【8.29】在线研讨会：与Nature子刊作者探讨单细胞纳米孔测序如何提高癌症免疫细胞的识别

免疫细胞在疾病的发展中起着关键作用，然而识别癌细胞的免疫细胞通常很少见，必须对这些免疫细胞进行分类才能找到他们，目前传统的短读长测序技术无法在同一时间内对肿瘤组织中成千上万的细胞进行测序和分类。

澳大利亚加文研究所的研究人员开发出一种结合纳米孔长读长进行全长转录本的靶向高通量测序方法：RAGE-Seq，该方法能够表征体细胞超突变、可变剪接、淋巴细胞的克隆进化以及扩增克隆的基因表达特征。《Nature Communications》今年7月刊登了该研究成果。

点击查看Nature 子刊 | 新RNA单细胞测序法：结合纳米孔全长转录本准确灵敏识别全长抗原受体序列。

Oxford Nanopore Technologies邀请该文章的共同作者Ghamdan Al-Eryani为大家带来一场在线研讨会，分享他在开发纳米孔单细胞测序技术方面的经验。

研讨会主题：利用单细胞纳米孔测序高通量多元化分析癌症细胞的多样性

研讨会时间：北京时间2019年8月29日23：00

演讲嘉宾：Ghamdan Al-Eryani  澳大利亚加文医学研究所

研讨会摘要

Ghamdan Al-Eryani将详细介绍RAGE-Seq的进阶版：RAGE-Seq2.0，现在也叫MUSE-Seq。他将重点介绍几个有所显著改善的地方：如通过利用信号空间进行条形码拆分以显著提高产量，同时减少错误的细胞条形码分配。在具有100+CITE-Seq标记的样品上通过验证，其本质上表征了免疫反应重要调节剂——T细胞亚群的CD45异构体剪接。

此外，Ghamdan还将展示MUSE-Seq如何在没有靶向富集的情况下，利用全长异构体和准确度的提高来追踪癌症细胞的动态，介绍他及团队使用宏组装来优化de novo 共有序列策略。他们将利用MUSE-Seq进行更多感兴趣的基因研究。

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