
事实证明，Burns等人开发的纳米孔三合一筛选试验/CLL综合筛选试验结果准确、测试迅速，且成本低。利用一个MinION测序芯片在5天内表征CLL，对此所需的信息在工作流程中给出。(doi: https://doi.org/10.1101/750059)
O’Grady和他的团队证明可在6小时内迅速表征细菌性下呼吸道感染，其特异性和敏感性达到了100%。
主要介绍Flongle的首篇出版文章表示，能够以较低的成本快速准确地鉴定序列同源性高于99.7%的人肠道病毒的基因型，而每份样本的费用不到10美元。(doi: https://doi.org/10.3390/genes10090659)
您可能也有兴趣阅读《自然-方法》中的这篇综述，文中探索了纳米孔技术用户的工作情况，以及纳米孔社区取得的突破。
如果您选择观看而非阅读，那么可登陆纳米孔社区观看Ghamdan Al-Eryani的网络讲座，了解他在开发和开展的单细胞技术，以了解免疫系统对抗癌症的方式。
测序芯片的新记录：MinION和PromethION
7月，单个MinION测序芯片创下了最新的记录，高达43Gb。Soren Karst博士成功夺冠，他用SQK-LSK109制备的扩增子（约5000 bp）产生了43Gb的数据量，并在单个R9.4测序芯片上运行了2 x 48个小时。R10现已上市，我们期待着在不久后再次刷新记录。
添加了核酸酶清洗这一工作流程后，有许多用户从中受益，可见测序芯片的通量有所提高。我们将推出一款新型芯片清洗试剂盒，在核酸酶清洗工序中满足您的全部需求——请密切关注！
同时，北京希望组从单个PromethION测序芯片中获得的数据量高于180Gb——这是测序深度约为60倍的长读长人类基因组，包含甲基化信息。
以上采用的工具为PromethION 48，目前正在出售，它在72小时内产生的数据量可达7Tb以上。每个PromethION测序芯片的数据量为100Gb，这相当于在短短3天的测序期间，50个人类基因组的覆盖度达到30倍。
纳米孔总部发布的最新信息
我们的新型高科技生产设施MinION工厂于7月上线，专为生产测序芯片提供新型高度自动化生产工艺。在未来几个月内，该大楼将逐步落实全面的、端到端的生产，并且将大幅度提升生产能力，测序芯片的年生产量将在4-5年内超过1亿。
GridION MK1性能提升，无额外成本。GridION Mk1采用了GPU尖端技术，以Nvidia Volta GV100显卡为架构，其性能比GridION X5提升了一个数量级。这表示碱基识别只需占用10%的GPU资源，剩下的90%可用于额外的分析。
根据有关碱基识别的新闻，Guppy升级意味着您现在可以以常规标准免费鉴定5mC CpG甲基化，dcm甲基化和dam甲基化。你也可以训练软件进行其它甲基化的识别。
我们马上将在北京和上海举办首届Nanopore Tech Tour 。我们邀请了优秀的演讲嘉宾，并且筹划了现场产品演示、面对面专家教学和动手实践的会议日程。我们希望您能在接下来的几天内获得对纳米孔测序更深刻的见解；我们也期待着了解各位科学家最新的纳米孔研究情况。鉴于最近的交通管制，请北京场的参会代表们提前规划到达会场的行程。
我们的目标：
使任何人，在任何地点，
能对任何生物进行分析。
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